Une adolescente, Claire, est retrouvée, moribonde, près d'un étang en pleine forêt. Elle a été violée. Avant de décéder, elle a eu le temps de prononcer un prénom, Lola, qui, a priori, ne dit rien à personne. La région est sous le choc. C'est à la gendarmerie, où travaille le père de la victime, Moynet, que la consternation est la plus grande. L'arrivée de l'adjudant-chef Isabelle Florent, qui doit prendre les commandes de la brigade départementale, est loin de calmer les esprits. La jeune femme doit faire face à une équipe masculine aguerrie, qui n'entend pas se laisser marcher sur les pieds par une femme, aussi séduisante soit-elle. Mais, à vrai dire, les policiers ne sont pas les seuls à se méfier de l'adjudant-chef Florent...

Isabelle Florent est confrontée à un double problème : son fils est enfermé dans une cavité à l'intérieur d'une grotte classée, complètement détruite par une explosion d'origine criminelle. Son autonomie en oxygène est limitée, et Isabelle a très peu de temps pour le sortir de là...

Un jeune couple cherche la tranquillité dans un chemin forestier. C'est alors qu'ils aperçoivent deux motards habillés avec l'uniforme de la gendarmerie agresser un chauffeur routier et le battre à mort, avant de partir avec son chargement... L'image de la gendarmerie en prend un sérieux coup. La vue d'un képi sur la route ou d'un motard effraie la population au lieu de l'apaiser. D'autres affaires semblables se produisent, la pression s'amplifie, et Isabelle doit faire face à une psychose qui risque de monter au sein de l'opinion publique. Aussi met-elle en oeuvre toutes ses forces, aidée de Rivière, Roussillon et Cluzeau, pour rétablir la vérité sur cette affaire et démasquer les imposteurs mais aussi pour retrouver les agresseurs d'Antoine Lefèvre.

Les Trobert, exploitants agricoles, apprennent, par le biais d'une cassette vidéo envoyée par les ravisseurs, que leur fille, Marine, 20 ans, a été enlevée. Alertée par Madeleine Trobert, la mère de la jeune fille, l'adjudant-chef Isabelle Florent, à la tête d'un détachement de gendarmerie, s'installe dans la ferme des Trobert. Peu après, le ravisseur téléphone pour exiger une rançon. À la maison, le petit Nicolas est désabusé, vis-à-vis de son père qui ne viendra pas le voir en métropole. Et Roussillon va faire une balade à vélo dans les vignes avec Laurent Garnier, collègue et ami. À la suite d'une maladresse de Madeleine le ravisseur sait que la gendarmerie est sur le pied de guerre. Sur le chemin du retour, Garnier, missionné sur le dossier des voitures volées, remarque une Talbot dont l'immatriculation correspond à celle d'une voiture déclarée volée, justement. Il fait demi-tour pour s'en assurer. Alors qu'Isabelle enquête sur l'enlèvement de Marine, un homme amnésique déboule à la caserne dans un sale état. Il a dans sa main un papier où est inscrit : « Isabelle Florent. Gendarmerie ». C'est son unique moyen de découvrir qui il est. Et il compte beaucoup sur Isabelle pour l'aider. Dans le même temps, on découvre en rase campagne, le corps sans vie de Laurent Garnier, l'ami de Roussillon.

Isabelle Florent, contrainte de s'impliquer personnellement dans une enquête. Seule contre tous, parviendra-t-elle à innocenter une amie très chère, accusée du meurtre de son mari? Celui-ci, journaliste, enquêtait dans le milieu de la chasse.

Isabelle et le gendarme Cluzeau patrouillent à la recherche de braconniers lorsqu'ils sont témoins d'un feu de forêt. Ils alertent les pompiers et tentent de secourir trois jeunes filles prisent au piège des flammes. Mais l'une d'elles, Paula, périt devant Cluzeau.

Au petit matin, toute la brigade de gendarmerie d'Auxerre est déjà sur le qui-vive... On vient de leur signaler un cambriolage à la voiture bélier, à quelques kilomètres de là. Isabelle, Rivière, Roussillon et Cluzeau filent sur les lieux, en empruntant une vieille DS à un civil, parce que le portail est cadenassé et qu'ils ne veulent pas perdre de temps... Puis s'ensuit une véritable fusillade et ils parviennent à blesser l'un des malfrats qui s'enfuient... La fumée d'une bombe fumigène s'estompe et ils découvrent alors une jeune femme inconsciente...

