Спеціального агента загону «Місія неможлива» Ітана Ганта та його колег несправедливо звинувачують у причетності до вибуху кремля. Президент ініціює «Протокол Фантом», в результаті якого формально ліквідують спецпідрозділ, а Ітан залишається без будь-якої підтримки. Він має намір повернути своє добре ім'я і запобігти новій атаці, але робити це йому доведеться разом з командою колег, істинних мотивів яких він до кінця не знає.

Найманий вбивця отримує завдання знищити терориста у Лондоні, що планує дістати ядерну зброю в агентів ФСБ. Але, коли герою не вдається виконати місію та його напарника убивають, стає зрозумілим, що він лише пішак у смертельній грі спецслужб…