南宋末年，蒙古兵大軍壓境，將軍張天順為救樊城，把藏有抗元名冊的黃龍劍交予偏將范國興，再自刎讓國興帶其首級投降蒙哥。多年後，范秋生趁墟時與人爭執，國興為救子被崑崙派掌門察覺身分。洪鵬飛奉朝廷密令消滅中原的抗元勢力，把樞密院化為江湖幫派金烏教，並與名劍門結盟，要對方提名張崎出戰名劍大會。秋生被指殺人，國興提出疑點並調查事件，秋生跟蹤，落入蛇蠍雙魔手上，為仇萬仞所救。萬仞看見國興，斥他是賣國賊並要殺他。

國興拿出黃龍劍及天順死前寫的血書，萬仞方知錯怪對方。國興因行藏洩露，聽從萬仞提議，與秋生投奔曾參加抗元工作的馮保，殊不知對方早已變節，更覬覦著黃龍劍。鵬飛要張崎參加名劍大會及得到朱雀劍。鵬飛送朱雀劍去名劍門，路上遇柳清蓮追殺採花賊，青蓮強行一睹朱雀劍。馮保為得黃龍劍，欲把女兒仁淑許配給秋生，國興覺有異而推卻，但馮保堅持。馮保逼國興交出黃龍劍不遂，還被國興殺掉。鵬飛贈劍給名劍門，掌門凌乘風親自迎劍。

名劍門的堂主不滿金烏教霸道，楚風出言安撫。秋生無意間破壞毒如來與張崎的較量，毒如來一氣下打傷國興，並以毒粉教訓秋生，清蓮插手，毒如來看出她是斷腸谷的人，只好作罷並交出解藥。張崎重遇秋生，得知國興受傷，帶秋生到名劍門拿藥，秋生在名劍門險洩露黃龍劍的事，萬仞及時搶走朱雀劍阻止，再把劍交給秋生。秋生謊稱自己把劍搶回，並指萬仞是其師傅，楚風吃驚。萬仞看好秋生經琢磨後可成大器，國興託他在自己不測時照顧秋生。

楚風和鵬飛請秋生表演萬仞的絕招「一劍穿心」，秋生藉詞推搪。凌夫人向秋生查問萬仞的近況，並託他把一個盒子交給萬仞，萬仞看著盒子，前塵往事湧上心頭，後暗中把盒子交還。余大海出售名劍大會的請帖而被金烏教弟子教訓，秋生出手制止，對方卻突然死於「一劍穿心」之下。清蓮不客氣地質問秋生與萬仞的關係，國興阻止，被她劍傷。秋生偷走國興的劍，與大海共赴名劍大會。楚風擔心萬仞會搗亂名劍大會，毒如來謂可用子午追魂散對付。

名劍大會上，張崎突然取去秋生的劍使用，未料那是黃龍劍，眾人爭奪，清蓮把劍搶走，卻中了毒如來的毒。清蓮向秋生逼問萬仞的下落，萬仞現身，後發現清蓮的劍法與自己的一樣，著她別插手他與斷腸谷主的事，清蓮反要他來斷腸谷救秋生。名劍大會結束，楚風宣佈張崎武功最高，朱雀劍歸其所有，天機子質疑張崎使用蒙古武功，楚風解圍。楚風捉走國興，引萬仞到名劍門，用毒將其捉住。楚風廢掉萬仞武功，還對他用刑，以發洩多年怨恨。

毒如來、木靈芝兩師徒向清蓮討黃龍劍，不果。楚風表示計劃在天下英雄面前為國興雪冤，國興感激。鵬飛利誘萬仞歸順元朝，萬仞開出條件，要他放掉國興。鵬飛要楚風把萬仞交給他，並稱會帶萬仞出關外，替其恢復武功。毒如來師徒再向清蓮討劍，清蓮不惜使出玉女散功大法嚇退二人。楚風請纓與張崎請仁淑指證國興殺死馮保，鵬飛亦稱決定了帶萬仞回去蒙古。凌夫人發現楚風囚禁萬仞，楚風表示身不由己並承諾會把萬仞救出，但暗裡另有盤算。

眾堂主奉楚風之命劫牢並殺萬仞滅口，凌夫人阻止，萬仞失足掉崖。凌夫人服毒輕生，楚風急命人找毒如來解毒。張崎與毒如來師徒來搶黃龍劍，清蓮因之前使用玉女散功大法致體力虛脫，未能應戰，最終劍被搶走，清蓮氣極責罰四侍衛，四人不滿。鵬飛懷疑劫牢一事與楚風有關，出言試探。萬仞掉崖獲救，出重金請鏢師送自己到五老峯。張崎不忿楚風保管黃龍劍，鵬飛明言利用楚風後會將其殺掉。清蓮猜到四侍衛要對付自己，施計逃走，卻被追上。

