Batman se joint à James Gordon et au nouveau procureur de Gotham, Harvey Dent, afin de contrecarrer un voleur de banque aliéné connu sous le nom du Joker. Ce dernier déchaîne le chaos dans les rues et inscrit l'élimination de Batman à son ordre du jour personnel.

Orphelin, Peter est un petit garçon espiègle et turbulent, qui refuse de grandir. Un jour, il est envoyé par magie au Pays imaginaire, peuplé de pirates et de fées. Cette terre de contes est sous la coupe du tyrannique Barbe-Noire. Peter finit par tomber dans les griffes du redoutable flibustier. Celui-ci lui raconte une prophétie : un petit garçon qui sait voler viendra le détrôner. Peter semble être l'élu car il se découvre ce don.

Dans un laboratoire de campagne isolé, à l’abri des regards, une équipe de scientifiques tissée serrée a mis au point en secret la troisième génération d’un prototype de vie synthétique. Ni mâle, ni femelle, l’androïde Morgan, une créature technologique de cinq ans, est élevé directement par ses concepteurs et évolue sous étroite surveillance à l’intérieur d’une cellule de verre. Lorsque Morgan manifeste un comportement violent et imprévisible au cours d’un examen, Lee Weathers, consultante à la gestion du risque pour une grande entreprise, est appelée en renfort. Son travail : évaluer la dangerosité de l’androïde pour ensuite soumettre ses recommandations à ses supérieurs.