중학생 만타의 반에 전학 온 아사쿠라 요우라는 소년. 종종 혼자서 멍하니 있는 게 특이하다고 생각했지만, 이 녀석이 영혼과 교류하고 그 힘을 끌어내는 ‘샤먼’이라고?

만타는 요우와 처음 만났던 묘지에서 또 한 명의 샤먼을 만난다. 소년의 이름은 타오 렌. 그리고 이 녀석의 목적은, 요우의 동료 아미다마루의 영혼을 빼앗는 것이었다.

입원한 요우 앞에 나타난 소녀 무녀 안나. 샤먼 파이트의 개최가 머지않았음을 알린다. 그리고 그 전장은 지금 이 시대에 가장 혼란스러운 땅, 도쿄가 될 거라 하는데.

요우 때문에 류 패거리가 아지트인 묘지에서 밀려났다. 딱히 대체할 장소는 보이지 않고. 요우한테 불만만 쌓여가던 때, 류에겐 급기야 도적단의 두목 악령이 들러붙는다.

전설의 별 ‘라고’가 밤하늘을 가르며, 5백 년 만에 열리는 샤먼 파이트의 시작을 알린다. 그리고 요우에겐 운영위원 실바라는 남자가 참가 자격을 시험하기 위해 찾아온다.

요우의 샤먼 파이트 예선 첫 상대가 결정됐다. 홋카이도에서 온 아이누족 샤먼 호로호로. 눈과 얼음을 사용한 녀석의 맹공을 요우와 아미다마루는 어떻게 파훼해 낼 것인가.

요우의 두 번째 상대는 시체를 조종하는 네크로맨서, 파우스트 8세. 온화하게 인사를 건네는 파우스트지만, 아미다마루는 놈이 풍기는 죽음의 냄새를 결코 놓치지 않는다.

파우스트와 요우의 싸움에 휘말린 만타가 입원했다. 하지만 그런 만타에게 요우는 충격적인 말을 한다. 결국 크게 상심한 만타는 부모님의 말씀대로 미국 유학을 결심하고.

드디어 요우의 샤먼 파이트 예선 마지막 날이 찾아왔다. 그 상대는 이미 격전을 치렀던 라이벌, 타오 렌. 요우의 운명과 본선 진출을 결정지을 승부 상대로 부족함은 없다.

샤먼 파이트 본선 전에 할 일이 있다며 렌은 중국으로 떠난다. 한편 타마오와 요우는 뮤지션 스님 듀엣의 습격을 받지만, 때마침 새로운 힘을 각성한 '그 남자'가 돌아온다.

아버지 타오 엔에게 패배한 렌이 누나 준과 함께 감금됐다. 그리고 그런 렌을 위해 요우와 동료들은 기나긴 중국 역사 속에서 암약해 온 샤먼 가문과의 결전을 준비한다.

결국 요우는 렌을 구출하고, 렌은 자신의 신념을 위해 일족에게 반기를 든다. 마침내 이들 앞에 누군가 나타나는데. 바로, 불사신의 육체를 가진 타오 가문의 수장, 엔!

자신을 ‘미래왕’이라 부르는 소년 하오의 등장은 요우 일행을 긴장시킨다. 본선 참가 선수들을 실은 비행기 안에선 샤먼 파이트의 첫 번째 시련이 예고도 없이 시작되고.

패치족 마을을 찾아 여행을 이어가는 요우 일행 앞에 리제르그라는 소년이 나타난다. 목적지가 같으니 함께 가고 싶다는데. 야, 요우, 이 녀석 아무리 봐도 수상하지 않아?

요우메이로부터 하오와 맞설 비책이 담긴 고서를 받은 안나. 이 책을 요우에게 전하기 위해 안나도 미국으로 향한다. 한편 호로호로의 소지령 코로로가 돌연 모습을 감추는데.

드디어 패치족의 옛 마을에 도착했건만, 사람들로 북적대는 관광지란 걸 알고 실망하는 요우 일행. 하지만 그 와중에 수상한 냄새가 풀풀 나는 출입 금지 구역이 눈에 띄는데.

