Fünf Jahre nach dem ihre Eltern sich aufmachten, um Hilfe zu suchen, stoßen Taylor und Hayley auf einen Jaeger. Dieser lockt jedoch die Kaiju in ihr Dorf.

Taylor und Hayley suchen in einer nahegelegenen, zerstörten Stadt nach Energiezellen für Atlas Destroyer und machen dort überraschende Entdeckungen.

Taylor, Hayley und Boy stoßen auf eine mobile Siedlung, die mit Körperteilen der Kaiju handelt und deren zwielichtiger Anführer unbedingt ihr Geheimnis lüften will.

Als sich ein Kaiju nähert, zwingt Shane Taylor dazu, zusammen mit Mei Atlas Destroyer zum steuern, um zu entkommen. Doch Taylor will lieber kämpfen.

Um Atlas Destroyer zurückzugewinnen und Hayley und Boy zum retten, wagt Taylor ein riskantes Manöver. Joel und Mei treffen eine tödliche Entscheidung.

Boys Vergangenheit wird noch rätselhafter, als Taylor und Hayley ihn an einem Schauplatz der Zerstörung an der Seite des dafür verantwortlichen Wesens vorfinden.