南宋末年，蒙古兵大军压境，将军张天顺为救樊城，把藏有抗元名册的黄龙剑交予偏将范国兴，再自刎让国兴带其首级投降蒙哥。多年后，范秋生趁墟时与人争执，国兴为救子被昆仑派掌门察觉身分。洪鹏飞奉朝廷密令消灭中原的抗元势力，把枢密院化为江湖帮派金乌教，并与名剑门结盟，要对方提名张崎出战名剑大会。秋生被指杀人，国兴提出疑点并调查事件，秋生跟踪，落入蛇蝎双魔手上，为仇万仞所救。万仞看见国兴，斥他是卖国贼并要杀他。

国兴拿出黄龙剑及天顺死前写的血书，万仞方知错怪对方。国兴因行藏泄露，听从万仞提议，与秋生投奔曾参加抗元工作的冯保，殊不知对方早已变节，更觊觎着黄龙剑。鹏飞要张崎参加名剑大会及得到朱雀剑。鹏飞送朱雀剑去名剑门，路上遇柳清莲追杀采花贼，青莲强行一睹朱雀剑。冯保为得黄龙剑，欲把女儿仁淑许配给秋生，国兴觉有异而推却，但冯保坚持。冯保逼国兴交出黄龙剑不遂，还被国兴杀掉。鹏飞赠剑给名剑门，掌门凌乘风亲自迎剑。

名剑门的堂主不满金乌教霸道，楚风出言安抚。秋生无意间破坏毒如来与张崎的较量，毒如来一气下打伤国兴，并以毒粉教训秋生，清莲插手，毒如来看出她是断肠谷的人，只好作罢并交出解药。张崎重遇秋生，得知国兴受伤，带秋生到名剑门拿药，秋生在名剑门险泄露黄龙剑的事，万仞及时抢走朱雀剑阻止，再把剑交给秋生。秋生谎称自己把剑抢回，并指万仞是其师傅，楚风吃惊。万仞看好秋生经琢磨后可成大器，国兴托他在自己不测时照顾秋生。

楚风和鹏飞请秋生表演万仞的绝招「一剑穿心」，秋生藉词推搪。凌夫人向秋生查问万仞的近况，并托他把一个盒子交给万仞，万仞看着盒子，前尘往事涌上心头，后暗中把盒子交还。余大海出售名剑大会的请帖而被金乌教弟子教训，秋生出手制止，对方却突然死于「一剑穿心」之下。清莲不客气地质问秋生与万仞的关系，国兴阻止，被她剑伤。秋生偷走国兴的剑，与大海共赴名剑大会。楚风担心万仞会捣乱名剑大会，毒如来谓可用子午追魂散对付。

名剑大会上，张崎突然取去秋生的剑使用，未料那是黄龙剑，众人争夺，清莲把剑抢走，却中了毒如来的毒。清莲向秋生逼问万仞的下落，万仞现身，后发现清莲的剑法与自己的一样，着她别插手他与断肠谷主的事，清莲反要他来断肠谷救秋生。名剑大会结束，楚风宣布张崎武功最高，朱雀剑归其所有，天机子质疑张崎使用蒙古武功，楚风解围。楚风捉走国兴，引万仞到名剑门，用毒将其捉住。楚风废掉万仞武功，还对他用刑，以发泄多年怨恨。

毒如来、木灵芝两师徒向清莲讨黄龙剑，不果。楚风表示计划在天下英雄面前为国兴雪冤，国兴感激。鹏飞利诱万仞归顺元朝，万仞开出条件，要他放掉国兴。鹏飞要楚风把万仞交给他，并称会带万仞出关外，替其恢复武功。毒如来师徒再向清莲讨剑，清莲不惜使出玉女散功大法吓退二人。楚风请缨与张崎请仁淑指证国兴杀死冯保，鹏飞亦称决定了带万仞回去蒙古。凌夫人发现楚风囚禁万仞，楚风表示身不由己并承诺会把万仞救出，但暗里另有盘算。

众堂主奉楚风之命劫牢并杀万仞灭口，凌夫人阻止，万仞失足掉崖。凌夫人服毒轻生，楚风急命人找毒如来解毒。张崎与毒如来师徒来抢黄龙剑，清莲因之前使用玉女散功大法致体力虚脱，未能应战，最终剑被抢走，清莲气极责罚四侍卫，四人不满。鹏飞怀疑劫牢一事与楚风有关，出言试探。万仞掉崖获救，出重金请镖师送自己到五老峯。张崎不忿楚风保管黄龙剑，鹏飞明言利用楚风后会将其杀掉。清莲猜到四侍卫要对付自己，施计逃走，却被追上。

