公元2035年，人类被12只猴子军研制的一种病毒侵袭，大部分人类都在这场病毒灾难中死亡，只有少数人侥幸逃生，但也只能在阴暗的地下，苟且偷生。科学家们决定派人穿越时光回到1996年追查12只猴子军的来历。囚徒詹姆斯·科尔(布鲁斯·威利斯 Bruce Willis 饰)被 挑选为志愿者。阴差阳错，科尔回到了1990年，当他向当时的人们描述未来的那场大灾难时，被当作精神病捉了起来并被医生凯瑟琳·雪莉（玛德琳·斯通 Madeleine Stowe 饰）诊断为精神分裂症。科尔在病友杰弗里·戈因斯帮助下逃脱，回到了未来。因为没查清12只猴子军的来历，科尔再次被派回了1996年。科尔这次发现了12只猴子军的起源地在费城，他找到了医生凯瑟琳，二人一起展开了追查12只猴子军的冒险之旅!

　　影片开始于一片白茫芒的大地，南极。这片在20世纪以前没有人踏足过的土地，飞机停留在上面，时间也仿佛静止。故事就从Matt的口述开始。 　　我第一次遇见她，是在布鲁克斯顿的音乐节。她叫Lisa，21岁，很漂亮，我想她就是我一直以来追求的梦中情人，激情而又疯狂。我们一起听演唱会，做饭，磕药，还有不停歇的，做爱。日复一日，这就是生活。演唱会上沸腾的人群，激昂的歌手，是我们爱情的见证。我迷恋她修长的、像男孩儿般的身体，还有她可爱的舞蹈。我不知道这样的日子会持续多久，尽管偶有争吵，但至少，现在，我真实的抱着她，感觉着她。 　　那首歌里唱到：现在我们悲伤，因为现在已经消逝不见。那一天终于来到，她却不让我到机场送她。她说，她不喜欢告别的仪式太长。我走在街上，纷扰的人群依旧，只是她已不在。我知道，在地球的另一头，美国，她的生活依然会继续，可是已经与我无关。很多年后，当我想到Lisa，我想到的是天边的云彩，还有一种滋味。那是爱情的滋味