두온마을을 보지 못하게 된 이후 2년... 여전히 정의로운 사기꾼(?)으로 살아가며, 불쌍한 사람은 절대 그냥 지나치지 못하는 김욱! 하지만 정작 본인의 월세는 제때 내지 못 해 맨날 종아에게 구박만 당한다. 결국 '더 이상 돈 안 되는 일만 하면서 살 수 없다' 선언하며 판석과 '탈 정의!'를 외치지만, 거부할 수 없는 내추럴 본 오지랖으로 보이스피싱에 당할 뻔한 명자를 구해주려 하고. 판석 역시 명자가 20년 전에 실종된 딸 은희를 찾기 위해 전국을 떠돌던 실종자 가족임을 깨닫고 그냥 지나칠 수 없게 되는데...

'두온마을 같은 곳이... 또 있어...?' 오일용에 이끌려 또다시 망자(亡子)들의 마을, 3공단에 오게 된 김욱과 판석. 그곳에 정말로 명자의 딸, 은희가 있다. 그리고... 이곳에서 현지에 관한 놀라운 이야기를 듣게 되는데...! 한편, 김욱과 판석 그리고 종아는 실종된 양은희를 찾기 위해 실종 전담반 형사 준호와의 은밀한 공조를 시작한다. 사라진 시체, 끊긴 마지막 기억! 마지막 퍼즐 한 조각을 맞추기 위해 김욱은 도박을 걸기로 한다.

은희 사건을 해결하자마자 김욱이 향한 곳은 교도소! 자신의 엄마를 죽인 것도 모자라 2년 전, 여나와 남국이까지 죽인 이동민! 하지만 그를 만나러 간 곳에서, 김욱은 뜻밖의 인물과 마주치게 된다. 한편, 사라진 세영의 수사에 박차를 가하는 준호. 그날 밤, 3공단에는 고등학교 교복을 입은 단정한 모범생 승재가 새로 들어오는데...

김욱을 향해 '아빠'라고 부르는 보라의 등장으로, 판석과 종아 그리고 김욱까지 셰어하우스 모두가 발칵 뒤집힌다. 자신을 세영의 딸이라고 소개하는 보라의 말에 김욱의 표정은 알쏭달쏭하기만 하다. 하윤과의 약속이 있는 판석은 3공단으로 향하고, 전혀 생각지도 못 한 선물과 마주하게 된다. 한편, 실종된 세영에게서 전화 한 통이 걸려오고! 실종전담반은 공개수사를 하기로 하는데!

모든 현장의 목격자, 오일용! 김욱은 숨기는 것이 잔뜩 있는 일용이 장도리 일당과 한패가 아닌지 의심스럽고 수상하기만 하다. 한시가 급한 세영의 실종수사는 마약반 수사와 충돌이 일어나며 난항을 겪게 되고, 세영의 생사는 점점 불투명해진다. 한편, 3공단에 또다시 새로운 망자가 들어오고 우연히 그와 마주친 김욱! 그런데 세영을 납치한 범인? 자신을 알아보는 김욱에 도망치는 남자. 심지어 앨리스가 마을에서 사라지는 일까지 일어나는데...

수상한 통통배와 발자국! 무사히 앨리스를 찾았다는 안도감도 잠시, 김욱은 강선장이 뭔가 숨기고 있다는 생각을 하게 되는데... 고상철은 일용의 도움으로 충격에서 벗어나 3공단에 적응하기 시작하고, 김욱에게 마약 수사와 관련된 정보를 건네며 산자와 망자의 비밀스러운 공조가 시작된다. 한편, 3공단에서는 일 년 중 가장 큰 행사인 운동회 준비가 한창이고... 실종전담반에는 로하의 실종 신고가 접수된다.

"나도... 살인자예요" 충격적인 일용의 고백. 드디어 밝혀진 일용의 과거에 김욱은 혼란스럽다. 실종전담반과 마약반은 마침내 골리앗의 정체를 알아내고! 대대적인 조직 소탕 작전을 실시하지만 정작 김필중의 행방은 오리무중이다. 한편, 수수께끼 같은 로하의 그림을 본 판석은 생각에 잠기고 그림에 숨겨진 비밀을 서서히 깨닫는다. 드디어 모두가 기다리던 3공단 운동회 날, 달리기 1등을 간절히 바라는 로하가 출발선에 서는데...