四侍卫迫清莲交出秘笈及解药，秋生带清莲逃走时，两人有所争执，纠缠间一同滚下山坡。秋生带清莲躲进山洞，四侍卫找至，秋生打算以清莲教的救命三招一拚之际，断肠谷主柳霜云及时出现。楚风向鹏飞他们解释找岳世豪出席雪冤大会的原因，并称已有对付国兴的计划。元兵出重赏捉万仞，两名镖师发现万仞的身分，押他领赏，却于路上同被毒黄蜂她们捉走。毒黄蜂拷打万仞，突见他身上的碧玉牌，以为他是断肠谷的朋友，态度一变，还放掉他。

毒黄蜂见万仞伤重，护送他去五老峯。楚风称世豪和张崎答应在雪冤大会作公正，更指张崎是天顺之子，国兴惊喜。鹏飞向楚风解释为何要置国兴于死地，并要张崎成为世豪的女婿。霜云识破秋生非万仞徒弟，将其教训，清莲相救。万仞跪求无嗔大师救国兴遭拒，只好尽己之力，无嗔被打动，答应破例帮忙。国兴对雪冤一事作最坏打算，把后事和秋生交托大海。无嗔因误会与逍遥天尊不打不相识，天尊得知无嗔要往名剑门，欲凑热闹，无嗔劝阻。

雪冤大会上，国兴道出当年降敌的内情，并展示肩膊上插着的箭头及天顺的血书，但仍未能雪冤，此时楚风要他拿出最有力的证据黄龙剑，国兴终明白雪冤大会只是一个圈套，最终选择自刎。大海欲带国兴的尸首回乡安葬，世豪却指国兴是乱臣贼子，要其曝尸三天，大海阻止不成，后得灵芝帮忙偷尸。秋生发现黑寡妇和白姑婆用人血灌溉断肠草，阻止不成反被捉，幸得清莲相救。大海火化国兴的尸首，无嗔来到，称受万仞所托来救人，遗憾来迟一步。

无嗔到名剑门化解楚风和万仞的恩怨，鹏飞提出要他替万仞受两刀，无嗔凭着护身气功而刀剑不入，鹏飞于是向楚风拿黄龙剑对付对方。无嗔拒绝带凌夫人见万仞，此时鹏飞蒙面暗算，却刺中凌夫人。无嗔向楚风交代凌夫人遇袭身亡的经过，并指凶手用的是假黄龙剑。岳佩佩听出张崎的琴声有胡音，张崎错愕。万仞得知凌夫人和国兴的死讯，心灰意冷下欲轻生，为大海制止。无嗔点化万仞，并给他一本修心养气的经书诵读，自己代他去断肠谷找秋生。

秋生因打赌而到禁地去，结果中毒并弄毁断肠花及伤心草，白姑婆二人要杀秋生，清莲阻止。秋生因为中毒太深，清莲只能替他把毒逼至左手，虽然性命得保，但以后再也不能练武。清莲不解霜云为何一直要她杀万仞，霜云说出与万仞的恩怨。无嗔来到断肠谷，霜云与他比试输掉，答应让秋生离开。秋生请无嗔也救出谷中的人牛，霜云要无嗔闯过心魔云雨阵，无嗔要求斋戒沐浴三天再闯阵。万仞发现身上有真气乱窜，后内功恢复，才明白无嗔的苦心。

楚风得知万仞在五老峯，计划将其杀掉，与此同时，鹏飞的上级命鹏飞派张崎保护万仞，还要鹏飞调查天顺的胞弟张天义，找出真正的黄龙剑。无嗔破阵失败，得留在谷中面壁十年，他欲给秋生注入内力，教他诸天大悲神咒助他离谷，却因秋生体内的毒而未能成事，遂让他先学无相无极神功化解体内的毒，而秋生亦得悉国兴的死讯。秋生坚决要出谷替国兴报仇，清莲见状，只好帮忙。楚风带人血洗五老峯，万仞却被人救走，楚风怀疑张崎，出言试探。

张崎向万仞自称是天顺之子，并向他解释救他到名剑门的原因。清莲为秋生偷取醒魂丹助他离谷，另方面，秋生心急，自行出谷，遭白头弃妇阻拦，清莲赶至帮忙却不敌，霜云突然下令放秋生离谷。天机子逼问秋生黄龙剑的所在，却因秋生全身有毒而中毒死去。楚风确认是张崎救走万仞，欲逼他把人交出，张崎把万仞带走，楚风吩咐毒如来追杀张崎。秋生到名剑门，看见国兴的灵位，楚风指是张崎及世豪逼死国兴，并为了引出万仞，劝秋生暂时住下。

