Als Sasahara Kanji und Kasukabe Saki auf die Uni wechseln, stehen beide vor einem Dilemma. Sasahara überlegt, ob er endlich seinen lang gehegten heimlichen Traum wahr machen und einem Animeclub beitreten soll. Gleiches hat Sakis gut aussehender, aber leider völlig weltfremder Freund Kôsaka vor – sehr zum Ärger von Saki, die jegliche Beschäftigung mit Otaku-Themen als kindisch ablehnt. Sie scheitert allerdings kläglich, ihren Freund umzustimmen und so werden beide Jungen Mitglieder bei Genshiken, der „Gesellschaft zum Studium moderner visueller Kultur“, wie sich das außerschulische Sammelbecken aller Otakus vollmundig nennt.

Mitgehangen – mitgefangen! Von nun an sieht sich die hübsche Saki mit unablässigen Mangazitaten, Videogames und für sie unverständlichen Fanaktivitäten konfrontiert. Ob ihre junge Liebe diese harte Probe überstehen wird ...?

A mockumentary featuring an animated tale of an average person who slowly becomes an otaku (obsessive fanatic) and eventually becomes the "Otaking"! Between story segments, live action interviews with fictional die-hard otakus take place.

Doujin Work erzählt über das Leben von Najima Osana und ihrem Eintritt in die Welt der Doujins. Nachdem sie bei einer Convention sieht, wie viel Geld eine ihrer Freundinnen damit verdient, beschließt sie ebenfalls Doujins zu zeichnen, muss jedoch schnell herausfinden, dass diese Welt alles andere als einfach ist. Mit der Zeit findet sie immer mehr Freunde, die ihr helfen sich in diese Subkultur einzuleben, was für Najima nicht ohne das Überwinden von vielen Peinlichkeiten möglich ist.