Scooby-Doo och Shaggy får lära sig att det finns mycket värre saker än hemläxor i den här filmen när dom dras in i mysterier och förödelser! Ett nytt äventyr börjar när Scooby-Doo och Shaggy anmäler sig som gymnastiklärare på Miss Grimmwoods skola för andar. Snart upptäcker dom att eleverna (zoinks!) är döttrar till världens mest kända fasansfullaste monster! Men när flickorna (andarna) blir kidnappade av den elaka Revolta och hennes kuggade spindelvarelser stormar våra hjältar in i äventyret och räddar deras förfärliga små vänner i spektakulär Scooby-Doo anda!

För att kunna vara med i den årliga biltävlingen för monster förvandlar Greve Dracula Shaggy till en varulv och tvingar honom att tävla. För att Shaggy ska förvandlas tillbaka till Shaggy igen måste han överlista alla läbbiga monster, mumier och andra läskiga varelser, och vinna tävlingen annars kommer han att bli en varulv för alltid...

Scooby och gänget möter spökigt busiga och övernaturliga syskonen Bu. Shaggy ärver juveler efter sin morbror men måste åka till det hemsöktaslottet Beauregard för att hämta dessa. Men morbrors spöken skrämmer dem till att kalla på förstärkning från de vilda bröderna Bu.

Vilka är historiens bästa brottsbekämpare, Scooby-Doo och hans gäng eller Batman och Robin? Bestäm själv - nu får du nämligen se dem tillsammans när de ger sig ut för att försvara de oskyldiga, bekämpa orättvisorna i samhället - och glufsa i sig Scooby-snacks. Jokern och Pingvinen har en ny ondskefull plan i kikarn, som går ut på att göra storkovan på förfalskningar. Som tur är möter de tredubbelt motstånd i form av Batman, Robin och Scooby-Doo! Men Jokern är inte den som ger upp i första taget, och så fort hjältetrion vänder ryggen till så har han gjort en ny kupp och stulit en flygande dräkt. Men med lite hjälp från sina lika flygande vänner ska nog Scooby-Doo och gänget lyckas håva in den onde mästerskurken...

Sim, Liz, and Marty are living a quiet life in the town of Oakhurst when their friend Tony goes missing. The gang soon discovers the Phantom Driver is back from the grave, and they must uncover who, or what, it is!