张崎和万仞前往岳家堡，毒如来追杀两人，被张崎打败。清莲和霜云因秋生而争执，之后清莲内伤发作，拒让霜云医治，霜云气其不识好歹。万仞二人中了毒如来的毒，为沿途暗中保护他们的上官虎及上官龙所救。仁淑要杀秋生报仇，楚风阻止，还劝她放下仇恨。毒如来用计引开上官虎二人，再对付万仞和张崎，万仞用尽所恢复的功力将其打伤，楚风惊闻万仞功力未失。万仞二人到达岳家堡，世豪征求名医为万仞治内伤，张崎指万仞重伤是楚风所为。

张崎透露楚风卖国投元，世豪欲联络各大门派讨伐名剑门，万仞劝其别轻举妄动。灵芝和仁淑为秋生争风呷醋，灵芝欲与仁淑较量，却误伤秋生，急忙找毒如来救人。毒如来因秋生中了断肠花毒，为增加功力，要吸秋生的血，灵芝阻止。无嗔察觉清莲受了严重内伤，运功替其疗伤，并劝她放下屠刀。逍遥天尊假扮太湖医隐，应征医治万仞并将其劫走，世豪从天尊的功夫识穿他的身分。张崎往救万仞，发现万仞得天尊所救，伤势差不多复元。

天尊的小妾发现张崎耳后有反骨，觉他不可靠，告知天尊。黑寡妇和白姑婆到名剑门找万仞，看见秋生，还与楚风交手。万仞回岳家堡，天尊着他提防张崎及算出他将会骨肉相残。楚风藉词仁淑已被冯保许配给秋生，为两人作主，想秋生交黄龙剑作聘礼，秋生猜测国兴的死与黄龙剑有关。秋生不信任楚风，离开名剑门。清莲担心秋生，恰巧霜云要她出谷杀万仞，并给她一个玉葫芦。楚风计划利用秋生送毒信给万仞，鹏飞盘算借计挑拨岳家堡和名剑门。

秋生遇上有人被元兵追杀，受托把一封信交给万仞。清莲到名剑门，得知秋生往岳家堡找万仞。秋生来到岳家堡，一看见张崎即要杀他为国兴报仇，张崎指他被楚风骗了。万仞发现秋生带来的信是写给世豪，世豪阅信，双眼中毒受伤。楚风不解何故是世豪中毒，着毒如来去替世豪医治，鹏飞气愤他不敢攻打岳家堡。张崎得知鹏飞把毒信掉包及其盘算，却未能煽动世豪攻打名剑门。清莲要世豪交出万仞及秋生，得知世豪双眼受伤后，称三天后再来讨人。

佩佩偕文、武总管请清莲别再到岳家堡遭拒，与之交手却不敌，张崎及时相救，之后清莲打败张崎，张崎相约明晚再比试。毒如来师徒到岳家堡找世豪，世豪疑惑两人来意，遂不动声色，凭听声辨位佯装双目能视，但最终因喝酒而露馅。张崎再输给清莲，约她翌晚再比试。毒如来为世豪医眼，却因灵芝趁机去救被关着的秋生，被误会真正的来意是劫牢，遭世豪下逐客令。张崎与清莲比试，因留手而不敌，得护国剑师救走，但被指爱上清莲，张崎否认。

万仞找来天尊替世豪医眼，但天尊也无能为力。清莲再到岳家堡，世豪以勾刀阵和梅花枪对付，万仞受秋生所托，出手救清莲，清莲约万仞七天后决斗。世豪因万仞求情并发毒誓力证国兴是忠良，答应暂时释放秋生，但要他在毒瞎自己一事查明前，不可离开岳家堡。万仞希望秋生和张崎化敌为友，收两人为徒。天尊看出秋生是武学奇才，帮助万仞教导他，对其大表关心，秋生透露想见清莲。清莲夜探岳家堡救秋生，却听到他说自己的坏话，气恼离开。

秋生偷偷出岳家堡见清莲，遇到灵芝，清莲看见灵芝也在，赶二人离开。灵芝忆述国兴的死，秋生为了去找大海拿回国兴的骨灰安葬，回岳家堡向万仞辞行，世豪不允秋生离开，天尊与之交手，眼看世豪将要不敌，万仞赶急解围，最终世豪让天尊带走秋生。佩佩对万仞有好感，国师要张崎加紧追求，承诺事成后把清莲送给他。天尊的小妾欲与秋生亲热，灵芝将其刺伤并带走秋生。鹏飞派人抢走楚风的女儿凌翠儿并陷害岳家堡，图迫使楚风攻打对方。

秋生和灵芝到客栈投宿，看到毒如来，两人假装兄妹，与之住同一客栈。秋生毒发，灵芝替他吸出毒血后晕倒，秋生为让毒如来救灵芝，答应一生不见她并写下绝情字条。楚风为救翠儿，不惜以双眼交换，被鹏飞制止。秋生混入名剑门带仁淑离开，并送她去投靠南宫霸天，刚巧清莲带药给霸天，看见二人。楚风在房间发现翠儿，但此时她已饱受折磨，经大夫诊治后虽保住性命，但双眼瞎掉，手脚残废，还身中万箭穿心毒，楚风痛恨世豪残忍。

