Banni du village par le chef Pondo, Korg veut se venger alors il envoie une armée d'animaux à l'attaque. Il exige alors que Pondo démissionne et le nomme le nouveau chef ou il ramènera ses animaux et détruira le village. Tor, ne voulant pas que ses amis soient blessés, se transforme en Mightor et se bat avec Korg.

Tom, Tubb et Scooby font du ski nautique derrière leur ami Moby lorsqu'ils remarquent ce qui ressemble à une capsule spatiale sur le point de s'écraser dans l'océan. Manta Menace attend la capsule et son contenu : les cartes secrètes des mines de diamants de Mars. Les garçons voient la capsule couler et demandent à Moby de les emmener afin qu'ils puissent enquêter.

Les Hommes Tigres décident d'attaquer les hommes des cavernes car leur dieu exige un sacrifice. Les Hommes Tigres capturent Tor et pour le punir d'avoir alerté les autres, l'emmènent dans l'arène. Tog doit obtenir le club de Tor avant que le tigre à dents de sabre ne le fasse entrer dans l'arène.

Sheera est kidnappée par l'un des subalternes de la Reine Serpent pour être transformée en son esclave. Lorsque Pondo et Tor découvrent que Sheera a disparu, Tor part chercher de l'aide. Lorsqu'il est hors de vue, il se transforme en Mightor et retourne à Pondo pour offrir son aide.

Tom demande à Moby de l'emmener Tubb et Scooby sur un vieux bateau pirate qu'il a découvert au fond de l'océan. Les garçons entrent à l'intérieur du navire et trouvent un compartiment secret dans les quartiers du capitaine avec une carte au trésor à l'intérieur. Ils entendent un bruit et voient l'Electrifying Shoctopus : un engin sous-marin en forme de pieuvre piloté par Captain Squid. Captain Squid capture les garçons et prend leur carte au trésor nouvellement trouvée.

Sheera est capturée par le peuple des oiseaux alors qu'elle va chercher de l'eau à la rivière. Lorsqu'elle ne revient pas au village, Tor part à sa recherche. Il se transforme en Mightor et la découvre près des fosses de lave où elle est sur le point d'être sacrifiée à leur dieu Dogar.

Les chasseurs de géants, un groupe de créatures maléfiques, arrivent dans le village du chef Pondo et capturent Tor et Tog. Heureusement, Tor a son club et est capable de se transformer en Mightor et la bataille est lancée.

En explorant un vieux navire coulé, les garçons et Scooby rencontrent des créatures crabes qui capturent Tubb. Tom et Scooby vont trouver Moby pour qu'il puisse essayer de sauver leur ami.

Grok ordonne à Tyrannor, un T-Rex géant, de lancer un rocher sur le village. Il défie ensuite le village de produire Mightor pour combattre Tyrannor ou il détruira le village.

Brutor le Barbare dirige son armée de créatures dans une attaque contre le village lorsqu'ils rencontrent Tog et l'abattent avec l'une de leurs armes. Tor dit à Sheera et Li'l Rok d'avertir le chef Pondo et les villageois du plan de Brutor.

Tom et Tubb nagent dans l'océan lorsqu'une paire de requins tigres commence à les chasser. Scooby court pour trouver Moby Dick afin qu'il puisse aider les garçons. Alors que Moby chasse les requins tigres, Tubb nage par inadvertance dans la bouche d'un poisson géant. Tom se précipite pour trouver Moby dans le but de sauver Tubb.

Pendant que les hommes chassent, un singe géant apparaît et capture Sheera. Mighty Mightor revient rapidement, découvre ce qui s'est passé, il s'en prend à Sheera. Il découvre que le singe l'a attelée à son ennemi juré, Korg.

Sheera est capturée par les créatures de la caverne qui l'emmènent à Kragor. Bollo retourne au village sans Sheera et Li'l Rok pour que Tor sache que quelque chose ne va pas. Il découvre que l'entrée de l'endroit où vivent les créatures de la caverne et Kragor est ouverte et se rend compte qu'ils doivent être responsables de la disparition de ses amis.

Un tremblement de terre sous-marin enterre Moby et les garçons sous des tonnes de roche. Mais ils se retrouvent dans un monde sous-marin où Moby Dick doit protéger Scooby et les garçons de diverses créatures dangereuses comme les insectes géants, les palourdes, les algues mutantes, les anguilles et les Reptile Men alors qu'ils tentent de retrouver le chemin du retour.

