捕頭佟林助雲翼山莊莊主雲鵬擊退馬賊，馬賊欲捉有通靈眼的鵬女小雀兒，卻誤捉大夫麥青山之女麥玉芝，欲以她交換雀，幸林將她救回。相士瀟湘女被殺，客棧少掌櫃海棠懷疑此案與鵬有關。山驗出女腳底有青斑，卻隱瞞林。

佟林發現瀟湘女腳底的青斑，並得悉雲夫人表妹銀娃曾請麥青山診病，她死時腳底亦有青斑。林從女腳底抽出毒針，並查出此針法為針灸術的秘技「金蛇探穴」。麥玉芝獲老師賈盈煙相告，芝母死時腳底亦有青斑，芝大感震驚。

麥玉芝向麥青山追問母親的死因，父女不歡而散。山找賈盈煙算帳，更打傷對方，煙憤而向知縣胡原狀告山殺害妻子華倩如。仵作刁五門開棺後找出如的腳骨中確插有金針，故他向山勒索，卻被捕快雷大力發現，遂劫走其銀両。

麥青山成為殺人疑兇，被帶返衙門調查。麥玉芝答應雲鵬往其山莊雕玉像，芝借機調查銀娃之死因。鵬妻柳若水遺失寶貴的珍珠衫，原來鵬偷偷把衫借予情人金蘭花。芝於山莊發現疑是佟林妻子曹翠鶯遺下的琴，不禁大感驚訝。

麥玉芝追問下人，懷疑曹翠鶯曾於山莊暫住。佟林發覺瀟湘女房中充斥龍涎香香味，若找到雲鵬沾有此香的衣物，便可證明他曾於兇案現場出現。麥青山拒絕作供，林欲取走他診症之處方，芝怕山被入罪而將之撕毁，與林鬧翻。

麥玉芝來向佟林道歉，時雲鵬因被林調查而派人教訓他，林分心失手被打。林往山莊使計懲處施襲的人，並找到曹翠鶯的畫像；其後林向胡原申請搜查山莊時，鵬受馬賊偷襲，林聞訊趕往，馬賊撤退，林藉詞欲帶鵬回衙門查問。

雲鵬拒絕回衙門，與佟林大打出手，胡原趕來阻止並讓鵬離去。林夜探山莊，找到鵬的針灸秘笈，惜未能將它帶走。林回至家中，鵬卻在恭候欲收買林，林不為所動。麥玉芝心緒不寧，鵬藉詞帶她外遊，柳若水得悉後妒火中燒。

柳若水將曹翠鶯的琴交還予佟林，雲鵬與林狹路相逢，兩人為奪琴而打鬥起來。林成功取回琴，並暗託麥玉芝找出鵬的針灸秘笈。水為芝與鵬爭吵，芝欲離去，於是鵬帶她參觀其密室，芝看見內藏著自己過往的雕件，大受感動。

佟林查到針灸秘笈的事情，懷疑雲鵬懂得施「金蛇探穴」的針法，麥玉芝卻不相信鵬是兇手。時欽犯燕勁腕兒突然現身古北口，暗中與林等好友聯絡，似圖謀大事。芝終完成觀音玉像，鵬舉行開光大典宴客，林欲趁機搜索秘笈。

金蘭花跟隨喬裝鷹馬王子的燕勁腕兒赴雲鵬之宴，花以兩人之事作脅，要鵬將珍珠衫送予她，鵬氣憤將她留下離去，其後花失去影蹤。佟林訛傳馬賊來襲，趁機搜索針灸秘笈，豈料弄假成真，小雀兒被馬賊捉去，幸林成功救人。

金蘭花的屍體被發現，其頸為利斧所襲，腳底被施以「金蛇探穴」，麥青山洗脫嫌疑獲釋。佟林夜探山莊重遇燕勁腕兒，得悉勁腕兒欲向雲鵬騙財，資助將軍趙無忌起義，勁腕兒更發現了殺花之兇器。麥玉芝為了鵬與山起爭執。

雲鵬成為疑兇，麥玉芝內心煎熬。佟林要胡原簽票拘捕鵬，鵬得悉海棠等人將作證人指證他，於是收買捕快程咬銀騙棠往山莊。鵬揭穿燕勁腕兒的身份，與棠一同被擒。原勸林罷手離去，林不允，原竟棄官而逃，林中途截獲。

雲鵬往找麥玉芝，願為她放棄一切與她離開，佟林竭力阻止，情急下向芝透露內心情意。燕勁腕兒試探雲川，得悉川並非兇手。鵬對方兒施以「金蛇探穴」，柳若水害怕鵬而逃往找林。鵬聽聞芝欲削髮為尼，他隨即趕往阻止。

雲鵬中伏被佟林拘捕。麥玉芝追問林的心意，林不敢承認。小青回復聲線，方兒經鵬施針亦康復，林向兩人問話後感兇案別有內情。鵬侄雲勇暗殺林失敗後自盡，時柳若水指出勇是殺金蘭花之兇手。林找鵬，鵬卻承認所有罪行。

雲鵬一力承擔曹翠鶯等多宗血案，佟林並不相信，還對柳若水起疑。麥玉芝得悉小雀兒並無通靈眼，原來一切皆為水之騙局。林往山莊找水，卻被她以毒針偷襲，幸逃脫獲麥青山父女相救。芝勸水自首，水對殺人的事直認不諱。

（大結局）柳若水向麥玉芝細訴她犯下的命案，芝疑團盡釋，水欲殺芝滅口，幸佟林負傷趕來相救。時雲鵬擔心芝的安危而越獄趕至，他見林欲逮捕水，願一死以維護水。水見事情敗露，遂揮斧殺鵬並自刎，與鵬一起共赴黃泉。

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