楚风不忍翠儿受苦，忍痛给她解脱。秋生从霸天口中得知清莲要与万仞决斗，赶往阻止，仁淑追上。仁淑被杀，秋生被怀疑谋财害命而遭通缉。秋生未能见到清莲，到岳家堡欲见万仞，世豪因万仞正在坐关而阻止。楚风誓要铲除岳家堡，并派人捉佩佩及取万仞首级。佩佩带秋生见万仞，万仞拒绝放弃决斗，并因秋生闯入而乱了心神，佩佩以琴音助其安神，期间被袭击，得张崎保护。秋生偷听得三位堂主要对付万仞，赶去决斗之地通知，突被官兵捉走。

万仞和清莲决斗，名剑门三名堂主趁机偷袭，清莲相助万仞，佩佩却误会是她把万仞刺伤，万仞为清莲澄清。世豪想讨伐名剑门，万仞觉一切事像是有人刻意安排的圈套，提议他约楚风当面对质。世豪派人送信约见楚风，楚风因记恨翠儿之事本回绝，后回心转意。国师看出张崎对清莲的感情，提醒他以国家为重，多花工夫在佩佩身上。秋生遭霸天嫁祸觊觎仁淑的家财而谋财害命，霸天还贿赂县官将其斩首，此时国师却要带秋生去黑石岛找稳如山。

佩佩悉心照顾万仞，万仞却向她称赞张崎，佩佩不悦。世豪和楚风见面，两人当面对质，楚风否认毒瞎世豪双眼，世豪亦不承认加害翠儿，还要楚风别做胡人的走狗，楚风气极要杀世豪，被万仞阻止，事后楚风誓言铲平岳家堡。世豪闻悉佩佩常待在万仞房间，心感不妥，对佩佩加以提醒。秋生和黄豹被押往黑石岛，路上两人施计逃脱，之后黄豹因无法砍断连着两人的手铐，欲砍下秋生的手，两人纠缠，最后被官兵发现。

秋生和黄豹被官兵捉回，还重遇大海。大海行贿救秋生不成，遇到清莲，与之一同去黑石岛救秋生。鹏飞为攻打岳家堡，请来无为书生和阴阳才子帮忙。秋生在黑石岛被安排负责送饭给如山，如山见其手掌异常，认定他练了邪派毒掌，于是封其穴道，要他被自己的毒毒死。秋生毒发，痛苦难当下练习无嗔的心经。世豪想把佩佩许配给张崎，请万仞做媒，佩佩和张崎因心有所属而暗自神伤。如山疑惑秋生没有死去还功力大增，测试他的身手，突遇暗算。

如山杀掉暗算自己的杀手。佩佩向万仞表白，因万仞拒绝私奔而离家出走，阴阳才子和无为书生遇到佩佩，利用迷魂大法得知她为了万仞而出走，时万仞寻至，打退二人。佩佩因万仞表示对自己只有叔侄之情，难过下回去岳家堡。佩佩和张崎过文定之日，阴阳才子和无为书生不请自来，还讥讽万仞。如山发现自己一直错怪秋生，对方并非国师派来的奸细，于是道出与国师的恩怨，还愿意教秋生武功及一同离开黑石岛，此时清莲来到岛上救秋生。

国师用计令清莲与如山交手，趁机袭击如山，秋生因如山被清莲所伤，生气下拒跟她离去。如山和秋生躲进山洞，国师打算炸开洞口，如山把握时间教秋生九忧神剑的头四式及第九式。楚风进攻岳家堡，鹏飞要张崎他们誓死保护，还下令乌金教撤退，要名剑门鸡犬不留，结果名剑门灭门，而张崎因楚风要胁，担心身分被泄露，故意将楚风放走。如山冲出山洞与国师交手，并向秋生展示九忧神剑第五至八式后，把他打下海，自己则死于国师手中。

楚风到断肠谷怂恿霜云抢夺黄龙剑，当武林盟主，霜云以为他想主使女人做事，大数其罪状后与他比武，楚风不敌，被刺入三支子午断魂针于穴道中，只要一拔出就会武功尽失。秋生漂流到荒岛，遇到天义，天义得悉国兴含冤而死及侄儿张崎仍然在生。楚风在断肠谷做人牛，无嗔表示要救他脱离苦海。秋生和天义回到中原，即被鹏飞带人袭击，天义认出鹏飞是蒙古一员大将。张崎和佩佩成亲，二人向万仞敬茶，万仞送佩佩玉佩留念，此时天义到贺。

