Kontynuacja losów Jasona Bourne'a - byłego tajnego agenta CIA. Okazuje się, że program Treadstone został zmodyfikowany i przemianowany na Black Briar, podlegający amerykańskiemu Ministerstwu Obrony. Agencja odcięła się od swojej niechlubnej przeszłości, jednak wciąż obawia się zagrożenia ze strony Bourne'a, postanawia więc go zlikwidować. Tymczasem Bourne'a prześladują niejasne wspomnienia z jego przeszłości sprzed zaniku pamięci. Ucieczka przed poprzednim życiem okazuje się być niemożliwa, dlatego Bourne postanawia wrócić do początku i dowiedzieć, kto i po co go stworzył. Podróżując przez Moskwę, Berlin, Londyn, Madryt, dotrze w końcu tam, gdzie wszystko się zaczęło i musi się skończyć - do Nowego Jorku.

W roku 2002 widzowie w kinach na całym świecie poznali Jasona Bourne'a - bohatera sfilmowanego bestsellera Roberta Ludluma "Tożsamość Bourne'a". Teraz Jason Bourne powraca w drugiej części - "Krucjata Bourne'a". Dwa lata temu Bourne'owi wydawało się, że zdołał uciec przed przeszłością. Wraz z Marią przenosili się z miasta do miasta, ścigani urywkami wspomnień, których nie rozumieli. Uciekali przed nocnymi koszmarami, których znaczenia nie znali. Przypadkowe spojrzenie nieznajomego, pomyłkowy telefon - w każdej sekundzie, bez ostrzeżenia przeszłość mogła wrócić. I ta przeszłość powróciła. Ale... Bourne został wyszkolony na zawodowego zabójcę. Ci, którzy go ścigali, powinni byli zostawić go w spokoju. Przekonają się o tym.

Former Navy SEAL and prisoner of war, Paul Janson, works as a corporate security consultant, but when an assignment to rescue a VIP goes wrong, he's forced to go on the run.