Après avoir été accidentellement exposé a un produit mutagène, quatre tortues sont recueillies par un rat nommé Splinter qui les élève comme ses propres enfants et leur apprend l’usage des arts martiaux. Le jour de leur 15ème anniversaire, les Tortues Ninja sont autorisés à sortir pour la 1re fois des égouts où elles ont été élevées et peuvent enfin visiter les rues de New York ! Mais la grosse pomme réserve quelques surprises à nos quatre intrépides, les ennuis ne font que commencer !

Les Tortues Ninja sont quatre petites tortues qui deviennent humanoïdes, à la suite d'un contact avec une étrange substance chimique rose, le mutagène. Splinter, un maître en arts martiaux transformé en rat à la suite d'une mutation similaire, va les accueillir dans les égouts de la ville de New York et leur enseigner le Ninjutsu, l'art des ninjas. Ils vont ensuite faire la rencontre d'une journaliste nommée April O'Neil, qui va les aider à lutter contre la bande de Shredder, un méchant qui se cache derrière un masque de fer.

4 tortues ayant subit une mutation génétique apprennent les arts martiaux. Elles se battent dans l'ombre pour défendre les rues de New-York et vaincre un ennemi puissant, le Shredder. Dans leurs combats, elles seront parfois aidés par une scientifique devenue antiquaire, April O'Neil, et un justicier masqué un peu maladroit, Casey Jones

The Turtles — Leo, Raph, Donnie and Mikey — each will go it alone for the first time. Faced with new threats and teaming up with old allies, the Turtles will discover who they really are when they don’t have their brothers at their sides.