Isabelle enquête sur le meurtre d'une jeune fille qui entretenait une relation avec son professeur. Il s'agit d'ailleurs du même enseignant auquel elle a toujours voué une très grande admiration. A la caserne, une nouvelle stagiaire du nom de Virginie fait son entrée.

Bernard Florent est venu passer quelques jours chez sa fille et son petit-fils. Pendant qu'Isabelle va présenter à la presse le radar de l'an 2000, Bernard et Nicolas vont pêcher. C'est lors d'une démonstration faite à la jeune Cécile, journaliste stagiaire (celle-ci est un peu déçue de faire un reportage aussi peu intéressant, mais reconnaît-elle : « C'est normal, je débute dans le métier »), qu'Isabelle et Rivière voient passer une BMW noire immatriculée dans le Bas-Rhin à 198 km/h. Cluzeau et un tout jeune motard sont placés un peu plus loin, en contact radio avec eux et ils sont chargés d'intercepter les chauffards éventuels pour leur rappeler les limites de vitesse, avec l'humour légendaire de Cluzeau, genre : « Question à 12 points : savez-vous à quelle vitesse vous rouliez ? »... Une sombre affaire, issue 20 ans plus tôt, du passé du père d'Isabelle, force celle-ci a parcourir la région et interroger divers intervenants, à la recherche de son père, enlevé, très brutalement. Pendant ce temps, son collègue et ami intime (Philippe Kremen) l'appuie, à partir des locaux de la brigade, puis, finalement, sur le terrain. Elle permet, tout en sauvant son père, à une mère de retrouver un fils qu'elle n'avait plus vu depuis si longtemps. Dix ans, peut-être? Quant au petit Nicolas, depuis la partie de pêche, il ne veut plus devenir gendarme. Il veut être marin !

L'enquête d'Isabelle Florent l'amène jusqu'en Guadeloupe où, elle enquête sur un trafic de bébés volés. Accompagnée de son fils Nicolas, elle retrouve son ex-compagnon, Hervé, le père de Nicolas.

Conduit à l'enterrement de sa mère un détenu réussit à s'enfuir. Ancien bûcheron, il s'enfonce dans une grande forêt qu'il connait bien, où un meurtre a été commis il y a 12 ans. En parallèle, Cluzeau enquête sur une bande de jeunes tagueurs.

C'est dans cet épisode qu'apparaît le capitaine Kremen.

Accusé de dénaturer sa production, un vieux vigneron prend en otage un inspecteur des fraudes avant de mettre fin à ses jours. Isabelle, en allant chercher Nicolas à une fête, croise une femme battue. L'affaire ce complique lorsque l'époux de celle-ci, l'inspecteur des fraudes, est retrouvé mort.

Christian et Nathalie Vincenti, des éducateurs, se consacrent à la réinsertion de jeunes délinquants, au château de Saint-Fargeau. Ces jeunes sont d'autant plus mal acceptés que des cambriolages ont été commis dans les environs.

Léa Perez, une jeune femme, est retrouvée morte dans un cabanon après y avoir passé la nuit avec le gendarme Cluzeau

Trois jeunes bien éméchés, sortant d'une boîte de nuit, roulent trop vite avec leur voiture et heurtent un autre véhicule qui part dans le décor. Isabelle découvre plus tard que la conductrice a été assassinée.

Tandis qu'elle enquête sur le kidnapping d’un nouveau-né, Isabelle est dérangée par un certain Magellan, un voyant qui lui propose ses services. Isabelle refuse mais quelques jours plus tard, Magellan retrouve l'enfant.

Une jeune britannique est retrouvée morte sur une voie ferrée. De toute évidence, elle a été jetée d’un train. Peut-être par un de ces hooligans qui sèment la pagaille sur les stades de la région.

Isabelle assiste au mariage de Michel Durieux (entrepreneur de travaux publics) avec Davia, une jeune roumaine qu'Isabelle avait aidée autrefois. Pendant le mariage, l'ex-mari de Davia vient la menacer.