'Doraemon e os Piratas dos Mares do Sul' é uma trepidante aventura em que Doreamon conduz os seus amigos a novas aventuras.

A pesquisa de documentação sobre o mar, para um trabalho de escola, fará com que a porta mágica de Doreamon transporte Nobita, Shizuka, Gigante e Suneo para o alto mar. Desta vez os nossos amigos embarcam num imenso e peculiar barco com a finalidade de conhecer os mistérios do mar e encontrarem grandes tesouros. O que ninguém imagina é que uma distorção na linha espaço tempo, os conduzirá para o século XVII, no meio de uma grande tempestade que os faz naufragar e onde Doreamon perde a sua bolsa mágica.

Não há tempo a perder, os nossos amigos têm que encontrar uma maneira de sair.... Será que conseguirão?