劇情描述伊森韓特 在逮捕無政府恐怖組織「辛迪加」的領導人連恩後，接下新任務是阻止餘黨、以約翰拉克為首的12個「使徒」的瘋狂計畫，伊森韓特得早一步比「使徒」先拿到鈽元素，避免讓「使徒」在72小時內製造出核彈攻擊主要城市。然而，伊森韓特這項搶走鈽元素的任務執行失敗，他必須接受中情局的監督，讓中情局特務沃克 進入IMF團隊，並且借助盟友伊爾莎 的消息，合力再找回鈽元素。