四侍衛迫清蓮交出秘笈及解藥，秋生帶清蓮逃走時，兩人有所爭執，糾纏間一同滾下山坡。秋生帶清蓮躲進山洞，四侍衛找至，秋生打算以清蓮教的救命三招一拚之際，斷腸谷主柳霜雲及時出現。楚風向鵬飛他們解釋找岳世豪出席雪冤大會的原因，並稱已有對付國興的計劃。元兵出重賞捉萬仞，兩名鏢師發現萬仞的身分，押他領賞，卻於路上同被毒黃蜂她們捉走。毒黃蜂拷打萬仞，突見他身上的碧玉牌，以為他是斷腸谷的朋友，態度一變，還放掉他。

毒黃蜂見萬仞傷重，護送他去五老峯。楚風稱世豪和張崎答應在雪冤大會作公正，更指張崎是天順之子，國興驚喜。鵬飛向楚風解釋為何要置國興於死地，並要張崎成為世豪的女婿。霜雲識破秋生非萬仞徒弟，將其教訓，清蓮相救。萬仞跪求無嗔大師救國興遭拒，只好盡己之力，無嗔被打動，答應破例幫忙。國興對雪冤一事作最壞打算，把後事和秋生交託大海。無嗔因誤會與逍遙天尊不打不相識，天尊得知無嗔要往名劍門，欲湊熱鬧，無嗔勸阻。

雪冤大會上，國興道出當年降敵的內情，並展示肩膊上插著的箭頭及天順的血書，但仍未能雪冤，此時楚風要他拿出最有力的證據黃龍劍，國興終明白雪冤大會只是一個圈套，最終選擇自刎。大海欲帶國興的屍首回鄉安葬，世豪卻指國興是亂臣賊子，要其曝屍三天，大海阻止不成，後得靈芝幫忙偷屍。秋生發現黑寡婦和白姑婆用人血灌溉斷腸草，阻止不成反被捉，幸得清蓮相救。大海火化國興的屍首，無嗔來到，稱受萬仞所託來救人，遺憾來遲一步。

無嗔到名劍門化解楚風和萬仞的恩怨，鵬飛提出要他替萬仞受兩刀，無嗔憑著護身氣功而刀劍不入，鵬飛於是向楚風拿黃龍劍對付對方。無嗔拒絕帶凌夫人見萬仞，此時鵬飛蒙面暗算，卻刺中凌夫人。無嗔向楚風交代凌夫人遇襲身亡的經過，並指兇手用的是假黃龍劍。岳佩佩聽出張崎的琴聲有胡音，張崎錯愕。萬仞得知凌夫人和國興的死訊，心灰意冷下欲輕生，為大海制止。無嗔點化萬仞，並給他一本修心養氣的經書誦讀，自己代他去斷腸谷找秋生。

秋生因打賭而到禁地去，結果中毒並弄毀斷腸花及傷心草，白姑婆二人要殺秋生，清蓮阻止。秋生因為中毒太深，清蓮只能替他把毒逼至左手，雖然性命得保，但以後再也不能練武。清蓮不解霜雲為何一直要她殺萬仞，霜雲說出與萬仞的恩怨。無嗔來到斷腸谷，霜雲與他比試輸掉，答應讓秋生離開。秋生請無嗔也救出谷中的人牛，霜雲要無嗔闖過心魔雲雨陣，無嗔要求齋戒沐浴三天再闖陣。萬仞發現身上有真氣亂竄，後內功恢復，才明白無嗔的苦心。

楚風得知萬仞在五老峯，計劃將其殺掉，與此同時，鵬飛的上級命鵬飛派張崎保護萬仞，還要鵬飛調查天順的胞弟張天義，找出真正的黃龍劍。無嗔破陣失敗，得留在谷中面壁十年，他欲給秋生注入內力，教他諸天大悲神咒助他離谷，卻因秋生體內的毒而未能成事，遂讓他先學無相無極神功化解體內的毒，而秋生亦得悉國興的死訊。秋生堅決要出谷替國興報仇，清蓮見狀，只好幫忙。楚風帶人血洗五老峯，萬仞卻被人救走，楚風懷疑張崎，出言試探。

張崎向萬仞自稱是天順之子，並向他解釋救他到名劍門的原因。清蓮為秋生偷取醒魂丹助他離谷，另方面，秋生心急，自行出谷，遭白頭棄婦阻攔，清蓮趕至幫忙卻不敵，霜雲突然下令放秋生離谷。天機子逼問秋生黃龍劍的所在，卻因秋生全身有毒而中毒死去。楚風確認是張崎救走萬仞，欲逼他把人交出，張崎把萬仞帶走，楚風吩咐毒如來追殺張崎。秋生到名劍門，看見國興的靈位，楚風指是張崎及世豪逼死國興，並為了引出萬仞，勸秋生暫時住下。

張崎和萬仞前往岳家堡，毒如來追殺兩人，被張崎打敗。清蓮和霜雲因秋生而爭執，之後清蓮內傷發作，拒讓霜雲醫治，霜雲氣其不識好歹。萬仞二人中了毒如來的毒，為沿途暗中保護他們的上官虎及上官龍所救。仁淑要殺秋生報仇，楚風阻止，還勸她放下仇恨。毒如來用計引開上官虎二人，再對付萬仞和張崎，萬仞用盡所恢復的功力將其打傷，楚風驚聞萬仞功力未失。萬仞二人到達岳家堡，世豪徵求名醫為萬仞治內傷，張崎指萬仞重傷是楚風所為。

