1914년 이집트. 한 노학자가 피라미드의 벽에 새겨진 5개 원소의 비밀을 밝혀낸다. 2259년 뉴욕. 지구에 거대한 행성이 다가와 대통령을 비롯한 전 군대는 비상상태에 빠진다. 지구를 구할 4개 원소를 가진 몬도샤인들은 지구로 오는 도중에 모두 죽게 되고 과학자들은 남은 팔로 유전자 합성을 통해 빨간 머리 소녀 리루를 만든다. 리루는 과학자들에게서 도망치던 중 전직 연방 요원인 코벤을 만나고, 두 사람은 4개 원소를 찾기 위해 피라미드의 예언을 알고 있는 코넬리우스 신부와 함께 파라다이스 행성으로 간다. 한편 무기상인 조르그도 4개 원소를 손에 넣기 위해 그들을 뒤쫓는데...
트랜스포머 시리즈의 주역, 옵티머스 프라임과 메가트론이 한때 형제와도 같은 친구사이였고, 그들이 어떻게 사이버트론 행성의 운명을 바꾸고 영원한 숙적이 되었는지 그 시작에 대한 이야기를 다루고 있다.
The Metaliens, alien robots intent on galactic domination, encounter a major setback. Their enormous Space Saucer, 'Compromise', enters a black hole in a strange, uncharted region of Space, and collides with another craft – sending the Kleptonite Ball, their precious cargo and the key to Universal Conquest, hurtling to a planet inhabited by primitive life forms: Earth. Having materialised in a bar, the Ball variously functions as a Christmas tree decoration, a bathroom ornament, and a fortune-teller's prop. The Metaliens must retrieve the Kleptonite Ball if their mission is ever to succeed. And that's when their problems really begin…