Le petit mammouth de Sheera, Bollo, disparaît et elle entreprend de le retrouver, ignorant que le peuple Tusk l'a kidnappé. Tor et Tog se rendent compte que Sheera et Bollo ont disparu et remarquent que leurs empreintes de pas se mêlent à celles du peuple Tusk. Tor se transforme en Mightor dans le but de les sauver tous les deux.

Li'l Rok est piégé sur un rebord par un dinosaure géant. Tor s'éclipse, se transforme en Mightor et part pour essayer de sauver son ami. Il jette le dinosaure dans le marais pour découvrir que Li'l Rok a disparu. En cherchant, Mightor trouve un village voisin où les habitants ont été réduits en esclavage par un groupe d'insectes humanoïdes.

Des chauves-souris sous-marines attaquent Moby, Scooby et les garçons. Tom et Tubb sont faits prisonniers par les Aqua-Bats qui sont finalement effrayés par le géant portugais Man-0-War.

Les hommes vautours ont créé un grand vautour de pierre dans lequel ils prévoient d'ensevelir Mightor afin qu'il obtienne ses grands pouvoirs. Les villageois voient les hommes vautours arriver et Tor se transforme en Mightor pour les combattre. Ils capturent Li'l Rok et exigent que Mightor se rende. Mightor accepte et est scellé dans le Great Stone Vulture.

Tom et Tub surfent sur les vagues créées par Moby sautant dans l'océan lorsqu'ils s'écrasent sur un iceberg qui a dérivé du Nord. Lorsqu'ils descendent pour voir sous la surface, ils découvrent quelque chose de gelé dans la glace. Un morceau de l'iceberg se détache libérant la créature qui tente d'attaquer Scooby et les garçons.

Tor enseigne à Li'l Rok que pour survivre dans la jungle, il faut toujours être vigilant. Ils entendent un signal d'appel des Pygmées des Arbres et se préparent à courir lorsque Tor est capturé et perd son club. Sans cela, il ne pourra pas se transformer en Mightor. Li'l Rok retourne au village pour obtenir l'aide d'Ork et de Tog.

Les hommes de pierre entrent dans le village dans leur dragon de pierre géant à la recherche d'esclaves et capturent Sheera. Lorsque Tor voit que Sheera est capturée, il s'offre comme esclave en échange de sa libération. Les Stone Men reviennent sur leur parole et les gardent tous les deux comme esclaves. Tor est maintenant sans son club et doit trouver un moyen de l'obtenir s'il veut les sauver tous les deux.

Tom et Tubb ont été capturés par les méchants Shark Men avec Moby et Scooby à leur poursuite. Les Shark Men piègent Moby dans une grotte. Moby parvient à s'échapper de la grotte et doit maintenant se lancer dans un effort pour sauver les deux garçons.

Tor, Sheera, Li'l Rok et leurs animaux de compagnie sont piégés dans une grotte pendant une tempête. À la recherche d'une autre issue, ils se retrouvent dans la vallée des volcans où vivent Charr et le peuple du feu. Les Fire People voient les intrus et lancent une attaque. Tor se retrouve piégé dans une fosse profonde tandis que les autres sont capturés.

Le chef Pondo et tous les hommes (à l'exception de Tor) partent en voyage de chasse. Pendant leur absence, les Cavebear Warriors arrivent au village et capturent Sheera et Li'l Rok. Tor voit leurs traces et se transforme en Mightor afin qu'il puisse tenter un sauvetage.

Tom et Tubb voient trois obus de soucoupe approcher et savent que cela signifie des ennuis. Les garçons les voient poursuivre un groupe de dauphins et décident de les aider. Les Saucer Shells s'en prennent aux garçons qui se retirent vers Moby Dick pour leur propre aide. Scooby est capturé et c'est maintenant aux garçons et à Moby de le sauver.

Sheera et Li'l Rok se lancent dans une course avec Tor en voyageant sur leurs radeaux sur une rivière. Tor est rattrapé par des rochers et perd de vue ses amis qui se retrouvent à tirer à travers des rapides et à atterrir sur Vampire Island. Tor se rend compte que ses amis sont perdus et se transforme en Mightor pour tenter un sauvetage.

Tor est kidnappé par les Gill Men qui l'amènent à la Reine Serpent. Elle veut l'utiliser comme appât pour se venger de Mightor. Li'l Rok, qui a été témoin de l'enlèvement, prend le club de Tor et s'envole avec Ork pour le livrer à Tor afin qu'il puisse combattre le Serpent de la Reine de la Piscine.

Moby est attrapé par un calmar géant et les deux se battent pour finir. Moraya est témoin du combat et veut l'utiliser pour tester ses combattants entraînés. Elle ordonne à ses hommes de capturer Tubb et Tom pour les utiliser comme appâts pour attirer Moby là où il peut être lui-même capturé. Moby est en effet capturé et lui et les garçons doivent se battre pour s'échapper.

