Un submarino de aguas profundas, que forma parte de un programa internacional, es atacado por una enorme criatura y queda averiado en el fondo de la fosa oceánica más profunda del Pacífico, con su tripulación atrapada en el interior. El tiempo se acaba y un oceanógrafo chino, el Dr. Chang, recluta a Jonas Taylor, un especialista en rescate en aguas profundas, en contra de los deseos de su hija Suyin, que cree que puede rescatar a la tripulación por sus propios medios. Pero ambos deberán unir sus fuerzas para salvar a la tripulación y también al océano de una amenaza imparable: un tiburón prehistórico de 23 metros conocido con el nombre de Megalodón.

Los investigadores del laboratorio submarino Aquatica han alterado la genética de los cerebros de varios tiburones que tienen cautivos para desarrollar una cura para la enfermedad del Alzheimer. El cambio, inesperadamente, trae consigo un efecto secundario, los tiburones se están volviendo más inteligentes. Esto podría causar problemas... y facilitarles comida a los tiburones.

On a volcanic island near the Kingdom of Hetvia rules Count Dakkar, a benevolent leader and scientist who has eliminated class distinction among the island's inhabitants. Dakkar, his sister Sonia and her fiance, engineer Nicolai Roget have designed a submarine which Roget pilots on its initial voyage just before the island is overrun by Baron Falon, despotic ruler of Hetvia. Falon sets out after Roget in a second submarine and the two craft, diving to the ocean's floor, discover a strange land populated by dragons, giant squid and an eerie undiscovered humanoid race.