在魔法界一直流传着一个传说：如果谁被每100年出现一次的传说之石“愿望之石”选中的话，不管许什么样的愿望都能实现。这天光之美少女们出席了魔法界为庆祝这一盛事到来而举办的盛大祭典——“大魔法庆典”，而且在庆典上被愿望之石选中的竟然是未来的毛绒玩具熊莫夫伦。然而就在这时，神秘的谜之熊达克玛塔突然出现抓走了莫夫伦与愿望之石，妄想利用愿望之石实现其“消灭所有魔法使”的罪恶阴谋，为了救出莫夫伦并阻止达克玛塔的这一阴谋，光之美少女们展开了行动……

I'm, Asahina Mirai! Everyone, do you know about the "Wishing Stone"? It's a powerful stone that can grant any wish you want! Today is the day we're celebrating its revival, a huge magic festival that only occurs once a century♪ Together with Riko and Ha-chan, I wish upon this "Wishing Stone", but believe or not, it chose Mofurun's wish! This is truly exciting!! However...a mysterious bear・Dark Matter suddenly appears, and takes Mofurun with him!! I have to definitely save Mofurun! Even when we're separated, the wishes of all of us can bring about miracles!! Well that is what I thought, what~~~!! Mofurun became a Pretty Cure~!?

In der magischen Welt findet das sogenannte Grand Magical Festival statt, welches die Rückkehr des „Steins der Wünsche“ feiert. Dieser Stein erfüllt alle 100 Jahre einer einzigen Person ihren innigsten Wunsch. Mirai, Riko, Kotoha und Mofurun lassen es sich natürlich nicht nehmen, an diesem Spektakel teilzunehmen und reisen promt in die magische Welt. Dort wird Mofurun auch als diejenige auserwählt, deren Wunsch erfüllt werden soll, doch genau in diesem Moment taucht ein furchteinflössender Bär namens Dark Matter auf und entführt sowohl Mofurun als auch den Stein der Wünsche.

魔法界に伝わる、どんな願いも叶えてくれるという伝説の「願いの石」。その復活を祝うため100年に一度開かれるという「大魔法フェスティバル」にみらいたちはやってきた。願いの石に向かって願い事をしていたところ、その石の力に選ばれたのはモフルンだった。しかし、モフルンは自分としての願いはなく、むしろみらいたちの願いを叶えて欲しいという。

その最中突然現れた謎のクマ、ダークマターがフェスティバル会場を襲う。みらいたちはプリキュアとなって応戦するが、ダークマターには刃が立たない。そしてダークマターは自らの願いを叶えさせるために願いの石を強奪した上にモフルンを連れ去ってしまい、みらいとリコはプリキュアに変身出来なくなってしまう。

みらいたちはモフルンを救うため探しに出ることになり、モフルンもダークマターの元から逃げ出した先のクマたちが住む森で出会った、クマの男の子・クマタと交流するが、そうした中でみらいもモフルンも今自分が本当に願うことを感じるようになる。そして、みらいと再会したとき、モフルンのある願いが石に通じ、奇跡をおこすことになる。

마법계에 전해지는, 어떤 소원도 이루어 준다는 전설의 「소원의 돌」. 그 부활을 기원하며 100년에 한번 열린다는 「대마법 페스티벌」에 미라이들이 도착했다. 소원의 돌에 소원을 빌고 있는 도중에 그 돌의 힘에 선택된 것은 모후룬 이었다. 그러나 모후룬은 자신의 소원은 없고, 오히려 미라이들의 소원을 이루고 싶다고 한다. 그런 와중에 갑자기 나타난 정체불명의 곰, 다크매터가 페스티벌 회장을 덮친다. 미라이들은 프리큐어가 되어 응전하지만, 다크매터에겐 공격이 먹히지 않는다. 그리고, 다크매터는 자신의 소원을 이루기 위해 소원의 돌을 강탈한 후에, 모후룬을 데려가버려 미라이와 리코는 프리큐어로 변신할 수 없게 된다. 미라이들은 모후룬을 구하기 위해 찾아나서게 되고, 모후룬도 다크매터에게서 도망친 옛 곰들이 사는 숲에서 만난 아기곰 쿠마타와 만나는데, 그 과정에서 미라이도 모후룬도 지금 자신이 진심으로 원하는 것을 떠올리게 된다. 그리고, 미라이와 재회했을 때 모후룬의 소원이 돌에 전해져, 기적을 일으키게 된다.

Büyücülük Dünyası, yüzüncü yıl dönümü Büyük Sihir Festivali'ne ev sahipliği yapıyor. Bu festival Dilek Taşı'nın geri dönüşünü kutlayarak Taş'ın seçilmişlerinden birinin dileğini yerine getirir. Mofurun bir taşla bir dileği yerine getirmek için seçildiğinde, Karanlık Madde adında güçlü bir ayı ortaya çıkar ve Dilek Taşı ile Mofurun'u çalar! Karanlık Madde, Mofurun'un tüm büyücülerin yok edilmesini dilemesini istiyor. PuriCure'a dönüşemeyen Mirai, Riko ve Haa, Moforun'u kurtarmak için yola çıkar.