Il dottor Hell questa volta e' deciso a giocare tutte per tutto pur di conquistare il mondo: sferra un attacco al Giappone, diretto dal fido Barone Ashura, utilizzando tutti i mostri meccanici di cui dispone. Ma l'umanità ha a sua difesa non solo Mazinga Z e Afrodite A, ma anche il Grande Mazinga, che interviene a combattere le truppe di Ashura. Tuttavia, anche i più forti degli eroi possono trovarsi in svantaggio di fronte ad un numero tanto preponderante di avversari...

Mazinkaiser, il prezioso dono lasciato dal professor Juzo Kabuto, e' un'aiuto determinante per l'Istituto di Ricerca nella sua battaglia contro il dottor Hell. Tuttavia pilotare il gigante meccanico non e' una cosa semplice, tanto che, di fronte ad un nuovo attacco dei mostri meccanici, il dottor Yumi si trova costretto a mandare in azione solo Afrodite e il Grande Mazinga, quest'ultimo non ancora completamente riparato dopo gli ingenti danni della precedente battaglia...

Di fronte all'ira sempre piu' feroce del dottor Hell, Ashura si trova costretto a mettere in campo la sua arma piu' cara: le sue preziose "figlie", tre bellissime androide denominate Gamia. Le tre vengono inviate ad eliminare Koji Kabuto e, quando trovano sulla loro strada qualcuno che si presenta con questo nome, non esitanto ad assalirlo; pero' non e' detto che chiunque si faccia chiamare Koji Kabuto sia necessariamente il pilota di Mazinkaiser...

I nostri amici finalmente possono concedersi un po' di riposo e passare una giornata al mare. La pace della comitiva viene pero' scossa... non dal dottor Hell, ma da un "piccolo" battibecco tra Koji e Sayaka. Quest'ultima, infuriata, si allontana dal gruppo assieme a Boss per una nuotata, ma non si immagina cosa l'attende al largo della baia...

E' il compleanno del professor Yumi, e tutto lo staff del laboratorio ha deciso di organizzare un grande festa a sorpresa per il professore, che e' oggi di ritorno da una lunga conferenza con il governo e l'esercito per definire i nuovi criteri di protezione del Giappone. Tuttavia questo e' anche il giorno in cui il barone Ashura ha deciso di mettersi in azione personalmente infiltrandosi nell'Istituto per distruggerlo...

Il dottor Hell si e' impossessato di armi incredibilmente piu' potenti dei mostri meccanici: i mostri guerrieri, lasciati dall'antico popolo dei Mikene. Nonostante cio', Mazinkaiser riesce ad abbattere il primo dei mostri guerrieri lanciati all'attacco della citta' con una facilita' inaudita. Ma l'assalto del mostro guerriero e la sua repentina sconfitta fanno in realta' parte di un complesso progetto del dottor Hell per distruggere l'Istituto e sancire la morte di Koji Kabuto... nel magma del monte Fuji!!

Koji affronta il dottor Hell e il suo ultimo mostro, nella sua isola. Ad aiutarlo nell'impresa, nuove armi a disposizione di Mazinkaiser, nonché la più forte di tutte, celata da sempre all'interno del robot. Questa potrà essere usata solo dal "vero pilota" di Mazinkaiser, colui che sarà in grado di rompere il sigillo...