En la jaro 2035, kondamnito James Cole kontraŭvole volontulas por esti sendita reen en la tempo por malkovri la originon de mortiga viruso kiu ekstermis preskaŭ la tutan populacion de la tero kaj devigis la pluvivantojn en subterajn komunumojn. Sed kiam Cole estas erare sendita al 1990 anstataŭe de 1996, li estas arestita kaj enfermita en mensa malsanulejo. Tie li renkontas psikiatron doktoron Kathryn Railly, kaj paciencan Jeffrey Goines, la filon de fama viruseksperto, kiu povas teni la ŝlosilon de la mistera fripona grupo, la Armeo de la 12 Simioj, supozeble respondeca por deĉenigi la murdan malsanon.
Matt, a young glaciologist, soars across the vast, silent, icebound immensities of the South Pole as he recalls his love affair with Lisa. They meet at a mobbed rock concert in a vast music hall - London's Brixton Academy. They are in bed at night's end. Together, over a period of several months, they pursue a mutual sexual passion whose inevitable stages unfold in counterpoint to nine live-concert songs.