Hajime, Miyuki und Fumi werden von Miyukis Freundin Akane, der Tochter des Präsidenten des Aizawa-Konzerns, auf die Insel Deep Blue eingeladen. Dort hat der Aizawa-Konzern auf Geheiß des Präsidenten ein luxuriöses Freizeitresort errichtet. Eine besondere Attraktion der Insel sind Unterwasserruinen unweit des Resorts.

Was zunächst nach einem Traumurlaub für Kindaichi und Co. ausschaut, entwickelt sich jedoch jäh zu einem wahren Alptraum. Nach mehreren Anschlägen auf Firmensitze des Konzerns wird auch das Resort von einer Gruppe bewaffneter Terroristen überfallen und unter deren Kontrolle gebracht. Dem Willen ihres mysteriösen Anführers King Caesar folgend, planen die Terroristen, den Präsidenten für die Schändung der Ruinen zu bestrafen und das Resort zu zerstören.