현대 과학이 집결된 최첨단의 도시 맨하탄. 이 화려한 도시의 한쪽에는 한때는 누군가의 상상이었으며, 이제는 사람들의 손가락질을 받는 어느덧 환상 속의 신화가 되어버린 위대한 마법사 ‘발타자 블레이크(니콜라스 케이지 분)’가 살고 있다. 물론 그의 본업은 사악한 어둠의 마법사 ‘맥심 호르바스(알프레드 몰리나 분)’로부터 도시를 지키는 것. 전세계 어둠의 세력을 모으는 맥심을 물리치기 위해 발타자 역시 평범해 보이지만 엄청난 마법의 잠재력을 지닌 데이브(제이 바루첼 분)를 과감히 제자로 거둔다. 자신의 의지와는 상관없이 인류의 운명을 책임지는 임무를 맡게 된 데이브. 그러나 목숨이 왔다갔다하는 마법 훈련만으로도 모자랐는지 스승인 발타자는 사상 최악 어둠의 마법사 맥심과 지상 최대의 마법 전쟁을 시작한다. 다소 엉뚱하지만 분명 위대한 마법사 발타자와 더 없이 사악한 어둠의 마법사 맥심. 그들의 불꽃튀는 대결 속에서 마법사의 제자로 다시 태어난 데이브는 도시와 인류를 구원할 수 있을 것인가? 아니! 도시와 인류보다 자신의 목숨을 구할 수 있을 것인가?!

Every hundred years, the evil sorceress Morgana returns to claim Fingall's talisman from Merlin, with which she intends to destroy the world. For the last fourteen hundred years she has failed... now she intends to conquer all. Young Ben Clark moves with his parents to a new town, where he befriends his elderly magician neighbor, Milner. Ben has a natural talent for magic and wants to learn all that he can from this old man. Ben carries the same scar as the original staff-bearer 1,400 years before. Both Morgana and Milner, who is revealed to be Merlin, see this as a sign that this time, the battle between good and evil will be stronger and harder than ever. Ben must make his own choice between good and evil as he is drawn into a battle and must draw on his own spirit and magic to decide which path to follow and hence, the fate of the world as we know it.