Zehn Jahre nach der Rückkehr des Raumschiffs Voyager aus dem Delta-Quadranten steckt die Föderation in einer Krise. Die Hauptlieferanten der Föderation für Dilithiumkristalle (der Hauptkatalysator für den Treibstoff für Reisen mit Überlichtgeschwindigkeit) verschwinden. Raum und Zeit haben sich um mehrere Planeten gefaltet und sie so von äußerem Kontakt isoliert. Das Phänomen ist unnatürlich – jemand oder etwas verursacht es. Um dies zu stoppen, sind drastische Maßnahmen erforderlich, von denen einige außerhalb der normalen Zuständigkeit der Föderation liegen.