W dniu, w którym Touma Kamijou i Index widzą w oddali kosmiczną windę Miasta Akademickiego, Endymiona, spotykają dziewczynę z niesamowitym głosem, Arisę Meigo. Gdy cała trójka cieszy się wspólnym czasem spędzonym po szkole, Stiyl Magnus nagle ich atakuje, a jego celem jest właśnie Arisa. Dlaczego dziewczyna ze strony naukowej miałaby być celem kogoś ze strony magicznej, zastanawia się Touma. W chaosie ataku Stiyl mówi Toumie, Index i Arisie, że mogą wywołać wojnę między stroną magiczną a naukową.

Bonus animation featuring Index-tan included with the BD special edition of the Toaru Majutsu no Index: Endymion no Kiseki movie.

In Toaru Kagaku no Railgun T Mikoto Misaka and her friends prepare for the Daihasei Festival, a seven-day sports competition between different Esper schools, which, of course, also include the Tokiwadai middle school. Misaka and all other students of Tokiwadai are highly motivated and ready to do their best in the upcoming competition. However, all the fun ends, when another dark secret of the Academy City of Science and Technology is uncovered.