張崎透露楚風賣國投元，世豪欲聯絡各大門派討伐名劍門，萬仞勸其別輕舉妄動。靈芝和仁淑為秋生爭風呷醋，靈芝欲與仁淑較量，卻誤傷秋生，急忙找毒如來救人。毒如來因秋生中了斷腸花毒，為增加功力，要吸秋生的血，靈芝阻止。無嗔察覺清蓮受了嚴重內傷，運功替其療傷，並勸她放下屠刀。逍遙天尊假扮太湖醫隱，應徵醫治萬仞並將其劫走，世豪從天尊的功夫識穿他的身分。張崎往救萬仞，發現萬仞得天尊所救，傷勢差不多復元。

天尊的小妾發現張崎耳後有反骨，覺他不可靠，告知天尊。黑寡婦和白姑婆到名劍門找萬仞，看見秋生，還與楚風交手。萬仞回岳家堡，天尊著他提防張崎及算出他將會骨肉相殘。楚風藉詞仁淑已被馮保許配給秋生，為兩人作主，想秋生交黃龍劍作聘禮，秋生猜測國興的死與黃龍劍有關。秋生不信任楚風，離開名劍門。清蓮擔心秋生，恰巧霜雲要她出谷殺萬仞，並給她一個玉葫蘆。楚風計劃利用秋生送毒信給萬仞，鵬飛盤算借計挑撥岳家堡和名劍門。

秋生遇上有人被元兵追殺，受託把一封信交給萬仞。清蓮到名劍門，得知秋生往岳家堡找萬仞。秋生來到岳家堡，一看見張崎即要殺他為國興報仇，張崎指他被楚風騙了。萬仞發現秋生帶來的信是寫給世豪，世豪閱信，雙眼中毒受傷。楚風不解何故是世豪中毒，著毒如來去替世豪醫治，鵬飛氣憤他不敢攻打岳家堡。張崎得知鵬飛把毒信掉包及其盤算，卻未能煽動世豪攻打名劍門。清蓮要世豪交出萬仞及秋生，得知世豪雙眼受傷後，稱三天後再來討人。

佩佩偕文、武總管請清蓮別再到岳家堡遭拒，與之交手卻不敵，張崎及時相救，之後清蓮打敗張崎，張崎相約明晚再比試。毒如來師徒到岳家堡找世豪，世豪疑惑兩人來意，遂不動聲色，憑聽聲辨位佯裝雙目能視，但最終因喝酒而露餡。張崎再輸給清蓮，約她翌晚再比試。毒如來為世豪醫眼，卻因靈芝趁機去救被關著的秋生，被誤會真正的來意是劫牢，遭世豪下逐客令。張崎與清蓮比試，因留手而不敵，得護國劍師救走，但被指愛上清蓮，張崎否認。

萬仞找來天尊替世豪醫眼，但天尊也無能為力。清蓮再到岳家堡，世豪以勾刀陣和梅花槍對付，萬仞受秋生所託，出手救清蓮，清蓮約萬仞七天後決鬥。世豪因萬仞求情並發毒誓力證國興是忠良，答應暫時釋放秋生，但要他在毒瞎自己一事查明前，不可離開岳家堡。萬仞希望秋生和張崎化敵為友，收兩人為徒。天尊看出秋生是武學奇才，幫助萬仞教導他，對其大表關心，秋生透露想見清蓮。清蓮夜探岳家堡救秋生，卻聽到他說自己的壞話，氣惱離開。

秋生偷偷出岳家堡見清蓮，遇到靈芝，清蓮看見靈芝也在，趕二人離開。靈芝憶述國興的死，秋生為了去找大海拿回國興的骨灰安葬，回岳家堡向萬仞辭行，世豪不允秋生離開，天尊與之交手，眼看世豪將要不敵，萬仞趕急解圍，最終世豪讓天尊帶走秋生。佩佩對萬仞有好感，國師要張崎加緊追求，承諾事成後把清蓮送給他。天尊的小妾欲與秋生親熱，靈芝將其刺傷並帶走秋生。鵬飛派人搶走楚風的女兒凌翠兒並陷害岳家堡，圖迫使楚風攻打對方。

秋生和靈芝到客棧投宿，看到毒如來，兩人假裝兄妹，與之住同一客棧。秋生毒發，靈芝替他吸出毒血後暈倒，秋生為讓毒如來救靈芝，答應一生不見她並寫下絕情字條。楚風為救翠兒，不惜以雙眼交換，被鵬飛制止。秋生混入名劍門帶仁淑離開，並送她去投靠南宮霸天，剛巧清蓮帶藥給霸天，看見二人。楚風在房間發現翠兒，但此時她已飽受折磨，經大夫診治後雖保住性命，但雙眼瞎掉，手腳殘廢，還身中萬箭穿心毒，楚風痛恨世豪殘忍。

