Príbeh študentky Hannah Bakerovej, ktorá spáchala samovraždu. Než Hannah zomrela, nahrala sadu kaziet, na ktorých odhalila 13 dôvodov, ktoré ju k samovražde priviedli. Za každým dôvodom stál jeden človek, ktorý je tak nepriamo zodpovedný za jej smrť. Baličiek s kazetami putuje medzi obvinenými a teraz sa dostal ku Clayovi. Prečo Hannah zomrela a čo s tým má Clay spoločné?

Dej sa odohráva v roku 1686 v holandskom Amsterdame. Matka prinúti Petronellu (Anya Taylor-Joy), aby si vzala za muža bohatého priekupníka Johannesa Brandta (Alex Hassell) a pomohla tak rodine zbaviť sa dlhov. Pre Nelly, ako ju všetci prezývajú, to ale nie je výrazný problém, pretože Johannes je šarmantný a krásny muž. Keď sa nasťahuje k Brandtovcom, dostane pozoruhodný dar. Tým je miniatúrna kópia domu. S pomocou jeho tvorcu, ktorý jej neustále posiela ďalšie doplnky pre domček, začína odkrývať záhadné tajomstvá jej novej rodiny. Tajomstvom zostáva aj to, kto je neznámym miniaturistom, ktorý dom vyrobil a o rodine toho vie viac, než je normálne.