하오의 부하인 보리스와 일대일로 맞서는 류. 요우메이 밑에서 수행을 하며 얻었던 새로운 힘을 개방한다. 한편 요우를 쫓아온 만타와 안나 앞에 뜻밖의 거물이 나타난다.

동굴을 빠져나와 마침내 그레이트 스피리츠를 직접 본 요우와 동료들. 잠시 한숨 돌리는데, 의욕이 넘치는 녀석 하나가 자신을 팀에 넣으라며 말을 걸어온다. 그냥 무시할까?

사라진 리제르그를 찾는 요우 일행 앞에, 예선에서 격전을 치렀던 상대인 파우스트 8세가 나타난다. 그리고 곧 시작될 본선 토너먼트와 관련해 뜻밖의 제안을 해 오는데.

토너먼트 첫 시합. 조코러브는 하오의 부하 페요테의 비열한 수에 휘말려 고전한다. 결국 쓰러진 조코러브. 문득 뒷골목 범죄자로 살던 시절 만났던 어느 노인이 떠오른다.

요우와 친구들이 렌 팀의 승리를 축하하는 가운데, 토너먼트 두 번째 시합이 시작된다. X 로우즈의 정예 X-1 대 이집트의 나일스. 그런데 X-1의 선봉은 아주 낯익은 얼굴이다.

드디어 요우가 있는 훈바리 온천 팀의 시합이 시작된다. 상대는 극지에서 온 샤먼들로 구성된 아이스멘. 게다가 한 방에 이기겠단 요우의 발언에 이미 적개심에 불이 붙었다.

파우스트의 새로운 오버 소울과 강력한 무력에 압도당하는 아이스멘. 하지만 한순간의 빈틈을 노려 반격을 개시하는데. 훈바리 온천 팀의 첫 시합, 과연 그 승부의 행방은?

오랜만에 리제르그와 이야기를 나누는 요우. 하지만 어둠 속에서 이 둘을 감시하는 자들이 있었다. 그리고 이튿날, X 로우즈의 X-3는 하오가 직접 이끄는 성 팀과 대결한다.

X-3의 목숨을 건 일격마저 하오에겐 통하지 않았다. 그 모습을 지켜보며 모든 것을 각오하는 요우. 동료들에게 아사쿠라 가문, 그리고 자신과 하오의 관계에 관해 고백한다.

요우가 밝힌 충격적인 진실에 동요하는 동료들. 하지만 팀워크는 흔들리지 않는다. 한편, 렌 팀 앞에 나타난 가면을 쓴 남자. 너희는 더 강해질 수 있다며 갑자기 싸움을 걸어온다.

미키히사의 기술을 간파해 낸 렌은 새로운 힘을 손에 넣는다. 한편 샤먼 파이트의 무대 뒤에서 암약하는 하오 일당. 이들의 마수가 새로운 먹잇감을 향해 다가온다.

페요테의 공격에 치명상을 입은 렌. 호로호로와 조코러브는 렌을 데리고 어떻게든 도망치려 하는데. 때마침 요우가 달려온다. 같은 시각, 안나 일행도 움직이기 시작한다.

안나가 미키히사의 두 팀메이트를 샤먼 파이트 시합장으로 데려가는 사이, 타마오와 타오 준은 하오의 수하에 있는 화 팀과 맞선다. 그리고 전투는 점점 치열해지는데.

렌을 치료해 주는 대가로 아이언 메이든이 제시한 조건을 받아들인 요우. 당황하는 이들을 뒤로하고 동료들과 자리를 떠난다, 한편, 안나는 5년 전 요우와 처음 만났을 때를 회상한다.

약혼녀 안나가 자신을 거부하는 이유를 알아보기 위해 찾아온 요우. 하지만 그녀를 직접 대면하는 순간, 도깨비가 날뛰기 시작한다. 그리고 마타무네의 과거가 밝혀진다.

요우와 안나는 조금씩이지만 마음의 거리를 좁혀간다. 그리고 요우는 함께 새해맞이 소원을 빌러 신사에 가자고 하는데. 그러나 안나의 능력 때문에 위험천만한 상황이 벌어진다.