楚風不忍翠兒受苦，忍痛給她解脫。秋生從霸天口中得知清蓮要與萬仞決鬥，趕往阻止，仁淑追上。仁淑被殺，秋生被懷疑謀財害命而遭通緝。秋生未能見到清蓮，到岳家堡欲見萬仞，世豪因萬仞正在坐關而阻止。楚風誓要剷除岳家堡，並派人捉佩佩及取萬仞首級。佩佩帶秋生見萬仞，萬仞拒絕放棄決鬥，並因秋生闖入而亂了心神，佩佩以琴音助其安神，期間被襲擊，得張崎保護。秋生偷聽得三位堂主要對付萬仞，趕去決鬥之地通知，突被官兵捉走。

萬仞和清蓮決鬥，名劍門三名堂主趁機偷襲，清蓮相助萬仞，佩佩卻誤會是她把萬仞刺傷，萬仞為清蓮澄清。世豪想討伐名劍門，萬仞覺一切事像是有人刻意安排的圈套，提議他約楚風當面對質。世豪派人送信約見楚風，楚風因記恨翠兒之事本回絕，後回心轉意。國師看出張崎對清蓮的感情，提醒他以國家為重，多花工夫在佩佩身上。秋生遭霸天嫁禍覬覦仁淑的家財而謀財害命，霸天還賄賂縣官將其斬首，此時國師卻要帶秋生去黑石島找穩如山。

佩佩悉心照顧萬仞，萬仞卻向她稱讚張崎，佩佩不悅。世豪和楚風見面，兩人當面對質，楚風否認毒瞎世豪雙眼，世豪亦不承認加害翠兒，還要楚風別做胡人的走狗，楚風氣極要殺世豪，被萬仞阻止，事後楚風誓言剷平岳家堡。世豪聞悉佩佩常待在萬仞房間，心感不妥，對佩佩加以提醒。秋生和黃豹被押往黑石島，路上兩人施計逃脫，之後黃豹因無法砍斷連著兩人的手銬，欲砍下秋生的手，兩人糾纏，最後被官兵發現。

秋生和黃豹被官兵捉回，還重遇大海。大海行賄救秋生不成，遇到清蓮，與之一同去黑石島救秋生。鵬飛為攻打岳家堡，請來無為書生和陰陽才子幫忙。秋生在黑石島被安排負責送飯給如山，如山見其手掌異常，認定他練了邪派毒掌，於是封其穴道，要他被自己的毒毒死。秋生毒發，痛苦難當下練習無嗔的心經。世豪想把佩佩許配給張崎，請萬仞做媒，佩佩和張崎因心有所屬而暗自神傷。如山疑惑秋生沒有死去還功力大增，測試他的身手，突遇暗算。

如山殺掉暗算自己的殺手。佩佩向萬仞表白，因萬仞拒絕私奔而離家出走，陰陽才子和無為書生遇到佩佩，利用迷魂大法得知她為了萬仞而出走，時萬仞尋至，打退二人。佩佩因萬仞表示對自己只有叔侄之情，難過下回去岳家堡。佩佩和張崎過文定之日，陰陽才子和無為書生不請自來，還譏諷萬仞。如山發現自己一直錯怪秋生，對方並非國師派來的奸細，於是道出與國師的恩怨，還願意教秋生武功及一同離開黑石島，此時清蓮來到島上救秋生。

國師用計令清蓮與如山交手，趁機襲擊如山，秋生因如山被清蓮所傷，生氣下拒跟她離去。如山和秋生躲進山洞，國師打算炸開洞口，如山把握時間教秋生九憂神劍的頭四式及第九式。楚風進攻岳家堡，鵬飛要張崎他們誓死保護，還下令烏金教撤退，要名劍門雞犬不留，結果名劍門滅門，而張崎因楚風要脅，擔心身分被洩露，故意將楚風放走。如山衝出山洞與國師交手，並向秋生展示九憂神劍第五至八式後，把他打下海，自己則死於國師手中。

楚風到斷腸谷慫恿霜雲搶奪黃龍劍，當武林盟主，霜雲以為他想主使女人做事，大數其罪狀後與他比武，楚風不敵，被刺入三支子午斷魂針於穴道中，只要一拔出就會武功盡失。秋生漂流到荒島，遇到天義，天義得悉國興含冤而死及侄兒張崎仍然在生。楚風在斷腸谷做人牛，無嗔表示要救他脫離苦海。秋生和天義回到中原，即被鵬飛帶人襲擊，天義認出鵬飛是蒙古一員大將。張崎和佩佩成親，二人向萬仞敬茶，萬仞送佩佩玉珮留念，此時天義到賀。

天義澄清國興非賣國賊，世豪自責冤枉國興，請秋生為父報仇，秋生沒有理睬，世豪欲自行了斷，被萬仞勸阻。張崎擔心被天義發現假冒天順之子，誰料天義竟與他叔侄相認。無嗔替楚風求情，希望霜雲放過楚風，卻被要求自斷一臂。無嗔發現楚風心中仍有惡念，要他跟隨自己參禪，並答應霜雲要求，願自斷一臂，楚風阻止，霜雲料不到無嗔願意自殘軀體，決定把楚風交給他。萬仞與清蓮決鬥之日來到，清蓮卻病得昏倒，被無為書生和陰陽才子擄走。

