Enquanto invadem o ambiente hostil da Central da TCRI, as tartarugas descobrem a verdadeira intenção dos Kraang e decidem impedir a invasão dos aliens de uma vez por todas.
Um coelho adolescente que anseia tornar-se samurai une forças com os seus novos amigos guerreiros para proteger a sua cidade de monstros Yokai, ninjas e ETs malignos.
Cecily Cambell é a chefe da família Cambell e integrante da Brigada de Autodefesa, responsável por proteger a Cidade de Comércio Independente de Housman. Quando a espada de Cecily quebra em uma batalha com um ex-cavaleiro, ela começa a procurar um ferreiro que possa consertá-la. Infelizmente, a única pessoa capaz de fazer isso é Luke Ainsworth que também foi quem salvou sua vida nessa batalha. No entanto, antes de conseguir iniciar seu serviço, Luke tem que salvar Cecily outra vez quando uma caravana é atacada por monstros.
In an era where aliens have invaded and taken over feudal Tokyo, an unemployed samurai finds work however he can.