Všeumělové Jun a Haberu pátrají po tom, odkud se bere hudba, která se line z prázdné vily. Její zdroj sice objeví nedaleko, ale tu samou písničku slyší i Mei.
Jun, Goro a jejich robot Jet Jaguar se střetnou s Rodanem, nepřátelským „kaidžú“ připomínajícím pterosaura. Mei jede do Tokia, kde se má setkat se slavnou vědkyní.
Jun a Haberu přijdou na to, že invaze Rodanů může souviset s observatoří Misakjóku. Mei v Dubaji navštíví přednášku profesorky Li, která představí nový materiál.
Obrovský kaidžú, který pronásleduje skupinu Mand, se přižene na Tokio. Mei s profesorkou Li cestují do Londýna, ale rudý prach odkloní jejich let na Milán.
Pozemní jednotky pod velením Macubary zareagují na Godzillin útok na Tokio. Mei, která mezitím dorazila do Londýna, se snaží rozluštit výzkum profesora Ašihary.
Godzilla se blíží k Tokiu a celé město zahaluje do rudého prachu. Parta z Otaki spěchá na pomoc někomu, koho lapil do pasti kaidžú připomínající pavouka.
Mei se dozví o silném výbuchu, který kdysi dávno způsobila Ašiharova kalkulačka. Kanoko dá Macubarovi ortogonální diagonalizér, aby ho použil proti Godzille.