특수한 능력을 가진 소년 소녀가 모인 외딴섬의 학교. 학생들은 '인류의 적'이라고 불리는 괴물과 싸우기 위해서 훈련에 힘쓰고 있었다. 그중 한 명인 나카지마 나나오는 자신의 능력에 자신이 없어서 반 친구들로부터 '무능 군'이라고 불리고 있었다. 하지만 전학생, 히이라기 나나와의 만님을 계기로 그의 운명은 크게 변하기 시작한다.

실종된 나나오를 걱정하는 반 친구들. 태연한 얼굴로 그 안에 섞여 있는 나나. 하지만 그녀의 앞에 새로운 강적이 나타난다. '시간을 멈추는 능력'이 있다고 하는 시부사와 요헤이였다. 그는 최강의 능력자일지도 모른다. 어떻게든 약점을 찾으려고 하는 나나였지만, 요헤이의 진짜 능력은 더욱 무시무시한 것이었는데.

나나와 같은 날 전학 온 오노데라 쿄야. 그의 숨겨진 목적은 행방불명된 여동생을 찾는 것이다. 무뚝뚝하지만, 뛰어난 관찰력과 추리력을 가진 그는 나카지마 나나오의 실종에 의문을 품고 조사를 시작하는데. 그는 범행 현장에서 발견한 나나오의 시계를 나나에게 보여준다. 강적 등장. 나나는 쿄야의 추궁을 피할 수 있을 것인가?

이누카이 미치루 조용하고 반에서 놀림당하는 그녀는 다른 사람의 상처를 핥아서 치유하는 힐링 능력을 가지고 있다. 미치루와 친해지는 나나. 동시에 쿄야의 의심으로부터 벗어나기 위해 '인류의 적' 에게 습격당한 것처럼 위장하기 위해 스스로 상처를 입는다. 그 계획은 성공하는 듯했는데.

츠네키치에게 협박당하는 나나. '범행 사실을 들키고 싶지 않으면 내 여자친구가 돼라.' 어쩔 수 없이 나나는 츠네키치의 방으로 간다. 츠네키치가 잠든 사이 가짜 미래 염사 사진을 준비하고, 츠네키치를 체육 창고로 유인한다. 하지만, 나나의 트릭을 눈치챈 츠네키치가 나나에게 반격을 가한다. 절체절명의 나나. 이 위기를 어떻게 극복할 것인가?!

미치루에게 사진을 들킨 나나. 하지만 순발력 있게 거짓말로 포장해서 무사히 넘긴다. 다음 날 츠네키치의 장례식에서 쿄야가 사체를 해부해서 검시해야 한다고 제안한다. 그러자 같은 반인 카자마 신지가 '시체에 직접 물어보면 되잖아?'라고 말한다. 그리고 동시에 관에 누워있던 츠네키치의 시체가 일어난다. 시체를 조종하는 능력 '네크로맨시'였다.

간신히 유카에게서 도망친 나나. 하지만 자신의 비밀을 지키고 싶은 유카는 신지와 함께 집요하게 나나의 뒤를 쫓는다. 밤이 된 숲속에서 나나를 향해 다가오는 시체 무리. 대체 이 시체들은 누구인가? 새로운 수수께끼를 풀 틈도 없이 나나는 궁지에 몰린다. 버려진 산막으로 도망친 나나였지만 그것 또한 유카의 함정이었는데.

유카를 제거한 나나는 쿄야의 눈을 속이기 위해 공작을 한다. 유카는 '인류의 적'에게 살해당했다고 쿄야와 친구들에게 보고하는 나나. 게다가 '인류의 적'에게 조종당한 하부 키라라가 친구인 타카나시 카오리를 살해한 것처럼 보이도록 위장한다. 쿄야는 나나를 의심하지만 증거가 없다. 나나와 쿄야의 숨 막히는 두뇌전. 쿄야의 날카로운 추궁에서 나나는 어떻게 빠져나갈 것인가.

나나와 쿄야의 아슬한 공방. 간발의 차이로 쿄야의 추궁에서 벗어난 나나는 이로 인해 반 친구들에게서 더 깊은 신뢰를 얻는데 성공한다. 하지만 안심하는 것도 잠시 새로운 위기가 닥쳐온다. 마음 여리고 친구를 위한다고 생각했던 그녀가 갑자기 커터 칼을 들이대며 나나에게 이빨을 드러내는데......!

타치바나에게서 도망치려는 나나. 하지만 모구오로 변신한 타치바나에게 불꽃 공격을 받는다. 부상을 입고 쓰러진 나나는 진짜 미치루가 있는 곳에서 눈을 뜬다. 미치루의 간호로 회복하는 나나였지만 그 머릿속에서는 끔찍한 기억이 되살아난다. 나나는 어렸을 적에 '인류의 적'에게 부모님을 잃었다. 나나의 과거가 지금 밝혀진다.

새로운 피해자는 이시이 류지. 누군가에게 목을 난도질당해서 죽어 있었다. 용의자 중에는 피해자의 소꿉친구인 소라노 후우코가 있었다. 그녀는 공기를 압축해서 만든 칼날로 상대를 공격할 수 있는 능력자였다. 한편, 미치루의 거동이 이상하다. 타치바나를 죽이기 위해 준비해둔 독을 미치루가 발견했을지도 모르는데......?!

욕실에서 정신을 잃은 미치루를 열심히 간호하는 나나. 거듭된 힐링 능력 사용 때문인지 쇠약해진 미치루. 한편, 쿄야는 류지를 살해한 범인의 증거를 찾기 위해 수사를 계속한다. 계속 의식이 돌아오지 않는 미치루 옆에 붙어있던 나나에게 소라노 후우코가 찾아오는데.