在某個漆黑的夜晚，日本警察內部遭到間諜入侵。間諜企圖竊取英國的MI6、德國的BND與美國的CIA甚至FBI的機密資料，在千鈞一髮之際被安室透率領的公安警察發現。間諜只好搶車逃走，在高速公路上與安室展開競速追逐，在險些波及其他車輛而釀成重大事故的瞬間，間諜的車被FBI的赤井秀一的來福槍子彈擊中，並從公路上墜落。隔天，柯南等人到改建後盛況空前的東都水族館遊覽。 在作為特色景點的大型摩天輪下，柯南發現一位外貌端莊、孤身一人的受傷女性，又看出她左右瞳孔顏色相異，也就是俗稱的「odd-eyes」。但是，這名女性正處於喪失記憶狀態，忘了自己的名字，所攜帶的流動電話也壞了。柯南等人與這位女子約定幫助她找回記憶，然後就在一起行動。苦艾酒一直在暗中監視，在那之後她拿出裝有消音器的槍，並對着衣服上的微型通信器說：「我正有此意喔，琴酒」。