Sarja kertoo tietokone-ekspertti Chuck Bartowskista, jonka aivoihin siirtyy huippusalainen tietokanta sähköpostin välityksellä. Sen seurauksena CIA ja NSA lähettävät agenttinsa hänen peräänsä. Ennen kuin selviää kuinka arvokkaat tiedot saadaan talteen, Chuckin täytyy elää kaksoiselämää vakoojana, minkä vuoksi hänen henkensä on jatkuvasti vaarassa.

JFK:n kansainvälisellä lentoasemalla työskentelevät tulli-, rajavalvonta- ja maahanmuuttoviranomaiset tekevät yhteistyötä napatakseen laittomien aineiden salakuljettajat verekseltään tullitarkastuksessa.