안나를 구하기 위해 요우와 마타무네는 오소레산에 발을 들인다. 사람들의 번뇌가 불러낸 왕 도깨비. 마타무네는 이 강적을 쓰러뜨릴 방법이 있다고 하는데. 하지만 기회는 한 번뿐이다.

요우가 샤먼 킹이 될 기회는 이제 없어졌다. 그리고 류와 만타가 몰래 지켜보는 가운데, 아이언 메이든은 렌을 소생시키는데. 죽음의 문턱을 넘어 돌아온 렌은 놀라울 정도로 힘이 상승한다.

녹초가 되었지만 결국 브로켄 일당을 쓰러뜨리는 호로호로. 그의 목숨을 노리는 페요테가 나타나기 직전, 리제르그는 한발 먼저 이 친구를 요우와 동료들에게 데려다준다.

미키히사의 팀메이트인 루드세브와 세이람 남매의 아버지를 죽인 원수는, 바로 그 사람이었다. 그리고 복수를 위해 같은 과오를 반복하려는 두 사람을 요우가 막아서는데.

강력해진 골렘과 그 새로운 조종자가 폭주하기 시작했다. 이들을 막기 위해 렌, 루드세브 그리고 동료들은 작전을 짜고. 한편, 하오는 오파초에게 심부름을 시킨다.

돌연 요우와 친구들 앞에 나타난 오파초가 하오의 메시지를 전한다. 요우가 샤먼 파이트에 복귀하지 않으면 골렘과 아이들을 해칠 거라는데. 과연 요우의 선택은?

샤먼 파이트 복귀를 위해 X 로우즈와 맞서는 요우. 라키스트 랏소와 잔느가 난입하며 싸움이 일단락된다. 그리고 그 뒤, 요우는 하오를 쓰러뜨릴 계획을 밝힌다.

최종 국면을 향해 나아가는 샤먼 파이트. 렌 팀은 상대의 오버 소울을 무력화하는 명왕 팀을 만나 고전한다.

호로호로의 활약으로 승리를 거둔 렌 팀. 하지만 그것은 다음 상대가 훈바리 온천 팀이라는 의미인데. 한편 요우와 동료들 앞에 수상한 집단이 찾아온다.

요우는 지옥에서 벗어나기 위해 새로운 능력을 사용하며 싸움을 이어간다. 그리고 점점 혼돈이 더해지는 샤먼 파이트 대회에서, 요우의 팀은 뜻밖의 시련을 만난다.

마르코 일행은 하오의 공격으로부터 잔느를 지키기 위해 처절히 저항한다. 또한, 하오와 X 로우즈의 충돌은 생각지도 못한 위기를 불러온다.

하오의 부하들은 하오의 저의를 의심하기 시작하고, 안나는 궁극의 오버 소울을 사용하는 하오와 맞선다. 그리고 요우의 팀이 샤먼 파이트 시합장으로 향한다.

마침내 시작된 훈바리 온천 팀과 렌 팀의 샤먼 파이트. 하지만 요우가 반격을 시도하려는 찰나, 대결은 뜻밖의 국면으로 접어드는데.

두 번째 토너먼트 시합장에 들어선 요우 일행. 그리고 시합이 시작되기 전, 요우는 믿기 힘든 결단을 내린다.

드디어 샤먼 파이트의 우승자가 결정된다. 그리고 요우와 친구들은 하오가 그레이트 스피리츠와 하나가 되는 것을 막으려 한다.

최선을 다하는 요우와 동료들. 하지만 이들의 노력과 희생에도 불구하고, 하오는 결국 왕의 사원에 도달한다.

패치족 제사장 칼림의 집에 도착한 요우 일행은 편하게 휴식을 취하기로 한다. 하지만 잠시 후, 뜻밖의 방문자가 찾아오는데.

칼림과 사투를 벌이는 호로호로. 이 소년을 둘러싸고 있던 어둠의 정체가 마침내 밝혀진다.

마지막 플랜트에 도착한 요우 일행을 막아서는 러더포. 지금까지 싸워왔던 그 누구보다 강한 상대다.

새로운 능력을 손에 넣은 하오. 그 압도적인 힘 앞에서 무력한 요우와 동료들. 그러나 결코 희망의 끈을 놓지 않는다.