Edward Elric et son frère Alphonse Elric sont de jeunes Alchimistes. En tentant de ramener leur mère à la vie, ils ont payé un lourd tribut, et ils tentent désormais de récupérer ce qu'ils ont perdu. Pour cela, Edward est devenu Alchimiste d'État : le Fullmetal Alchemist.
Mais au cours de leurs recherches, bien des épreuves attendent les deux frères et des êtres étranges : les Homonculus, les poursuivent.
L'histoire se déroule dans un monde où certaines personnes ont le pouvoir de transformer des objets en d'autres objets : on les appelle les alchimistes. Cette transformation doit obéir à une certaine règle : l'objet transformé et l'objet issu de la transformation doivent être d'une masse équivalente. Edward Elric est, malgré son jeune âge, un fameux alchimiste qui a perdu son petit frère, Alphonse, lors d'une expérience de transmutation interdite. Il a cependant réussi à sceller l'âme de celui‑ci dans une grande armure en fer. L'aventure des deux frères commence quand ils décident de partir à la recherche d'un objet aux mystérieux pouvoirs, capable de les aider à retrouver leurs corps initiaux : la très convoitée pierre philosophale.
À New York, un jeune traqueur gagne sa vie en vendant à des sorciers de rares objets mystiques. Mais le marché de la magie n'est pas sans risque.
Il s'agit de l'adaptation en anime du jeu vidéo Ryza no Atelier : Tokoyami no Joô to Himitsu no Kakurega. L'histoire de cet anime se focalise en partie sur celle du jeu et aborde les prémices des aventures de Ryza, Lent et Tao.
Reisalin Stout, communément appelée Ryza par ses amis intimes, est une adolescente particulièrement joviale et pétillante qui vit sur l'île de Kurken avec ses amis, Tao et Lent. Avec ces derniers, Ryza a déjà fait les quatre cent coups mais, aujourd'hui, le trio infernal ne veut plus se contenter d'arpenter les sentiers de l'île Kurken. En effet, Ryza, Tao et Lent ont pour ambition de parcourir le monde et devenir des explorateurs aguerris.