天义澄清国兴非卖国贼，世豪自责冤枉国兴，请秋生为父报仇，秋生没有理睬，世豪欲自行了断，被万仞劝阻。张崎担心被天义发现假冒天顺之子，谁料天义竟与他叔侄相认。无嗔替楚风求情，希望霜云放过楚风，却被要求自断一臂。无嗔发现楚风心中仍有恶念，要他跟随自己参禅，并答应霜云要求，愿自断一臂，楚风阻止，霜云料不到无嗔愿意自残躯体，决定把楚风交给他。万仞与清莲决斗之日来到，清莲却病得昏倒，被无为书生和阴阳才子掳走。

万仞和秋生先后得知清莲被掳走，赶往营救，期间秋生误打清莲一掌，万仞以内力护住清莲心脉，再替她运功。阴阳才子和无为书生以邪音扰乱万仞的心神，欲令他走火入魔。霜云认定楚风是有仇必报的小人，楚风反唇相稽，指她可能因爱成恨才要杀万仞，霜云欲杀楚风，无嗔阻止。张崎得知万仞去救清莲，赶往接应，以金牌命令阴阳才子和无为书生离开。天义认出张崎的老仆张忠是投元的千面书生，加以查问试探，却未能证实。

由于秋生身上有断肠草毒，被打了一掌的清莲亦因此中毒，要断肠花才能解，张崎埋怨秋生卤莽大意，惹清莲不悦。大海向秋生说出国兴临终前的吩咐，要把其骨灰带回乡下，葬于家后三棵松树下。楚风背上的断魂针毒发，无嗔见他痛改前非，替他逼出毒针。世豪为了赎罪，欲收秋生为义子及为国兴雪冤，秋生却不领情。国师刺杀天义，佩佩偷看到他获张崎暗中放走。万仞到断肠谷为清莲拿解药，霜云质问他当年有妻室为何仍与她亲近，毁其贞节。

万仞解释此行除了是拿解药，还想向霜云请罪，但霜云声言永不原谅他，还要他闯过心魔云雨阵来换取解药。佩佩听到张崎酒后说出并非想杀天义，告知世豪并道出张崎放走国师一事，世豪着她注意张崎的一举一动。万仞闯阵时杂念丛生，险走火入魔，得无嗔助一臂之力，终成功破阵，霜云答应交出解药。佩佩发现张崎骗天义一起外出，觉事有蹊跷，国师袭击天义，佩佩带秋生他们赶至，国师因他们人多势众而逃去，事后佩佩对着张崎却不动声色。

世豪他们布局令张崎露出真面目，张崎遂自揭是元朝勇士，世豪要杀张崎，天义以张崎左背上的疤痕力证他是张家后人，此时阴阳才子突暗算张崎，天义舍身相救。万仞拿解药回来，但清莲指两人的决斗势所难免。张崎在天义灵位前忏悔，请他在天之灵助自己杀尽元贼，为父报仇。世豪拒绝归顺元朝，为免祸及无辜，决火烧岳家堡离开。国师等人追杀世豪他们，天尊及时率众救援，并让众人于幽冥山庄落脚，秋生和张崎决先去安葬国兴后再会合众人。

世豪欲召集各省英雄到幽冥山庄商讨抗元大计，国师命人造谣指岳家堡勾结魔教。秋生得知霸天当日陷害自己，霸天否认，并趁清莲阻止秋生带自己与县官对证之际逃走，张崎追截，最后为了清莲将其放走。各省英雄拒来商讨抗元大计，万仞认为主因是他们没有黄龙剑。张崎向清莲透露霸天未死，清莲感激，但对秋生余怒未消。国师伏击秋生和张崎，大海找清莲帮忙，三人合力击退国师。国师要霸天宴请清莲和张崎，对二人使用迷药，霸天被迫答应。

霸天骗清莲和张崎喝下加了迷药的茶，最终张崎把持不住，霸天则被国师灭口。清莲醒来看见秋生，误会是他与自己发生关系，问他何时迎娶自己，秋生却称没有想过，清莲大怒，声言今后不想见到他后离去。国师要鹏飞假传消息指岳家堡变成五灵教分舵，世豪却以为是天尊所为，与之闹翻。世豪带佩佩等人离去，被怀有五灵教令牌的黑衣人袭击，飘絮草堂主人皇甫天高的手下白衣使者和黄衣使者赶至相助，惜来迟一步，世豪被杀。

张崎良心不安，欲向秋生坦白对清莲所做的事，但终究未能启齿。张崎偷听得鹏飞要从天尊手上救回被掳的蒙古郡主，有所盘算，向秋生道别后给天尊通风报信，两人施计歼灭鹏飞等人，事后天尊却发现郡主被张崎带走。秋生和大海回到乡下，得知家中松树被砍掉，遂另找地方安葬国兴的骨灰。佩佩等人来到飘絮草堂，却未能见到天高。郡主带张崎到京都帅府，张崎夜闯帅殿被擒，得郡主相救。秋生和大海来到幽冥山庄，此时天高下战书约天尊决斗。

