Gli Atreides e il loro controllo dell'Universo tramite la spezia si trovano ancora una volta minacciati da un complesso schema di intrighi che comprende le Bene Gesserit, la Gilda Spaziale, i Tleilaxu, la Casa Corrino e un gruppo di Fremen ribelli. Un primo risultato del complotto è un attentato durante il quale Paul perde l'uso degli occhi, anche se non della vista: grazie alla prescienza, è ancora in grado di vedere seguendo la via descritta dalle sue visioni.

La conclusione della miniserie segna il definitivo crollo di Alia, completamente sola in balia di forze interne ed esterne che finiscono per stritolarla: la nascente guerra civile, gli attacchi dei Fremen ribelli, la personalità del Barone Harkonnen e, infine, la crescente distanza dall'amato Duncan e la neutralità del Naib dei Fremen, Stilgar.