萬仞和秋生先後得知清蓮被擄走，趕往營救，期間秋生誤打清蓮一掌，萬仞以內力護住清蓮心脈，再替她運功。陰陽才子和無為書生以邪音擾亂萬仞的心神，欲令他走火入魔。霜雲認定楚風是有仇必報的小人，楚風反唇相稽，指她可能因愛成恨才要殺萬仞，霜雲欲殺楚風，無嗔阻止。張崎得知萬仞去救清蓮，趕往接應，以金牌命令陰陽才子和無為書生離開。天義認出張崎的老僕張忠是投元的千面書生，加以查問試探，卻未能證實。

由於秋生身上有斷腸草毒，被打了一掌的清蓮亦因此中毒，要斷腸花才能解，張崎埋怨秋生鹵莽大意，惹清蓮不悅。大海向秋生說出國興臨終前的吩咐，要把其骨灰帶回鄉下，葬於家後三棵松樹下。楚風背上的斷魂針毒發，無嗔見他痛改前非，替他逼出毒針。世豪為了贖罪，欲收秋生為義子及為國興雪冤，秋生卻不領情。國師刺殺天義，佩佩偷看到他獲張崎暗中放走。萬仞到斷腸谷為清蓮拿解藥，霜雲質問他當年有妻室為何仍與她親近，毁其貞節。

萬仞解釋此行除了是拿解藥，還想向霜雲請罪，但霜雲聲言永不原諒他，還要他闖過心魔雲雨陣來換取解藥。佩佩聽到張崎酒後說出並非想殺天義，告知世豪並道出張崎放走國師一事，世豪著她注意張崎的一舉一動。萬仞闖陣時雜念叢生，險走火入魔，得無嗔助一臂之力，終成功破陣，霜雲答應交出解藥。佩佩發現張崎騙天義一起外出，覺事有蹊蹺，國師襲擊天義，佩佩帶秋生他們趕至，國師因他們人多勢眾而逃去，事後佩佩對著張崎卻不動聲色。

世豪他們佈局令張崎露出真面目，張崎遂自揭是元朝勇士，世豪要殺張崎，天義以張崎左背上的疤痕力證他是張家後人，此時陰陽才子突暗算張崎，天義捨身相救。萬仞拿解藥回來，但清蓮指兩人的決鬥勢所難免。張崎在天義靈位前懺悔，請他在天之靈助自己殺盡元賊，為父報仇。世豪拒絕歸順元朝，為免禍及無辜，決火燒岳家堡離開。國師等人追殺世豪他們，天尊及時率眾救援，並讓眾人於幽冥山莊落腳，秋生和張崎決先去安葬國興後再會合眾人。

世豪欲召集各省英雄到幽冥山莊商討抗元大計，國師命人造謠指岳家堡勾結魔教。秋生得知霸天當日陷害自己，霸天否認，並趁清蓮阻止秋生帶自己與縣官對證之際逃走，張崎追截，最後為了清蓮將其放走。各省英雄拒來商討抗元大計，萬仞認為主因是他們沒有黃龍劍。張崎向清蓮透露霸天未死，清蓮感激，但對秋生餘怒未消。國師伏擊秋生和張崎，大海找清蓮幫忙，三人合力擊退國師。國師要霸天宴請清蓮和張崎，對二人使用迷藥，霸天被迫答應。

霸天騙清蓮和張崎喝下加了迷藥的茶，最終張崎把持不住，霸天則被國師滅口。清蓮醒來看見秋生，誤會是他與自己發生關係，問他何時迎娶自己，秋生卻稱沒有想過，清蓮大怒，聲言今後不想見到他後離去。國師要鵬飛假傳消息指岳家堡變成五靈教分舵，世豪卻以為是天尊所為，與之鬧翻。世豪帶佩佩等人離去，被懷有五靈教令牌的黑衣人襲擊，飄絮草堂主人皇甫天高的手下白衣使者和黃衣使者趕至相助，惜來遲一步，世豪被殺。

張崎良心不安，欲向秋生坦白對清蓮所做的事，但終究未能啟齒。張崎偷聽得鵬飛要從天尊手上救回被擄的蒙古郡主，有所盤算，向秋生道別後給天尊通風報信，兩人施計殲滅鵬飛等人，事後天尊卻發現郡主被張崎帶走。秋生和大海回到鄉下，得知家中松樹被砍掉，遂另找地方安葬國興的骨灰。佩佩等人來到飄絮草堂，卻未能見到天高。郡主帶張崎到京都帥府，張崎夜闖帥殿被擒，得郡主相救。秋生和大海來到幽冥山莊，此時天高下戰書約天尊決鬥。

天尊占卜出與天高一戰大凶，把一個錦盒交給秋生，吩咐他在自己死後才可打開。張崎潛入殿中行刺伯顏，但等著他的是一直蒙面示人的國師，而對方原來就是張忠。國師與伯顏游說張崎歸順，不但讓他看天順的頭顱，還威脅公開他毁了清蓮貞節之事。霜雲怪責清蓮愛上秋生，清蓮欲一死以謝霜雲，霜雲阻止，著她加緊苦練武功找秋生報仇。天尊向佩佩表明沒暗殺世豪，天高卻拿出黑衣人掉下的五靈教令牌，天尊測試天高身手，領教到他的金剛神掌。