天尊占卜出与天高一战大凶，把一个锦盒交给秋生，吩咐他在自己死后才可打开。张崎潜入殿中行刺伯颜，但等着他的是一直蒙面示人的国师，而对方原来就是张忠。国师与伯颜游说张崎归顺，不但让他看天顺的头颅，还威胁公开他毁了清莲贞节之事。霜云怪责清莲爱上秋生，清莲欲一死以谢霜云，霜云阻止，着她加紧苦练武功找秋生报仇。天尊向佩佩表明没暗杀世豪，天高却拿出黑衣人掉下的五灵教令牌，天尊测试天高身手，领教到他的金刚神掌。

天尊察觉天高的金刚神掌夹杂一种阴柔内劲，要佩佩转告万仞，其后天高在决斗中使出黄龙剑，天尊不敌而退。天高游说佩佩广招天下英雄，完成志豪的抗元遗志。张崎答应为伯颜做事，但要他保守自己的一切秘密。天尊撑着一口气见万仞和秋生，但只说了黄龙二字就死去。清莲苦练断情绝义剑，性格变得更冷酷无情。秋生打开锦盒，发现五灵教信物五灵符，天尊两位小妾劝服秋生答应做五灵教教主，并料到五灵使者会要他过生死门，教他飘凌步法。

秋生成功破了生死门，成为五灵教教主。天高以佩佩的名义在飘絮草堂召开英雄大会，天下英雄陆续齐集。秋生质问天高为何杀天尊，天高拒认杀人。天高虽担心万仞和秋生的出现会影响行动，但要待所有抗元分子到齐才将他们一起剿灭，并在适当时机才拿出黄龙剑及要张崎证明剑是真的。清莲练成断情绝义剑第十二重，出谷找万仞决斗，无嗔希望霜云放过万仞，但她坚持万仞定要死在清莲手上。无嗔把真气传给楚风，着他出谷阻止清莲和万仞决斗。

佩佩向万仞转达天尊的说话。龙五游说群雄选天高为盟主，质疑万仞可能欺世盗名，还当面挑衅秋生。秋生欲离开草堂，万仞提醒他此行的目的。龙五要张崎监视万仞，并在时机成熟时证明国兴的黄龙剑是假的。天高欲推举张崎当盟主，但万仞向群雄提出拯救文天祥，天高未能拖延行动，只好趁混乱放出信鸽，希望国师及时得到消息。清莲到幽冥山庄找不到万仞，杀了两名冲撞她的五灵使者。天高派手下假扮五灵教弟子攻打北绿林十八寨，嫁祸秋生。

万仞以声东击西之计，处处牵制伯颜他们，但秋生没有等万仞他们到来会合，已把天祥救走，此时北绿林寨主来寻仇，国师突出现掳走天祥，大海为救秋生而被国师杀死。国师逃走，遇楚风拦阻，万仞赶至，两人一同对付国师。秋生欲杀楚风为国兴报仇，万仞劝阻，楚风跪谢。天高自荐当盟主并亮出黄龙剑，楚风澄清国兴非卖国贼，天高反质疑其居心，煽动群雄将其处决，万仞阻止。秋生质疑天高的黄龙剑是假的，天高却得到张崎作证，获群雄追随。

张崎解释为天高的假黄龙剑作证的原因，楚风提议众人搬往名剑门荒废的分舵洛鹰峡落脚。秋生因大海、国兴、仁淑的死而自责，耍剑发泄，意外练成刚烈的九忧剑法，佩佩建议取名怒剑九式。清莲要各门派在三月十五日英雄大会前找到万仞，否则每天杀一人，令人人自危。张崎担心假黄龙剑亮相后，十三省抗元英雄会有危险，万仞和楚风欲向武当掌门揭露天高的阴谋，不料被对方在茶里下蒙汗药，万仞着楚风先走，自己却因不敌武当棍阵而被擒。

万仞被押去飘絮草堂，途中被假冒的五灵教弟子刺杀，秋生和张崎及时相救。张崎断发为誓，要与国师同归于尽，佩佩给他世豪留下的秘笈，张崎苦练刀枪，并得万仞指点。国师对付清莲，藉领教她的武功让阴阳才子和无为书生在食水和食具下毒。秋生希望清莲别找万仞决斗并答应娶她，却在清莲对他出手时将她误伤，时楚风来到，发现清莲中毒，只有毒如来能解。秋生替清莲拿解药，楚风希望他回来后能与清莲和好，清莲却称宁死也不领秋生的情。

