當雌雄企鵝戀愛過後，企鵝媽媽孕育並誕下小企鵝蛋。為了讓小企鵝有足夠的食糧，企鵝媽媽將企鵝蛋交託企鵝爸爸保護，自己則要在四十天沒有進食的情況下，在冰雪中橫越200公里，遠赴他方覓食。覓食的過程中，不但路途遙遠，而且經常被海豹襲擊。另一邊廂，企鵝爸爸為了保護小企鵝蛋，與它形影不離，四個月內不能出外覓食。小企鵝孵出後48小時是關鍵時間，全靠企鵝爸爸的儲糧才能維持生命。經過多個月的覓食，企鵝媽媽終於安全回來與家人團聚，接著與爸爸的身分調換，媽媽來照顧孩子、爸爸則出外覓食，他們會輪流工作，直到小企鵝長大後，一群皇帝企鵝又再次長征，返回家園，待下一年繼續另一個新的旅程…