天尊察覺天高的金剛神掌夾雜一種陰柔內勁，要佩佩轉告萬仞，其後天高在決鬥中使出黃龍劍，天尊不敵而退。天高游說佩佩廣招天下英雄，完成志豪的抗元遺志。張崎答應為伯顏做事，但要他保守自己的一切秘密。天尊撐著一口氣見萬仞和秋生，但只說了黃龍二字就死去。清蓮苦練斷情絕義劍，性格變得更冷酷無情。秋生打開錦盒，發現五靈教信物五靈符，天尊兩位小妾勸服秋生答應做五靈教教主，並料到五靈使者會要他過生死門，教他飄凌步法。

秋生成功破了生死門，成為五靈教教主。天高以佩佩的名義在飄絮草堂召開英雄大會，天下英雄陸續齊集。秋生質問天高為何殺天尊，天高拒認殺人。天高雖擔心萬仞和秋生的出現會影響行動，但要待所有抗元分子到齊才將他們一起剿滅，並在適當時機才拿出黃龍劍及要張崎證明劍是真的。清蓮練成斷情絕義劍第十二重，出谷找萬仞決鬥，無嗔希望霜雲放過萬仞，但她堅持萬仞定要死在清蓮手上。無嗔把真氣傳給楚風，著他出谷阻止清蓮和萬仞決鬥。

佩佩向萬仞轉達天尊的說話。龍五游說群雄選天高為盟主，質疑萬仞可能欺世盜名，還當面挑釁秋生。秋生欲離開草堂，萬仞提醒他此行的目的。龍五要張崎監視萬仞，並在時機成熟時證明國興的黃龍劍是假的。天高欲推舉張崎當盟主，但萬仞向群雄提出拯救文天祥，天高未能拖延行動，只好趁混亂放出信鴿，希望國師及時得到消息。清蓮到幽冥山莊找不到萬仞，殺了兩名沖撞她的五靈使者。天高派手下假扮五靈教弟子攻打北綠林十八寨，嫁禍秋生。

萬仞以聲東擊西之計，處處牽制伯顏他們，但秋生沒有等萬仞他們到來會合，已把天祥救走，此時北綠林寨主來尋仇，國師突出現擄走天祥，大海為救秋生而被國師殺死。國師逃走，遇楚風攔阻，萬仞趕至，兩人一同對付國師。秋生欲殺楚風為國興報仇，萬仞勸阻，楚風跪謝。天高自薦當盟主並亮出黃龍劍，楚風澄清國興非賣國賊，天高反質疑其居心，煽動群雄將其處決，萬仞阻止。秋生質疑天高的黃龍劍是假的，天高卻得到張崎作證，獲群雄追隨。

張崎解釋為天高的假黃龍劍作證的原因，楚風提議眾人搬往名劍門荒廢的分舵洛鷹峽落腳。秋生因大海、國興、仁淑的死而自責，耍劍發洩，意外練成剛烈的九憂劍法，佩佩建議取名怒劍九式。清蓮要各門派在三月十五日英雄大會前找到萬仞，否則每天殺一人，令人人自危。張崎擔心假黃龍劍亮相後，十三省抗元英雄會有危險，萬仞和楚風欲向武當掌門揭露天高的陰謀，不料被對方在茶裡下蒙汗藥，萬仞著楚風先走，自己卻因不敵武當棍陣而被擒。

萬仞被押去飄絮草堂，途中被假冒的五靈教弟子刺殺，秋生和張崎及時相救。張崎斷髮為誓，要與國師同歸於盡，佩佩給他世豪留下的秘笈，張崎苦練刀槍，並得萬仞指點。國師對付清蓮，藉領教她的武功讓陰陽才子和無為書生在食水和食具下毒。秋生希望清蓮別找萬仞決鬥並答應娶她，卻在清蓮對他出手時將她誤傷，時楚風來到，發現清蓮中毒，只有毒如來能解。秋生替清蓮拿解藥，楚風希望他回來後能與清蓮和好，清蓮卻稱寧死也不領秋生的情。

清蓮激動得欲自刎，楚風點其睡穴。霜雲得知清蓮中毒，決定出谷，無嗔自知時日無多，託她轉告楚風在他死後重整五老峯。秋生到萬毒谷找毒如來，闖進萬箭穿心迷魂陣，得毒如來的仇敵哈哈兒相救。佩佩懷孕，張崎先喜後憂。張崎試出龍五對自己的秘密一無所知，把他交給萬仞，揭發他是元朝奸細及五大派將會進攻洛鷹峽，眾人分批由秘密通道撤走後再折返。秋生再闖萬毒谷，成功通過萬箭穿心迷魂陣，卻掉進陷阱，靈芝認不出洞裡的人是秋生。

