活在現代的卡倫林區 透過革命性的科技解開了基因記憶，讓他經歷了 15 世紀祖先阿基拉在西班牙的冒險，而意外發現自己原來是神祕的「刺客」秘密組織的後代，在獲取驚人知識和技能之後，林區決定起身對抗專制壓迫的現代聖殿騎士們。 死囚開啟基因記憶 親歷過去回歸刺客 罪犯卡倫林區因犯下殺人罪，本已被執行死刑，但醒來後發現自己身在西班牙的阿布斯特戈工業（Abstergo Industries），映入眼簾的是蘇菲亞瑞金，她跟父親亞倫瑞金 正在主導一連串實驗，企圖透過科技增強人類能力，而林區正是他們的「病人」之一。不明就裡的林區被強迫接上「記憶回溯機」（Animus），這台機器可以利用高智慧科技讓使用者開啟基因記憶，重新經驗祖先的故事，林區因此回到15世紀的西班牙宗教裁判所，親歷祖先的記憶，也在此時發現自己的祖先阿基拉（Aguilar）原來是名刺客，一邊與聖殿騎士們對抗，一邊尋找非常重要的神器。林區親歷阿基拉的過去後，受到了影響，他決定利用獲取的知識和技能，起身對抗現代的聖殿騎士們，掀起一場革命風暴……。