Enterprisen viiden vuoden tutkimusmatkasta on ehtinyt kulua jo kolme. Alus vierailee Yorktown-tukikohdassa, keinotekoisella planeetalla, josta he päätyvät tuntemattoman, Tähtiliittoon kuulumattoman lajin edustajan kanssa kartoittamattomaan avaruuteen. Avaruusolio kertoo oman miehistönsä olevan vankeina ja kapteeni James T. Kirk miehistöineen rientää tietysti tuttuun tyyliin apuun. Planeetta, jolla muita lajin edustajia kohdellaan kaltoin sijaitsee niin tiheän tähtisumun takana, etteivät kommunikaatioyhteydet Tähtiliittoon toimi. Enterprise joutuu diktaattori Krall:in virittämään ansaan ja Entrprise joutuu tekemään pakkolaskun planeetalle. Krall haluaa jostain syystä itselleen Enterprisen esinekokoelmaan päätyneen artefaktin. Ympäri planeettaa pakkolaskun tehneet miehistön jäsenet päätyvät taistelemaan altavastaajina Krall:ia vastaan, joka uskoo täysin päinvastaisiin asioihin kuin Tähtiliitto. Hänen mukaansa sota on ratkaisu, ei rauhallinen yhteiselo.