神捕佟林为寻爱妻前往古北口，巧见一马车被山贼所劫，将神医麦青山与女儿麦玉芝、卖货商人燕劲腕儿、厨师大碗公等救出。佟林将山贼押往县衙后，随悦来客栈少东海棠往找玉芝，适时却闻得山贼同党劫狱，速赴县衙支援。

佟林赶返麦青山处将山贼击倒，救出麦玉芝及海棠，海棠对佟林萌生爱意。佟林闻得山上有一无头女尸，与海棠赶往调查。海棠认出案发现场的物件属邱月娥，惟女尸被野狼、山猪争抢而冲入河流；佟林在附近发现一把官差刀。

葛天仪向海大娘母女施压要入住贵宾房，时而闻得县衙正查邱月娥之事，他竟开出二百両赏银。佟林为找寻妻子曹翠莺下落，与麦玉芝来到宋厝子，却见村子已烧成灰烬。玉芝替海棠找盈烟鉴别玉扇，盈烟却劝玉芝送回玉扇。

贾盈烟指葛天仪正搜寻一把失踪的玉扇，劝麦玉芝别多管闲事免惹祸。程咬银欲检视佟林手上的官差刀，却被拒。佟林离开贵宾房时，与天仪狭路相逢，二人触发一场比斗。天仪请玉芝雕制一把玉扇，却将玉芝家中鹦鹉斩杀。

燕劲腕儿摆卖时被程咬银刁难充公货物，他只好盗走佟林所藏的官差刀；燕劲腕儿将官差刀卖给咬银后，被佟林教训，他始道出卖给咬银的只是雷大力的官差刀。燕劲腕儿为佟林潜入验尸房偷得血布，佟林再找麦青山检验血迹。

佟林为化解贾盈烟与麦青山的恩怨，乔装成看墓者向盈烟打探，惟他听后却慨叹难审此事。于翰东等拷问燕劲腕儿，海棠找佟林解围。佟林与麦青山证明官差刀上的血迹与邱月娥的血衣吻合，惟胡原偏袒程咬银，未能将其查办。

歌妓金兰花自恃干哥哥是程咬银，迫使海大娘借出客栈地方，让她登台献艺。佟林在宋厝子掘出一面古镜。佟林因兰花一曲忆及妻子，欲知其琴艺出处，却被她要求以咬银的官差刀作交换。麦玉芝将玉扇交予贾盈烟，托其出售。

金兰花脱去外衣诬蔑佟林强奸，此时程咬银率衙差涌至，佟林始知中计，幸得于翰东求情而获释。麦玉芝欲找贾盈烟取回玉扇，却得知贾府被烧毁，现场更发现玉器失窃及两具烧焦尸体。玉芝深怕被当成凶手，与海棠上山暂避。

麦玉芝与海棠在山上遇到关东三雄，陷入困境；佟林为得二人消息，不惜答应葛天仪让出仰天剑，后在山洞救出二人。佟林暗中取走贾府尸体骇骨，交予麦青山检验死者身份。老驴头上山接应玉芝与海棠后，却再遇关东三雄……

海棠往找救兵却被关东三雄捉住，幸得燕劲腕儿救出，其后二人寻获失散的麦玉芝。麦青山验出两具骇骨非万子和。佟林诱使子和妻到城隍庙交易玉器，成功逮捕子和。佟林仔细道出案情，救出贾盈烟，又上山寻获玉芝与海棠。

佟林迫程咬银道出遇见邱月娥的经过后，向其提供杀害月娥凶手的线索；翰东等上山捉关东三雄，却大败而回。麦青山得知贾盈烟在华倩如之墓旁建草舍，与盈烟发生冲突，麦玉芝劝阻未果，愤然而去，得佟林安慰，芳心大动。

燕劲腕儿原来是九门总兵官赵无忌的大将，他救出遇袭的无忌后，得知玉扇有锦衣卫总监刘瑾的罪证，欲往县衙盗之。海棠得悉母亲是武林高手。佟林将关东老三押返县衙后，把寻获的腐烂人头交予麦青山检验，证实是邱月娥。

古北口百姓为佟林举行庆功宴，胡原受富户之托送赠武士金冠予佟林。此时葛天仪来至，指佟林数月前已被浙江巡抚衙门撤职，更以冒充巡捕之罪逮捕他。燕劲腕儿潜入衙门盗走玉扇，天仪藉此接管县衙，更藉词放走关东老三。

葛天仪收买囚犯暗杀佟林，却未果。关东三雄潜伏古北口山路，燕劲腕儿设计引开三人，成功让赵无忌的囚车安然经过。天仪杖打雷大力至重伤，又勒令程咬银寻回玉扇，否则要将于翰东斩首。麦玉芝想出仿造玉扇来瞒骗天仪。

仵作偷偷前来麦府打探，发现麦玉芝与贾盈烟正制造玉扇。赵无忌来到悦来客栈见海棠、海大娘，突被关东三雄袭击；燕劲腕儿赶至救出无忌，并带他找麦青山医治伤势。葛天仪私自将押解官杀死，又将海棠母女带返县衙问话。

（大结局）海大娘告诉海棠她是赵无忌与晋阳公主的私生女。燕劲腕儿携同真假玉扇跟葛天仪交换人质；佟林以锄头力战手执仰天剑的天仪，天仪终被石墙压毙。佟林看到曹翠莺饰物，确认爱妻已逝，决定留在古北口担任捕快。