Alyson, étudiante en médecine, découvre son lieu de travail, un hôpital public de périphérie, en compagnie des deux autres internes affectés au service, Hugo et Chloé. Tous les titulaires sont confinés chez eux à la suite de mesures sanitaires. En leur absence, ils doivent s'occuper seuls des malades...

La mise à l'écart des médecins a été prolongée jusqu'à nouvel ordre, un agent pathogène non identifié ayant été détecté au cours de l'autopsie du patient décédé. Arben Bascha est aussitôt détaché de son service pour rejoindre les maigres effectifs de médecine interne, gagnés par la fatigue et la panique...

Wagner décide de transférer quatre de ses patients admis dans le service de réanimation dans le secteur 1 de la médecine interne. Chloé et le docteur Bascha, qui tentaient justement de réduire le nombre de patients dans ce service, sont furieux. Hugo brigue le poste d'économe de l'internat...

Toujours retenu en quarantaine, le docteur Simoni reproche vertement à Chloé d'avoir accepté de traiter les patients de Wagner. Débordée, celle-ci ne ménage pas sa peine malgré sa récente opération du coeur. Son surmenage pourrait mettre sa vie en danger...

L'équipe est sous le choc après la mort de la jeune Marion. La directrice va devoir répondre aux questions de la hiérarchie comme des parents, qui réclament une autopsie. Deux médecins sont arrivés pour renforcer l'équipe. Chloé exerce toujours, en dépit de l'arrêt maladie prescrit par son cardiologue...

Chloé, éprouvée physiquement, ne parvient pas à dire la vérité à Wagner sur sa situation. Il ne reste qu'un médecin pour soutenir l'équipe. Arben est à nouveau réquisitionné. L'autopsie de Marion suscite des inquiétudes. Hugo prend en charge une femme victime d'un accident, que seule la musique apaise...

Le professeur Wagner prend en charge Chloé, victime d'un malaise. Alyson et Hugo font plusieurs découvertes importantes à son domicile tandis qu'Arben culpabilise de n'avoir rien vu. Choquée, Alyson s'interroge sur ses qualités de médecin. En néonat, Hugo s'inquiète du sort du prématuré, né d'un déni de grossesse.

A son réveil, le comportement de Chloé déstabilise son entourage, et en particulier Simoni. La directrice annonce à l'ensemble du personnel que chacun va être auditionné par la direction juridique. Alyson, Hugo et Arben se retrouvent au pied du mur.

C’est l’hiver, les hôpitaux sont submergés. A l’hôpital Poincaré, une canalisation a sauté, inondant le service des Urgences qui doit se replier en médecine interne. Alyson et Hugo poursuivent leur stage dans le service. Chloé fait tout pour revenir pratiquer malgré une santé fragile. Personne n’a de nouvelles d’Arben, disparu sans laisser un mot. Ils doivent affronter un hôpital en crise, sous l’autorité du docteur Olivier Brun, le charismatique chef du service des Urgences.

Les patients intoxiqués au monoxyde de carbone sont admis aux Urgences, triés et soignés. Arrivé avec ces derniers en tant que secouriste, Arben évite soigneusement ses anciens collègues. Alyson se bat pour que son patient puisse aller en caisson hyperbare, alors qu’Hugo y est envoyé par Brun et Wagner pour superviser la réoxygénation des malades.

Arben parvient à garder son secret quand il se retrouve face à ses anciens collègues. A cause de l'incident survenu au caisson hyperbare, Hugo est affecté au bureau d’accueil des patients. Alyson se révèle dans ses nouvelles missions aux Urgences. Chloé, toujours en difficulté, échoue à diagnostiquer une rougeole.

La découverte d'une patiente inanimée choque toute l'équipe et déclenche une enquête interne. A cette occasion, le docteur Brun découvre à quel point la gestion des patients est chaotique. Arben soigne clandestinement un patient, avec la complicité de Chloé.

Hugo découvre que madame Marciano était la patiente d'Igor et doit en informer Olivier Brun. Il commence à s'inquiéter pour son ami qui montre des signes de surcharge mentale. Chloé est troublée par un de ses nouveaux patients, Joachim Prigent, qui se montre ambigu avec elle. Brun propose à Arben de travailler aux urgences en renfort...

Suite à l’incident survenu avec Mme Marciano, Brun réorganise le fonctionnement des Urgences. Igor essaie de faire bonne figure mais il montre des signes d’épuisement. Hugo est une nouvelle fois en conflit avec sa mère qui lui refuse un anti-douleur pour un patient en grande détresse. Nathalie découvre qu’Arben est revenu et lui demande de partir.

Alyson surprend Arben et Nathalie en pleine discussion et pense avoir compris les raisons de son départ. Hugo est de plus en plus inquiet pour Igor qui n'est pas venu travailler. Alyson, soutenue par Brun, prend une décision radicale pour son orientation. Chloé est menacée de reclassement mais la jeune femme fait face...

Hugo trouve Igor, inanimé, dans le caisson hyperbare. S'agit-il d'un accident ou d'une tentative de suicide ? L’hôpital est sous le choc.