Le Professeur Jordan dirige une expédition archéologique avec Eve, Jill, Fred et Scott, son fils. Ils embarquent à bord du navire le "Ben Wallace" et doivent emprunter un itinéraire proche du Triangle des Bermudes. Mais un étrange nuage vert s'abat sur le mer et sur l'équipage. Dans un éclair aveuglant, le bateau disparaît et les passagers, légèrement blessés mais vivants, se retrouvent sur une plage inconnue. Le nuage toujours présent, la petite équipe pénètre dans l'île et rencontre alors un homme étrange...

Les voyageurs parviennent à atteindre la cité d'Atlantium. On leur révèle qu'il existe une machine à l'intérieur de la ville qui pourrait les aider à retourner dans leur époque.

Varian, Scott, Fred et Liana sont brutalement recouverts d'un étrange nuage rouge. Ils se réveillent dans une région marécageuse et brumeuse et sont immédiatement fait prisonniers par de curieuses créatures, les Varusians. Varian, Scott et Fred retrouvent la trace de Jonathan Willaway, un scientifique disparu depuis de nombreuses années...

Les voyageurs entrent dans une zone-temps où ils découvrent près d'un temple grec un enfant blessé et terrorisé appelé Sigma. Au cours de la nuit, le garçon s'enfuit discrètement. Scott le suit mais les deux garçons se font enlever par un groupe de garçons plus âgés. Ces derniers les amènent face aux leaders de la République des enfants...

Un dictateur extraterrestre, Tarant, prévoit d'envahir d'autres zones-temps et de conquérir l'île. Willoway prétend être d'accord avec lui pour qu'il puisse apprendre les secrets de Tarant, d'autant plus que le véritable leader de cette communauté extraterrestre est lentement empoisonné par le futur dictateur. Pendant ce temps, Liana a pitié d'une créature à fourrure maltraitée, le Nefring.

Nos voyageurs campent près d'un volcan. Eveillé par de la musique, Varian se laisse guider et se trouve en présence de la belle Gwenith, dont il tombe amoureux. Varian souhaite l'épouser. La grande prêtresse Maera et le poète Zaros se chargent de l'organisation des cérémonies d'usage.

Nos voyageurs pénètrent dans une autre zone-temps et y aperçoivent un décor de fête foraine. Mal à l'aise, Willaway s'en approche et se trouve confronté à Apollonius, un étrange magicien.

Alors qu'ils ont pénétré dans une autre zone-temps, les voyageurs perdent le contact avec Liana. Ils tentent alors de la retrouver dans la ville où elle est retenue prisonnière. Ils sont accueillis par King Morgan, le roi de la cité de Coriel, où les femmes sont des esclaves. Un ordinateur central contrôle la cité et sa maintenance est assurée par Adrea.

Guidés dans une vieille maison par un mystérieux messager à cheval, les voyageurs - moins Liana - recherchent un objet qui les aidera à retrouver Evoland, et un couple étrange évoque des illusions tirées de leurs peurs les plus profondes.