Незадолго до окончания строительства космического лифта "Эндимион" - Камидзё и Индекс встречают девушку нулевого уровня по имени Мейго Ариса. Вскоре после этого, преследуя Арису, Маги совершают нападение на Академград. В ответ на агрессию со стороны магов - Академград высылает специальный высокотехнологичный отряд, во главе которого стоит Шаттаура Секвенция. Пока на улицах Академграда разгораются бои - Тома узнает от Стейла, что из за необычной способности Арисы может разгореться полномасштабная война между Научной и Магической сторонами конфликта.

Bonus animation featuring Index-tan included with the BD special edition of the Toaru Majutsu no Index: Endymion no Kiseki movie.

In Toaru Kagaku no Railgun T Mikoto Misaka and her friends prepare for the Daihasei Festival, a seven-day sports competition between different Esper schools, which, of course, also include the Tokiwadai middle school. Misaka and all other students of Tokiwadai are highly motivated and ready to do their best in the upcoming competition. However, all the fun ends, when another dark secret of the Academy City of Science and Technology is uncovered.