Kobayashi, jeune collégien, se réveille dans sa classe à côté du cadavre démembré de son professeur principal. Il est le premier suspect dans l'enquête menée par le commissaire Keisuke Kagami, du département central de police de Shinjuku, et Kogorô Akechi, jeune détective de génie de 17 ans, agréé par l'Agence impériale. Kobayashi ne va pas tarder à demander au dit Akechi d'être son assistant. Ce dernier va lui imposer une condition : prouver son innocence en trouvant le coupable.

Vyom, the school principal's a nerdy teenager son is disliked by most of his classmates, has only four friends, and a crush, Tara. When Tara goes missing and found dead, Vyom decides to solve the mystery behind her death.