Pełnometrażowy film o przygodach nastoletniej Twilight, to kontynuacja znanej serii My Little Pony. Królestwo kucyków zostało pozbawione korony, Twilight wyrusza więc na jej poszukiwania. Przechodzi na drugą stronę lustra, gdzie trafia do świata ludzi. Tam poznaje piątkę sympatycznych dziewczyn, które do złudzenia przypominają jej przyjaciółki z Equestrii.

Liceum Canterlot staje się gospodarzem ważnego muzycznego wydarzenia, na którym ma zagrać zespół The Rainbooms, składających się z pięciu nastoletnich dziewczyn – Rainbow Dash, Applejack, Pinkie Pie, Rarity i Fluttershy. Do szkoły przyjeżdża również inny zespół – The Dazzlings, który składa się z trzech dziewczyn (Adagio Dazzle, Aria Blaze i Sonata Dusk), a także przekonują wszystkich, aby zamienić przyjazny koncert w pojedynek zespołów. The Rainbooms z pomocą Sunset Shimmer postanawiają wysłać wiadomość do Twilight Sparkle z równoległego świata, aby pomogła im w rzuceniu muzycznego kontrzaklęcia i w wygraniu pojedynku oraz pokonać zespół Adagio Dazzle, które wykraczają poza zdobycie tytułu najlepszego zespołu w liceum Canterlot.

W liceum Canterlot zostają zorganizowane Igrzyska Przyjaźni, zawody sportowe o bardzo długiej tradycji. Rainbow Dash, Applejack, Pinkie Pie, Rarity i Fluttershy postanawiają wziąć udział w zawodach i powalczyć o pierwsze miejsce w różnych dyscyplinach z rywalkami z Akademii Crystal Prep. W przeciwnej drużynie znajduje się dziewczyna, która przypomina… Twilight Sparkle. Sunset Shimmer musi utrzymać w tajemnicy przed drużyną o kontrolowanie magii, ponieważ wicedyrektorka Luna nie chce, aby uczennice z liceum Canterlot zostały posądzone o nieuczciwą grę.

Po dramatycznych wydarzeniach na Igrzyskach Przyjaźni, uczniowie Canterlot wybierają się na spokojny, wypoczynkowy obóz Everfree. Equestria Girls są bardzo podekscytowane. Jedynie Twilight Sparkle czuje niepokój spotęgowany koszmarnymi snami o tajemniczej Midnight Sparkle. Jednocześnie zaczynają się w niej budzić magiczne moce. Sunset uważa, że to wspaniałe, jednak Twilight obawia się, że ma to coś wspólnego z Midnight Sparkle i prosi Sunset, aby nikomu nie zdradzała jej sekretu. Obozowicze poznają legendę Everfree - historię o duchu natury, Gaji Everfree, która utrudnia życie ludzi wkraczających na teren jej lasu. W obozie zaczynają dziać się dziwne rzeczy. Twilight jest przekonana, że to jej wina, choć wszyscy obozowicze uważają, że to sprawka ducha natury.

The story follows Sunset Shimmer, who (using her powers) finds out that her friends' memories of her have been mysteriously erased, resulting in them getting amnesia. Determined to set things straight, she'll need Princess Twilight's help from Equestria in order to find out the source of what caused her friends' memory loss.

Rarity's friendship with Applejack is tested when Vignette Valencia hires her as her new designer for a theme park parade.

The Equestria Girls spend their spring break on a yacht. It's Spring Break and the Mane 7 are about to board the most glorious yacht ever for a relaxing cruise. But Rainbow Dash is convinced that Equestrian Magic is on the loose and won't let anyone rest until she finds it.

The Starswirled Music Festival is finally here, and the Mane 7 are going to get their 'glamping' on! Sunset and Pinkie are the most excited to see their favorite band perform but when Equestrian Magic causes a 'Groundhog Day' inspired time loop to start, Sunset gets stuck reliving 'Festival Day 1' forever!

My Little Pony Equestria Girls: Holidays Unwrapped is a Christmas-themed Equestria Girls special. It is the last piece of Equestria Girls content produced by DHX Media. Unlike previous specials, it is a compilation of six seven-minute shorts instead of a single hour-long story.