ในโลกของมาโดกะนั้นมีสิ่งมีชีวิตลึกลับที่สามารถทำให้ความปรารถนาของเด็กสาวที่ถูกเลือกเป็นจริงขึ้นมาได้ อย่างไรก็ตามเด็กคนนั้นจะต้องกลายมาเป็นสาวน้อยเวทมนตร์ และใช้เวทมนตร์ต่อสู้กับแม่มด สัตว์ประหลาดชั่วร้ายที่เกิดมาจากคำสาปซึ่งทำให้เกิดการฆาตกรรมและการฆ่าตัวตายปริศนา นักเรียนปึสองคานาเมะ มาโดกะ และ เพื่อนของเธอ มิกิ ซายากะ ได้พบกับคิวเบย์ สิ่งมีชีวิตปริศนาและสาวน้อยเวทมนตร์ โทโมเอะ มามิ โดยทั้งสองได้เสนอให้มาโดกะมาเป็นสาวน้อยเวทมนตร์ โดยที่อีกสาวน้อยเวทมนตร์ชื่อ อาเคมิ โฮมูระ พยายามที่จะกีดกันมาโดกะจากการทำสัญญาโดยไม่นานมาโดกะจะได้รู้ว่าการเป็นสาวน้อยเวทมนตร์นั้นมีอะไรมากกว่าที่เห็น

How does the world look in your eyes? Papika and Cocona, the heroines of the story, hold the keys to open the door. When the two girls meet, their adventures in a different time and different overlapping dimension called "Pure Illusion" begin. Many things in Pure Illusion will stand in the girls' way on their search for the mysterious crystal called the "Shard of Mimi," an item that is said to grant any wish. However, when the girls find themselves in danger, the Shard of Mimi shines, and they are able to transform.

ยูกิยูนะ ชั้นม.2 โรงเรียนซันชู เป็นคนร่าเริงแจ่มใสและมุ่งมั่น เด็กหญิงคนนี้เธอเป็นคนธรรมดาอยู่ในชมรมที่ลงมือช่วยผู้คนอย่างองอาจ คือ "ชมรมผู้กล้า" รุ่นพี่ที่อยู่ ม.3 ชื่ออินุโบซากิ ได้ให้ประเด็นสำคัญของชมรมผู้กล้าแห่งนี้ เป็นชมรมที่คอยให้ความช่วยเหลือทุกคนไปทั่ว อย่างการตามหาเจ้าของแมว หรือ การช่วยงานที่สถานรับเลี้ยงเด็ก แต่กลับไม่มีใครรู้เลยว่าพวกเธอเหล่าชมรมผู้กล้านั้นมีการปฏิบัติภารกิจกันจริงๆ นั่นคือการต่อสู้กับศัตรูของมนุษชาติ "เวอร์เทคซ์" ในอีกมิตินึง "เขตแดนแห่งพงไพร" ที่ผู้คนธรรมดาไม่อาจล่วงรู้ได้ ทั้งๆที่น่าจะเป็นเหล่าผู้กล้าที่ถูกเลือกมา ให้เข้าไปสู่ "เขตแดนแห่งพงไพร" เพื่อต่อสู้กับศัตรูที่คิดจะรุกรานมนุษยชาติให้สูญสิ้นแท้ๆ แต่พักนี้ "เขตแดนแห่งพงไพร" มีท่าทางแปลกๆไป ผู้กล้ากับเวอร์เทคซ์ ที่มาเจอกันได้แค่ใน "เขตแดนแห่งพงไพร" เท่านั้น ตัวตนที่ผิดแปลกไปที่จริงแล้ว คือใครกันแน่ ?