清莲激动得欲自刎，楚风点其睡穴。霜云得知清莲中毒，决定出谷，无嗔自知时日无多，托她转告楚风在他死后重整五老峯。秋生到万毒谷找毒如来，闯进万箭穿心迷魂阵，得毒如来的仇敌哈哈儿相救。佩佩怀孕，张崎先喜后忧。张崎试出龙五对自己的秘密一无所知，把他交给万仞，揭发他是元朝奸细及五大派将会进攻洛鹰峡，众人分批由秘密通道撤走后再折返。秋生再闯万毒谷，成功通过万箭穿心迷魂阵，却掉进陷阱，灵芝认不出洞里的人是秋生。

清莲遭丐帮寻仇，楚风奋力保护却不肯杀人，霜云赶到。霜云感谢楚风照顾清莲，但坚持非杀万仞不可。国师吩咐天高率群雄再闯洛鹰峡，顺便打探龙五的消息。万仞得知霜云出谷，并执着要找自己报仇，决定与楚风去见她，临行前着佩佩继承志豪遗志，并提醒张崎别做遗臭万年之事。秋生练成无相无极神功第九重，冲出陷阱，哈哈儿也从灵芝手上取回毒如来偷去的五色神龙。五派攻入洛鹰峡，张崎杀掉五派的人及龙五，并放走天高，之后两人见面。

清莲痛苦难当，但霜云拒给她服食不可恢复功力的九转大还丹，决定必要时亲自去找毒如来，此时万仞和楚风来到，万仞劝霜云别要清莲跟他决斗，不果。秋生为取万年天寿根救清莲，再去万毒谷，与灵芝重遇，秋生向她解释当日的事。毒如来假装同意给秋生一点万年天寿根，骗其服下没有解药的四魂散，灵芝为救秋生，趁毒如来下山找五色神龙时，到炼丹室偷万年天寿根，毒如来得悉折返。灵芝带秋生躲进密室，毒如来要灵芝交出万年天寿根。

灵芝给秋生服食万年天寿根，如来气得要吸光秋生的血，被秋生打伤，灵芝带秋生离开。万仞去万毒谷找秋生，路上遇到秋生二人，万仞告知秋生要找出真黄龙剑揭穿天高的阴谋，二人想到剑可能藏在秋生家乡的三棵松树下。国师和阴阳才子、无为书生伏击霜云母女，秋生三人来到，国师胁持灵芝，让阴阳才子二人带走霜云。阴阳才子对霜云使用迷魂大法，得知清莲是万仞的女儿，为楚风听到。楚风和张崎救走霜云，霜云劝楚风回谷见无嗔最后一面。

秋生不解清莲为何恨自己，万仞提醒他国难当前，别太看重儿女私情，应先找出黄龙剑。张崎向国师保证会令万仞出席英雄大会及指证对方，条件是事成后要让他成为盟主及在英雄大会前不找万仞麻烦。楚风回谷见无嗔，时天高率五派血洗断肠谷，无嗔使出金刚蝉寒，耗尽真力而圆寂。霜云母女回谷，楚风因霜云仍不让清莲服用九转大还丹，道出翠儿的事，霜云不为所动。清莲拒服九转大还丹，霜云点穴强迫她吃，时秋生来到，欲用自己的血救清莲。

万仞和张崎混入元兵军营，终于找到黄龙剑。清莲因秋生救了自己，决定下次才杀他。清莲现身英雄大会与万仞决斗，楚风来到，在万仞耳边说出真相，万仞向霜云查问，突然清莲一剑刺来，楚风舍身救万仞，死前向清莲道出万仞是其亲父。群雄追究五灵教偷袭十八寨，残杀抗元志士的事，张崎亮出黄龙剑，相约群雄一个月后到飞霞岭。清莲生气被霜云利用，决定回谷，从此不再踏足江湖。天高捉走佩佩，希望她以岳家后人名义与他们一起高举义旗。

秋生他们到飘絮草堂救人，张崎暗中用计引开国师，但最终只救出灵芝、如剑、如虹。秋生着如剑二人回去断肠谷，而灵芝因秋生对清莲一往情深，决定返回万毒谷。国师要万仞他们用黄龙剑交换佩佩，张崎不肯，后留书独自去救佩佩，并于信中向秋生坦白污辱了清莲一事。国师向佩佩说出张崎污辱了清莲，但佩佩不怪张崎，还为了不负累他而自尽，万仞和秋生赶至襄助张崎，国师逃脱。国师打算利用张崎的师傅大漠神龙对付秋生三人。

佩佩自知药石无灵，表示原谅张崎，张崎亦承诺会完成世豪的遗志，努力抗元，最后佩佩于张崎的琴声中离世。张崎希望为佩佩守坟一段日子，把黄龙剑交给秋生，万仞着秋生携剑联络华北双鹰和活财神，自己则去断肠谷。灵芝回到万毒谷，发现毒如来因被秋生打了一掌而触发旧患，幸得哈哈儿不念旧恶，定时拿五色神龙的血给他续命。国师到绝谷找大漠神龙，指张崎已投入万仞门下及入赘岳家，尽得武穆双绝精华，又藉过招引起他对秋生的兴趣。