清蓮遭丐幫尋仇，楚風奮力保護卻不肯殺人，霜雲趕到。霜雲感謝楚風照顧清蓮，但堅持非殺萬仞不可。國師吩咐天高率群雄再闖洛鷹峽，順便打探龍五的消息。萬仞得知霜雲出谷，並執著要找自己報仇，決定與楚風去見她，臨行前著佩佩繼承志豪遺志，並提醒張崎別做遺臭萬年之事。秋生練成無相無極神功第九重，衝出陷阱，哈哈兒也從靈芝手上取回毒如來偷去的五色神龍。五派攻入洛鷹峽，張崎殺掉五派的人及龍五，並放走天高，之後兩人見面。

清蓮痛苦難當，但霜雲拒給她服食不可恢復功力的九轉大還丹，決定必要時親自去找毒如來，此時萬仞和楚風來到，萬仞勸霜雲別要清蓮跟他決鬥，不果。秋生為取萬年天壽根救清蓮，再去萬毒谷，與靈芝重遇，秋生向她解釋當日的事。毒如來假裝同意給秋生一點萬年天壽根，騙其服下沒有解藥的四魂散，靈芝為救秋生，趁毒如來下山找五色神龍時，到煉丹室偷萬年天壽根，毒如來得悉折返。靈芝帶秋生躲進密室，毒如來要靈芝交出萬年天壽根。

靈芝給秋生服食萬年天壽根，如來氣得要吸光秋生的血，被秋生打傷，靈芝帶秋生離開。萬仞去萬毒谷找秋生，路上遇到秋生二人，萬仞告知秋生要找出真黃龍劍揭穿天高的陰謀，二人想到劍可能藏在秋生家鄉的三棵松樹下。國師和陰陽才子、無為書生伏擊霜雲母女，秋生三人來到，國師脅持靈芝，讓陰陽才子二人帶走霜雲。陰陽才子對霜雲使用迷魂大法，得知清蓮是萬仞的女兒，為楚風聽到。楚風和張崎救走霜雲，霜雲勸楚風回谷見無嗔最後一面。

秋生不解清蓮為何恨自己，萬仞提醒他國難當前，別太看重兒女私情，應先找出黃龍劍。張崎向國師保證會令萬仞出席英雄大會及指證對方，條件是事成後要讓他成為盟主及在英雄大會前不找萬仞麻煩。楚風回谷見無嗔，時天高率五派血洗斷腸谷，無嗔使出金剛蟬寒，耗盡真力而圓寂。霜雲母女回谷，楚風因霜雲仍不讓清蓮服用九轉大還丹，道出翠兒的事，霜雲不為所動。清蓮拒服九轉大還丹，霜雲點穴強迫她吃，時秋生來到，欲用自己的血救清蓮。

萬仞和張崎混入元兵軍營，終於找到黃龍劍。清蓮因秋生救了自己，決定下次才殺他。清蓮現身英雄大會與萬仞決鬥，楚風來到，在萬仞耳邊說出真相，萬仞向霜雲查問，突然清蓮一劍刺來，楚風捨身救萬仞，死前向清蓮道出萬仞是其親父。群雄追究五靈教偷襲十八寨，殘殺抗元志士的事，張崎亮出黃龍劍，相約群雄一個月後到飛霞嶺。清蓮生氣被霜雲利用，決定回谷，從此不再踏足江湖。天高捉走佩佩，希望她以岳家後人名義與他們一起高舉義旗。

秋生他們到飄絮草堂救人，張崎暗中用計引開國師，但最終只救出靈芝、如劍、如虹。秋生著如劍二人回去斷腸谷，而靈芝因秋生對清蓮一往情深，決定返回萬毒谷。國師要萬仞他們用黃龍劍交換佩佩，張崎不肯，後留書獨自去救佩佩，並於信中向秋生坦白污辱了清蓮一事。國師向佩佩說出張崎污辱了清蓮，但佩佩不怪張崎，還為了不負累他而自盡，萬仞和秋生趕至襄助張崎，國師逃脫。國師打算利用張崎的師傅大漠神龍對付秋生三人。

佩佩自知藥石無靈，表示原諒張崎，張崎亦承諾會完成世豪的遺志，努力抗元，最後佩佩於張崎的琴聲中離世。張崎希望為佩佩守墳一段日子，把黃龍劍交給秋生，萬仞著秋生攜劍聯絡華北雙鷹和活財神，自己則去斷腸谷。靈芝回到萬毒谷，發現毒如來因被秋生打了一掌而觸發舊患，幸得哈哈兒不念舊惡，定時拿五色神龍的血給他續命。國師到絕谷找大漠神龍，指張崎已投入萬仞門下及入贅岳家，盡得武穆雙絕精華，又藉過招引起他對秋生的興趣。

萬仞來到斷腸谷，清蓮怨恨他和霜雲，此時國師等人為殺萬仞而至，三人逃至密室。秋生得知華北雙鷹被殺，把背叛的活財神殺掉，大漠神龍出現與他交手，事後秋生發現黃龍劍劍鞘藏有十三省抗元名冊，告知張崎。天高殺光哈哈兒全族，毒如來著靈芝提醒秋生吃了未經提煉的萬年天壽根會亂性，後犧牲自己讓靈芝逃走。清蓮終肯認萬仞，三人決定一同對敵，同生共死。萬仞不敵大漠神龍，秋生和張崎趕到，秋生接了大漠神龍二十招，對方守諾放人。

