Mazinkaiser vs. de Grote Generaal van de Duisternis is een hervertelling van Mazinger Z versus de Grote Generaal van de Duisternis uit 1974. Het nieuwe Mazinger-team wordt overweldigd door de verrassingsaanval van het ondergrondse Mykene-rijk, waarbij veel slachtoffers vallen, maar Mazinkaiser verslaat uiteindelijk de krachten van het kwaad en eindigt met een bitter duel tegen de leider van Mykene, de Grote Generaal van de Duisternis.