Humanity's desperate battle to reclaim the Earth from Godzilla continues. The key to defeating the King of the Monsters may be Mechagodzilla, a robotic weapon thought to have been lost nearly 20,000 years ago.

An Okinawan prophecy that foretells the destruction of the Earth is seeming fulfilled when Godzilla emerges to return to his destructive roots. But not all is what it seems after Godzilla breaks his ally Anguirus's jaw. Matters are further complicated when a second Godzilla emerges, revealing the doppelgänger as a mechanical weapon.

Po poslední bitvě zůstala Mekagojira (Kiryu) mimo provoz. Gojira skončila sice na dně moře, ale zlikvidovat se ji nepovedlo. Vědec Yoshito Chujo dostane za úkol Kiryu co nejrychleji opravit, ale její nejděsivější zbraň „Absolute Zero“ je nenávratně zničena. Aby toho nebylo málo, dostane japonská vláda varování od Shobijin, aby neprodleně vrátili kosti původní Gojiry do moře, jinak božská Mosura vyhlásí lidstvu válku. Na oplátku nabízí Japonsku svou ochranu před dalšími útoky obávaného monstra. To však rozhodně nehodlá čekat, než se obě strany dohodnou, a opět se vynoří z hlubin Tichého oceánu a začne demolovat Tokio. Mosura se proto vydává do boje, zatímco se na ostrově Infant narodí její potomstvo. Jenomže tentokrát je Gojira nad její síly, a tak vládě nezbývá nic jiného než poslat do boje poškozenou Kiryu. (SOLOM.)