Les créatures de glace prévoient de déplacer leur glacier dans les basses terres et de prendre le contrôle du village et de faire de Mightor leur esclave. Ils ont un groupe de mammouths laineux qui poussent le glacier et descendent la montagne jusqu'au village. Les villageois voient le glacier approcher alors Tor passe à l'action et se transforme en Mightor et la bataille est lancée.

Li'l Rok est parti en explorant lui-même lorsqu'il rencontre le Temple Interdit du Scorpion et est capturé par les Scorpion Men. Sheera et Tor commencent à le chercher alors qu'il n'est pas revenu à la nuit tombée. Sheera est ensuite capturé, mais Tor entend l'appel de Bollo et se transforme en Mightor afin qu'il puisse tenter un sauvetage.

Moby et les garçons traversent une zone inexplorée connue sous le nom de cimetière de navires. Cette zone est contrôlée par un groupe de créatures amphibies dirigées par Toadus et il n'aime pas les visiteurs. Les garçons commencent à explorer un vieux navire et sont capturés par les créatures.

Li'l Rok et un groupe de ses amis décident de faire du rafting sur une rivière jusqu'aux Gorges Noires. Sheera et Tor voient les enfants et savent que c'est trop dangereux. Sheera part après les enfants dans un canoë tandis que Tor se transforme en Mightor et part en mission de sauvetage. Ils courent dans une situation dangereuse après l'autre.

Tor et Sheera avertissent Li'l Rok de l'approche d'un oiseau à bec terrible. P'tit Rok découvre le nid de la créature et décide de récupérer l'œuf pour qu'il soit célèbre dans son village. Sheera et Tor le voient dans le nid et savent qu'il aura besoin d'aide.

Tor et Sheera avertissent Li'l Rok de l'approche d'un oiseau à bec terrible. P'tit Rok découvre le nid de la créature et décide de récupérer l'œuf pour qu'il soit célèbre dans son village. Sheera et Tor le voient dans le nid et savent qu'il aura besoin d'aide.

Numo et ses esclavagistes capturent les femmes du village alors qu'elles réparent les filets de pêche du village. Les hommes découvrent que les femmes ont disparu et voient les traces laissées par Numo et ses hommes. Tor agit rapidement et se transforme en Mightor dans le but de suivre les navires et de sauver les femmes.

Les sorciers ont entrepris de trouver une reine pour leur souverain. Ils se dirigent vers le village et trouvent Sheera et Tor en train de faire un feu. Ils brûlent un bol de "feuilles de sommeil" qui les neutralise tous les deux et ils kidnappent Sheera. Tor en déduit que les Witchmen l'ont emmenée alors il se transforme en Mightor et part dans une tentative de sauvetage.

Vortan et ses hommes utilisent un puissant vortex pour capturer les vaisseaux sous-marins qui approchent. Ils l'allument quand ils captent Moby sur leur radar en pensant qu'il est un vaisseau. Moby et les garçons survivent au vortex mais se retrouvent piégés entre le vortex et Vortan et doivent se frayer un chemin s'ils veulent survivre.

Li'l Rok, Sheera et Tina essaient d'attraper des papillons et d'en chasser un dans une grotte voisine. Lorsqu'ils sortent de l'autre côté, ils découvrent un monde étrange de plantes mangeuses d'hommes. Heureusement, Tor les suivait au cas où ils auraient besoin d'aide, cependant, il perd son club et est capturé avec les autres.

Les hommes vautours ont créé un grand vautour de pierre dans lequel ils prévoient d'ensevelir Mightor afin qu'il obtienne ses grands pouvoirs. Les villageois voient les hommes vautours arriver et Tor se transforme en Mightor pour les combattre. Ils capturent Li'l Rok et exigent que Mightor se rende. Mightor accepte et est scellé dans le Great Stone Vulture.

Crockor est occupé à stocker de l'énergie dans son laboratoire afin qu'il puisse créer ses créatures de sable - suffisamment pour contrôler l'ensemble de l'océan. Crockor capte Moby et les garçons sur son radar et veut les capturer pour qu'ils ne ruinent pas ses plans. Ils doivent se battre avec Crockor et ses créatures de sable ou l'océan peut être à jamais entre les mains du génie maléfique.

Le chef de la Mountain Monster Tribe a décidé qu'il était temps de nommer son remplaçant. Gorg et Brog revendiquent tous deux le poste, alors le chef propose un défi. Celui d'entre eux qui est capable de vaincre Mightor sera le prochain chef.

