在超人托利加與闇之巨人、邪惡托利加的戰鬥已經過去了七年，世界進入了技術向宇宙推進飛速發展的「新前線時代」，人類的目光進一步轉向宇宙開發，而怪獸災害的對策規模傾向縮小。

正當人類進入和平時代之時，突然飛來的神秘宇宙浮遊物體「索菲亞」開始襲擊地球和火星殖民地，導致人類與宇宙的聯繫被斷絕，成為了「孤島般的星球」。

主角「明日見奏大」的日常生活也被這魔手迫近，在眼前不停發生破壞，終於現身的巨大怪獸，奏大不顧危險，跳向面前敵人之時，卻意外變身成了全新的巨人「超人帝卡」。