滿月之夜的鑽石偷盜事件，怪盜基德擺脫了警察的包圍網，華麗地逃走了。江戶川柯南在獨自追捕基德時，遭遇了石川五右衛門的襲擊。柯南方才明白是雷朋三世假扮基德犯案，而這次的對手將是雷朋三世。 雷朋三世之後將目標轉向「幻之秘寶」櫻桃藍寶石。收到雷朋三世預告函的目暮十三等人，迎來了雷朋三世潛入搜查官錢形幸一，他們開始合力抓捕雷朋三世。雷朋三世則在寶石順利得手後，聽從峰不二子的要求，將寶石交給了神秘男子亞倫·史密西。他的目的到底是什麼？ 與此同時，來到日本的還有超人氣海外偶像艾米力歐·巴瑞帝。但艾米力歐收到了死亡恐嚇信，要求終止他在日本的演唱會，否則就會喪命。因此艾米力歐和其經紀人克勞蒂亞·貝露奇求助於毛利小五郎。 對超人氣偶像的恐嚇，幻之秘寶的盜竊事件，柯南認為這兩個事件都與雷朋三世有關。 走投無路的危機在逼近柯南等人。最終二人聯手智破危機。 其中片尾{背叛，是女人的專利}更成為此電影的經典名言