Le Storm King invoque une puissance supplémentaire à partir d'un orage et prétend maintenant avoir des pouvoirs supérieurs à Mightor. Il apparaît au village exigeant de voir Mightor. Pondo lui dit que Mightor n'est pas là et lui demande de quitter le village en paix. Lorsque le Storm King répond en mettant Pondo dans un sommeil profond, Tor utilise cette distraction pour se transformer en Mightor.

Tubb essaie de monter un Sea Pony. Après que Tubb ait été éjecté, une paire de Gill Men capture le Sea Pony. Moby et les garçons essaient de le libérer mais Moby est piégé dans une grotte par un puissant champ de force et Tom est lui-même capturé. Moby pourra-t-il se libérer et aider ses amis ?

Li'l Rok et Ork se retrouvent perdus dans Hidden Valley. Lorsque Rok est vu par les villageois, il est pris pour leur dieu aux grandes cornes. En tant que "véritable champion" proclamé, Li'l Rok accepte l'offre de devenir leur chef et de défendre le village contre la Grande Terreur Blanche, une créature qui est plus que Rok ne peut gérer.

P'tit Rok et Ork sont en train de pêcher lorsqu'ils rencontrent un garçon nommé Norg du Peuple des Collines. Norg est originaire d'un village voisin et cherche Mightor car Kragor et ses créatures de la caverne ont attaqué son village. Li'l Rok dit à Norg qu'il est Mightor et les deux partent pour chasser Kragor de son village. Tor surprend, se transforme en Mightor et repart pour se battre à nouveau avec Kragor.

Tom ne croit pas que Tubb ait vu une sirène jusqu'à ce qu'il voie un Black Manta Knight la poursuivre et la capturer. Moby et les garçons les suivent dans un mystérieux écran scintillant où ils découvrent un autre monde sous-marin. Ils passent rapidement à l'action pour tenter de sauver la sirène sans défense.

Li'l Rok et Ork essaient de devenir les premiers du village à capturer un dinosaure de l'île aux dinosaures. Il est capable d'en attraper un dans un piège, mais le dinosaure s'avère trop fort et s'échappe facilement. Sheera et Tor trouvent une note de Li'l Rok expliquant où il est allé. Tor se transforme en Mightor et se dirige vers l'île des dinosaures pour aider.

Tor et Li'l Rok s'envolent vers le village des gens de la vallée pour surprendre Sheera et découvrir que le village est désert. Ils commencent à enquêter et Tor disparaît soudainement, laissant son club derrière lui. Ils découvrent que Rogg et les Stone Men ont kidnappé leurs amis et prévoient de les utiliser comme esclaves pour construire un dinosaure de guerre en pierre.

Soodak l'envahisseur arrive sur Terre pour rechercher ses forces d'invasion. Il demande à ses hommes de lancer leurs unités de sonde pour sécuriser la zone. Moby, Scooby et les garçons rencontrent certaines des sondes et Soodak ordonne qu'elles soient capturées. Moby détruit les sondes mais Tom et Tubb sont capturés par un autre ensemble de sondes.

Li'l Rok et Ork se perdent pendant une tempête et sont capturés par un groupe d'hommes insectes étranges. Li'l Rok parvient à s'échapper en allumant un feu comme distraction. Tor voit la fumée, se rend compte que Li'l Rok pourrait avoir des ennuis et se transforme en Mightor pour enquêter.

Mightor se présente devant le chef Pondo et les villageois pour lui demander ce qui lui est dû pour toutes ses bonnes actions. Mightor annonce qu'il envisage de devenir chef de tous les villages et que les gens seront ses esclaves. Il ordonne ensuite aux guerriers de capturer le chef Pondo. Sheera et Li'l Rok sont partis pour libérer leur père et se sont heurtés à Tor. Ils expliquent ce qui s'est passé, ce qui n'a aucun sens pour Tor puisqu'il est le VRAI Mightor.

Iguanis of the Iguana Men ordonne à deux de ses hommes de capturer Tom et Tubb. Ils sont très conscients que Moby est leur gardien et ont tendu un piège pour les capturer. Scooby alerte Moby que les garçons ont été capturés alors il poursuit les Iguana Men pour essayer de sauver ses amis.

Grok vole le Golden Rok qui a la capacité de contrôler n'importe quel animal. Il tombe de sa poche alors qu'il part et frappe Li'l Rok à la tête. En combattant un dinosaure, Li'l Rok découvre le pouvoir du Golden Rok. Alors qu'il l'expérimente, Grok revient et le vole. Tor entend des animaux se battre dans la zone que Li'l Rok avait dirigée; il se transforme en Mightor et part enquêter.