少年战斗着——「为寻求正确的死亡」。辛酸·后悔·耻辱人类产生的负面情感，化为诅咒，潜入日常生活诅咒是蔓延于世界的祸源，最糟糕的情况下，会让人类踏入死亡，并且诅咒只能以诅咒祓除。虎杖悠仁是一位体育万能的高中生，某天他为了从“咒物”危机中解救学姐，而吞下了被诅咒的手指“两面宿傩之指”，让“宿傩”这种诅咒跟自己合而为一。在最强咒术师五条悟的指引下，进入对诅咒专门机关「东京都立咒术高等专门学校」，并遇到了伏黑惠与钉崎野蔷薇这两位同学。某日，突然出现“特级咒物”，他们三人就奉命到现场支援。为了实现爷爷要他“助人”的遗言，虎杖将会继续与“诅咒”奋斗下去。为了祓除诅咒而成为诅咒的少年，无法回头的壮阔故事开始了——

故事讲述的是从东京都西部被分割出来的这座都市中，“超能力开发”被列为学校课程的一部分（学生作为人体科学实验对象）。在二百三十万人口中，有八成都是学生，所以被称为学园都市。他们每天都在超能力开发上进行相互竞争。根据能力高低不同，可以分为7级，从无能力（level 0）到超能力（level 5）（level 6为绝对能力者）。故事的主角上条当麻是学园里的一个无能力者，但并非完全没有能力，他的能力是能够将一切异能之力无效化。他只有右手能够使用这种能力，还给自己的这种连上帝的奇迹都能抹杀的能力取名为幻想杀手（Imagine-breaker）。而正因为他的右手似乎把神的祝福都给抹杀掉的缘故，导致自己一直过著不幸的生活。某一个暑假的日子，在家里的阳台上，他遇见了一位修女；这位少女自称自己的名字叫“茵蒂克丝”（Index），并是从魔法的世界逃了出来，现在正在被魔法师追赶中。就这样，上条当麻一脚踏进了奇妙而美丽又黑暗的世界，开始了上条当麻与御坂美琴的战斗……掌握了十万三千本究极魔法书（魔导书）的少女与拥有抹杀一切奇迹的神上之手的少年，将面临一系列故事……

　　统领日本阴阳师的顶点家族皇一族与暗杀集团樱冢护恩怨纠葛，世仇绵延。皇一族少主昂流是一个心地极为善良的俊美少年，他和双胞胎姐姐北都共同居住在大都市东京。姐弟俩互相爱护，共同打拼，昂流运用自己的灵能力为困扰之人排忧解难。在此期间，他们结识了爽朗帅气的男人樱冢星史郎，这个带有神秘气质的男人轻而易举走进姐弟俩的生活。在相处的一年时间里，昂流对星史郎万分依赖，北都却对这个似乎隐藏着无限秘密的男人产生忧虑。

　　原来星史郎正是皇一族仇敌樱冢护的掌门人，当年他在樱花树上杀人的情景被恰巧在此的昂流撞见。因结界而无法施以毒手的星史郎抹去昂流的记忆，并在男孩身上留下樱冢护的标记，约定当两人再次见面时会相处一年，如果一年之内昂流无法改变他，星史郎就会杀掉昂流。一年期满，他们各自的命运将会如何？