國師為搶奪黃龍劍，煽動大漠神龍殺秋生。萬仞聯絡抗元領袖之一的藥王，希望他挺身而出，剛巧靈芝為製萬人迷而來偷忘憂草，藥王遂認定二人合謀。霜雲試探清蓮對張崎和秋生的看法。靈芝因製萬人迷而毁容。張崎不肯受利用，在飛霞嶺聚義堂大會上指證天高的黃龍劍是假的，被天高揭穿他與清蓮的事，指他身為忠良之後竟淫人妻女。清蓮欲殺張崎，秋生阻止，更對當日那個人是否自己似認非認，態度含糊，清蓮聲言不會善罷甘休，拂袖離去。

為了分出黃龍劍的真假，秋生要天高用劍與自己比試，此時大漠神龍出現，要跟秋生比武，張崎代秋生應戰，靈芝施放萬人迷，與秋生他們逃去。張崎愧對清蓮，並覺大勢已去，心灰意冷，有意退出江湖，秋生勸服他打消念頭。天高當選盟主，稱宋帝被元兵追殺而避走崖山，提議先到萬毒谷掘出寶藏，再到崖山勤王。國師和天高計劃殺死所有群雄，萬仞他們為阻止群雄自投網羅，兵分兩路，秋生和清蓮阻截群雄入萬毒谷，令他們暫時離去。

群雄找大漠神龍對付秋生，清蓮被打傷，秋生要幫她恢復真力，清蓮卻突稱不想再有武功，還提議一起歸隱，但秋生心繫國家，堅決要讓她恢復武功。張崎他們發現天高準備用炸藥炸死群雄，萬仞認為應讓群雄親眼看到天高引爆炸藥，當場揭穿其陰謀。張崎得知清蓮喝了有天壽根成分的血，會變得越加冷酷，繼而瘋狂。秋生阻擋群雄上萬毒谷，清蓮欲殺人，秋生為她的喜怒無常感不解。秋生重整五靈教，張崎也決定到伯顏府偷七節菖蒲替清蓮解毒。

張崎目睹伏牛雙魔姦淫婦女，教訓二人。大漠神龍生氣張崎欺師滅祖，與之交手，結果因張崎讓了自己三招而沒取其性命。伏牛雙魔擔心張崎向秋生告發他們的事，利用顏元亮和金不歡殺張崎，元亮發現張崎帶著《武穆雙絕》，帶他見一個人。伏牛雙魔入廟偷寶藏，被國師所殺，清蓮和靈芝看到天高的人偷偷埋屍，進廟查看，靈芝因阻止清蓮殺人而受傷。靈芝向萬仞表示清蓮的病發作迅速，擔心張崎再拿不到解藥，當清蓮毒發時，後果不堪設想。

元亮他們帶張崎去見元顏博，但後者已失去恢復金國山河的雄心壯志，元亮失望自盡。元顏博向張崎表明身分，兩人為抗元之事爭拗，張崎得悉宋帝被困崖山。張崎潛入伯顏府，向郡主取得七節菖蒲後還偷取烽火令，遭禁軍包圍，在不歡等人救援下逃脫。張崎託元顏博把七節菖蒲帶給秋生，自己則為了救宋帝，假冒伯顏的使者到元兵軍營，調走崖山的元兵。清蓮發狂殺人，秋生從靈芝口中得知原因及無相無極神功可壓制清蓮的毒，不惜損耗功力救她。

大漠神龍得知元顏博受託把七節菖蒲交給秋生，將之搶走。張崎因伯顏已派人把自己假冒使者一事通知各軍營，決去崖山救宋帝。群雄齊集，並為寶藏而紛紛衝進廟裡，被機關所困。大漠神龍以七節菖蒲引秋生比武，後因元顏博拿出金國令牌而讓秋生離去。為了阻止國師和天高引爆炸藥，靈芝被天高刺中，霜雲被炸死。萬仞找到機關總掣，群雄從廟中逃出，卻死於廟外的箭陣中。清蓮力戰國師和天高後失控擊襲秋生，萬仞將其擊暈，靈芝則傷重身亡。

（大結局）元顏博說出張崎往救宋帝，著秋生和萬仞助其一臂之力，後自殺請罪，以求伯顏放過元顏一族，但伯顏要大漠神龍殺掉張崎他們。秋生和張崎護宋帝離開崖山不果，張崎決定翌日逼元軍主帥張弘範退兵，萬仞因此戰吉凶難料，為了卻心事，替秋生和清蓮主持婚事。張崎以為弘範會退兵，未料上當，經一番激戰，大漠神龍不欲殺秋生及元顏一族死去，寧死於秋生劍下，陸秀夫負宋帝投海而亡，萬仞和張崎殺掉天高及國師，但張崎亦重傷戰死。