3공단의 운동회가 무사히 마무리되는 듯했던 그때, 하윤이와 영림이 사이에 소란이 일어난다. 당황한 김욱은 하윤이를 말려보려 하지만, 쉽게 진정되지 않는다. 강선장은 기억의 방에서 도난 사건이 일어났음을 알게 되고, 고민 끝에 고상철에게 마을의 단속을 부탁한다. 강선장의 부탁을 받은 고상철은 마을 곳곳을 은밀히 관찰하다가, 일용의 동선에 수상함을 느끼기 시작하는데...!

일용의 비밀을 알게 된 3공단 마을 사람들! 모든 사실을 알고 있었던 강 선장은 마을 사람들의 타깃이 되어 공격을 받는다. 보다 못한 김욱은 마을 사람들을 불러 특별한 제안을 하고. 준호는 이동민이 김욱에게 보내온 편지와 일용을 통해 알게 된 이야기들을 들은 뒤 조직의 사내들을 추적하기 시작한다. 한편, 앨리스에 이어 하윤이까지 납치했던 최영배를 한시라도 빨리 3공단에서 내보내기 위해 김욱, 판석, 종아 삼총사는 다시 한번 계획을 짜는데...

눈앞의 김필중을 허무하게 놓쳐버린 김욱과 일용! 그들에게서 도망친 김필중은 뜻밖의 장소에 다다르게 되는데...! 판석은 하윤과 영림이 실종되던 당시의 상황에 대해 자세하게 알아보기 위해 혜주에게 미술 치료를 부탁하고, 종아 역시 범인을 특정하기 시작한다! 가라앉은 마을 분위기를 띄우기 위해 캠핑에 도전한 3공단 사람들, 하지만 어김없이 이별의 시간이 찾아온다.

삼총사와 준호의 공조로 연쇄살인범 김건주를 검거하는 데 성공하고, 판석은 하윤과 영림의 마지막을 함께하기 위해 서둘러 3공단으로 향한다. 일용은 자신이 보는 또 다른 망자들의 세계를 김욱에게 소개하지만... 김욱은 볼 수가 없다. 왜 3공단은 보이고 다른 곳은 안 보이는 것일까, 고민하던 김욱은 일용과 함께 꿈속의 여자가 사는 집을 찾아가는데...!

괴한에게 습격당한 준호! 모든 일의 배후를 이동민이라고 생각하고 추적에 나서지만, 상황은 복잡하게 꼬여버리고 충격적인 현장을 목격하게 되는데... 3공단을 보게 된 이유를 궁금해하는 김욱을 보며, 일용은 그동안 숨겨왔던 이야기를 털어놓는다. 한편, 꿈속에 나오는 여자의 집을 들어가지 못하는 일용에 대해 계속해서 고민하던 김욱이 드디어 실마리를 풀어가려 하는 그때! 일용에게 뜻밖의 변화가 생기기 시작한다.

김욱은 일용의 위치를 찾아내지만, 이미 일용의 심장 박동은 멈춰져 있다. 일용과 마지막 인사도 제대로 하지 못한 채 떠나보낸 강 선장도 마음 아파하고. 판석은 지난 30년간 강 선장과 가족들의 제사를 챙겨준 임씨 부부에게 감사의 표시라도 하기 위해 찾아가지만, 오히려 그들에게 출처가 불분명한 돈을 받게 된다. 돈을 다시 돌려주기 위해 김욱과 판석, 종아는 다시 한번 임씨 부부를 찾지만 그곳에서 꿈에도 생각하지 못한 모습을 보게 되는데...!

발견된 강선장의 시체! 하지만 여전히 그녀가 3공단에 머무르고 있는 이유는 무엇일까.

일용은 죽을 고비를 넘기고 극적으로 살아나지만 그 순간, 흔적도 없이 사라져버린다!

김욱과 판석, 종아 그리고 준호는 이 모든 일을 꾸며낸 노윤구를 추적하기 위해 마지막 공조를 시작하는데...