In einer Welt, wo der kalte Krieg nie beendet wurde, kämpfen der Osten und Westen um die technologische und politische Vorherrschaft. Mylene Hoffman (009-1), die ein Mitglied der Abteilung 009 ist und dem Westen angehört, kämpft mit ihren Kolleginnen gegen den Osten. Es gehen Gerüchte um, dass ein Wissenschaftler im Osten eine Bombe geschaffen haben soll, die einen Supergau auslösen könnte. Um diese Katastrophe zu verhindern, setzen die weiblichen Mitglieder von 009 ihre Cyborgkörper ein, der sie in vielen brenzligen Situationen rettet.
Mylene Hoffman, also known by the code name "009-1" is a beautiful cyborg spy. Instructed by her superior "Number Zero," she is assigned to eliminate a Jazz musician who is suspected to be a double agent. However, as she gets closer to the musician, she begins to slowly loses suspicions. Can she complete the mission before she falls in love?