万仞来到断肠谷，清莲怨恨他和霜云，此时国师等人为杀万仞而至，三人逃至密室。秋生得知华北双鹰被杀，把背叛的活财神杀掉，大漠神龙出现与他交手，事后秋生发现黄龙剑剑鞘藏有十三省抗元名册，告知张崎。天高杀光哈哈儿全族，毒如来着灵芝提醒秋生吃了未经提炼的万年天寿根会乱性，后牺牲自己让灵芝逃走。清莲终肯认万仞，三人决定一同对敌，同生共死。万仞不敌大漠神龙，秋生和张崎赶到，秋生接了大漠神龙二十招，对方守诺放人。

国师为抢夺黄龙剑，煽动大漠神龙杀秋生。万仞联络抗元领袖之一的药王，希望他挺身而出，刚巧灵芝为制万人迷而来偷忘忧草，药王遂认定二人合谋。霜云试探清莲对张崎和秋生的看法。灵芝因制万人迷而毁容。张崎不肯受利用，在飞霞岭聚义堂大会上指证天高的黄龙剑是假的，被天高揭穿他与清莲的事，指他身为忠良之后竟淫人妻女。清莲欲杀张崎，秋生阻止，更对当日那个人是否自己似认非认，态度含糊，清莲声言不会善罢甘休，拂袖离去。

为了分出黄龙剑的真假，秋生要天高用剑与自己比试，此时大漠神龙出现，要跟秋生比武，张崎代秋生应战，灵芝施放万人迷，与秋生他们逃去。张崎愧对清莲，并觉大势已去，心灰意冷，有意退出江湖，秋生劝服他打消念头。天高当选盟主，称宋帝被元兵追杀而避走崖山，提议先到万毒谷掘出宝藏，再到崖山勤王。国师和天高计划杀死所有群雄，万仞他们为阻止群雄自投网罗，兵分两路，秋生和清莲阻截群雄入万毒谷，令他们暂时离去。

群雄找大漠神龙对付秋生，清莲被打伤，秋生要帮她恢复真力，清莲却突称不想再有武功，还提议一起归隐，但秋生心系国家，坚决要让她恢复武功。张崎他们发现天高准备用炸药炸死群雄，万仞认为应让群雄亲眼看到天高引爆炸药，当场揭穿其阴谋。张崎得知清莲喝了有天寿根成分的血，会变得越加冷酷，继而疯狂。秋生阻挡群雄上万毒谷，清莲欲杀人，秋生为她的喜怒无常感不解。秋生重整五灵教，张崎也决定到伯颜府偷七节菖蒲替清莲解毒。

元亮他们带张崎去见元颜博，但后者已失去恢复金国山河的雄心壮志，元亮失望自尽。元颜博向张崎表明身分，两人为抗元之事争拗，张崎得悉宋帝被困崖山。张崎潜入伯颜府，向郡主取得七节菖蒲后还偷取烽火令，遭禁军包围，在不欢等人救援下逃脱。张崎托元颜博把七节菖蒲带给秋生，自己则为了救宋帝，假冒伯颜的使者到元兵军营，调走崖山的元兵。清莲发狂杀人，秋生从灵芝口中得知原因及无相无极神功可压制清莲的毒，不惜损耗功力救她。

大漠神龙得知元颜博受托把七节菖蒲交给秋生，将之抢走。张崎因伯颜已派人把自己假冒使者一事通知各军营，决去崖山救宋帝。群雄齐集，并为宝藏而纷纷冲进庙里，被机关所困。大漠神龙以七节菖蒲引秋生比武，后因元颜博拿出金国令牌而让秋生离去。为了阻止国师和天高引爆炸药，灵芝被天高刺中，霜云被炸死。万仞找到机关总掣，群雄从庙中逃出，却死于庙外的箭阵中。清莲力战国师和天高后失控击袭秋生，万仞将其击晕，灵芝则伤重身亡。

（大结局）元颜博说出张崎往救宋帝，着秋生和万仞助其一臂之力，后自杀请罪，以求伯颜放过元颜一族，但伯颜要大漠神龙杀掉张崎他们。秋生和张崎护宋帝离开崖山不果，张崎决定翌日逼元军主帅张弘范退兵，万仞因此战吉凶难料，为了却心事，替秋生和清莲主持婚事。张崎以为弘范会退兵，未料上当，经一番激战，大漠神龙不欲杀秋生及元颜一族死去，宁死于秋生剑下，陆秀夫负宋帝投海而亡，万仞和张崎杀掉天高及国师，但张崎亦重伤战死。